SCOP 1.63: Species: Chlamydomonas reinhardtii

Lineage for Species: Chlamydomonas reinhardtii

Root: SCOP 1.63
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (224 folds)
Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (44 superfamilies)
alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
Superfamily d.58.9: RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain [54966] (1 family)
C-terminal domain is beta/alpha barrel
Family d.58.9.1: Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [54967] (1 protein)
Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [54968] (8 species)
Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] [69730] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Chlamydomonas reinhardtii:

Domain(s) for 1gk8:
1. Domain d1gk8a2: 1gk8 A:7-149 [65235]
  Other proteins in same PDB: d1gk8a1, d1gk8c1, d1gk8e1, d1gk8g1, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
2. Domain d1gk8c2: 1gk8 C:7-149 [65237]
  Other proteins in same PDB: d1gk8a1, d1gk8c1, d1gk8e1, d1gk8g1, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
3. Domain d1gk8e2: 1gk8 E:11-149 [65239]
  Other proteins in same PDB: d1gk8a1, d1gk8c1, d1gk8e1, d1gk8g1, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
4. Domain d1gk8g2: 1gk8 G:9-149 [65241]
  Other proteins in same PDB: d1gk8a1, d1gk8c1, d1gk8e1, d1gk8g1, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
  complexed with cap, egl, mg, mme

Domain(s) for 1ir2:

Domain d1ir2a2: 1ir2 A:8-149 [71303]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2b2: 1ir2 B:9-149 [71305]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2c2: 1ir2 C:10-149 [71307]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2d2: 1ir2 D:9-149 [71309]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2e2: 1ir2 E:11-149 [71311]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2f2: 1ir2 F:11-149 [71313]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2g2: 1ir2 G:10-149 [71315]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2h2: 1ir2 H:8-149 [71317]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2s2: 1ir2 S:11-149 [71327]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2t2: 1ir2 T:10-149 [71329]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2u2: 1ir2 U:7-149 [71331]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2v2: 1ir2 V:7-149 [71333]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2w2: 1ir2 W:10-149 [71335]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2x2: 1ir2 X:10-149 [71337]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2y2: 1ir2 Y:11-149 [71339]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1

Domain d1ir2z2: 1ir2 Z:10-149 [71341]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a1, d1ir2b1, d1ir2c1, d1ir2d1, d1ir2e1, d1ir2f1, d1ir2g1, d1ir2h1, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s1, d1ir2t1, d1ir2u1, d1ir2v1, d1ir2w1, d1ir2x1, d1ir2y1, d1ir2z1
complexed with cap, cry, hyp, kcx, mg, mme, smc

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Timeline for Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] from d.58.9.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase:

Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] from d.58.9.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase first appeared in SCOP 1.59
Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] from d.58.9.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase appears in SCOP 1.61
Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] from d.58.9.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase appears in SCOP 1.65
Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] from d.58.9.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase appears in the current release, SCOPe 2.08, called Species Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId:3055] from d.58.9.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase