Lineage for Species: Rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 713694Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (334 folds)
  3. 730177Fold d.96: T-fold [55619] (2 superfamilies)
    beta(2)-alpha(2)-beta(2); 2 layers: alpha/beta; antiparallel sheet 1234
    tunnel-shaped: its known members form wide oligomeric barrels different sizes
  4. 730178Superfamily d.96.1: Tetrahydrobiopterin biosynthesis enzymes-like [55620] (4 families) (S)
    bind purine or pterin in topologically similar sites between subunits
  5. 730179Family d.96.1.1: GTP cyclohydrolase I [55621] (1 protein)
  6. 730180Protein GTP cyclohydrolase I [55622] (4 species)
    beta-sheets of five subunits form a barrel, closed: n=20, S=20
  7. 730293Species Rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [69790] (3 PDB entries)

PDB entries in Species: Rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]:

  1. Domain(s) for 1is7:
    1. 730314Domain d1is7a_: 1is7 A: [66301]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    2. 730315Domain d1is7b_: 1is7 B: [66302]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    3. 730316Domain d1is7c_: 1is7 C: [66303]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    4. 730317Domain d1is7d_: 1is7 D: [66304]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    5. 730318Domain d1is7e_: 1is7 E: [66305]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    6. 730319Domain d1is7f_: 1is7 F: [66306]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    7. 730320Domain d1is7g_: 1is7 G: [66307]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    8. 730321Domain d1is7h_: 1is7 H: [66308]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    9. 730322Domain d1is7i_: 1is7 I: [66309]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
    10. 730323Domain d1is7j_: 1is7 J: [66310]
      Other proteins in same PDB: d1is7k_, d1is7l_, d1is7m_, d1is7n_, d1is7o_, d1is7p_, d1is7q_, d1is7r_, d1is7s_, d1is7t_
      complexed with k, phe
  2. Domain(s) for 1is8:
    1. 730294Domain d1is8a_: 1is8 A: [66321]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    2. 730295Domain d1is8b_: 1is8 B: [66322]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    3. 730296Domain d1is8c_: 1is8 C: [66323]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    4. 730297Domain d1is8d_: 1is8 D: [66324]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    5. 730298Domain d1is8e_: 1is8 E: [66325]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    6. 730299Domain d1is8f_: 1is8 F: [66326]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    7. 730300Domain d1is8g_: 1is8 G: [66327]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    8. 730301Domain d1is8h_: 1is8 H: [66328]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    9. 730302Domain d1is8i_: 1is8 I: [66329]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
    10. 730303Domain d1is8j_: 1is8 J: [66330]
      Other proteins in same PDB: d1is8k_, d1is8l_, d1is8m_, d1is8n_, d1is8o_, d1is8p_, d1is8q_, d1is8r_, d1is8s_, d1is8t_
      complexed with k, phe, zn
  3. Domain(s) for 1wpl:
    1. 730304Domain d1wpla_: 1wpl A: [109472]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    2. 730305Domain d1wplb_: 1wpl B: [109473]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    3. 730306Domain d1wplc_: 1wpl C: [109474]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    4. 730307Domain d1wpld_: 1wpl D: [109475]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    5. 730308Domain d1wple_: 1wpl E: [109476]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    6. 730309Domain d1wplf_: 1wpl F: [109477]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    7. 730310Domain d1wplg_: 1wpl G: [109478]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    8. 730311Domain d1wplh_: 1wpl H: [109479]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    9. 730312Domain d1wpli_: 1wpl I: [109480]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
    10. 730313Domain d1wplj_: 1wpl J: [109481]
      Other proteins in same PDB: d1wplk_, d1wpll_, d1wplm_, d1wpln_, d1wplo_, d1wplp_, d1wplq_, d1wplr_, d1wpls_, d1wplt_
      complexed with 3po, hbi, na, zn

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