Lineage for Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 235644Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (117 folds)
  3. 240584Fold c.14: ClpP/crotonase [52095] (1 superfamily)
    core: 4 turns of (beta-beta-alpha)n superhelix
  4. 240585Superfamily c.14.1: ClpP/crotonase [52096] (3 families) (S)
  5. 240603Family c.14.1.2: Tail specific protease, catalytic domain [52100] (3 proteins)
    includes N-terminal all-alpha subdomain
  6. 240613Protein Tricorn protease [69436] (1 species)
  7. 240614Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [69437] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum:

  1. Domain(s) for 1k32:
    1. 240615Domain d1k32a4: 1k32 A:680-762,A:854-1061 [68071]
      Other proteins in same PDB: d1k32a1, d1k32a2, d1k32a3, d1k32b1, d1k32b2, d1k32b3, d1k32c1, d1k32c2, d1k32c3, d1k32d1, d1k32d2, d1k32d3, d1k32e1, d1k32e2, d1k32e3, d1k32f1, d1k32f2, d1k32f3
    2. 240616Domain d1k32b4: 1k32 B:680-762,B:854-1061 [68075]
      Other proteins in same PDB: d1k32a1, d1k32a2, d1k32a3, d1k32b1, d1k32b2, d1k32b3, d1k32c1, d1k32c2, d1k32c3, d1k32d1, d1k32d2, d1k32d3, d1k32e1, d1k32e2, d1k32e3, d1k32f1, d1k32f2, d1k32f3
    3. 240617Domain d1k32c4: 1k32 C:680-762,C:854-1061 [68079]
      Other proteins in same PDB: d1k32a1, d1k32a2, d1k32a3, d1k32b1, d1k32b2, d1k32b3, d1k32c1, d1k32c2, d1k32c3, d1k32d1, d1k32d2, d1k32d3, d1k32e1, d1k32e2, d1k32e3, d1k32f1, d1k32f2, d1k32f3
    4. 240618Domain d1k32d4: 1k32 D:680-762,D:854-1061 [68083]
      Other proteins in same PDB: d1k32a1, d1k32a2, d1k32a3, d1k32b1, d1k32b2, d1k32b3, d1k32c1, d1k32c2, d1k32c3, d1k32d1, d1k32d2, d1k32d3, d1k32e1, d1k32e2, d1k32e3, d1k32f1, d1k32f2, d1k32f3
    5. 240619Domain d1k32e4: 1k32 E:680-762,E:854-1061 [68087]
      Other proteins in same PDB: d1k32a1, d1k32a2, d1k32a3, d1k32b1, d1k32b2, d1k32b3, d1k32c1, d1k32c2, d1k32c3, d1k32d1, d1k32d2, d1k32d3, d1k32e1, d1k32e2, d1k32e3, d1k32f1, d1k32f2, d1k32f3
    6. 240620Domain d1k32f4: 1k32 F:680-762,F:854-1061 [68091]
      Other proteins in same PDB: d1k32a1, d1k32a2, d1k32a3, d1k32b1, d1k32b2, d1k32b3, d1k32c1, d1k32c2, d1k32c3, d1k32d1, d1k32d2, d1k32d3, d1k32e1, d1k32e2, d1k32e3, d1k32f1, d1k32f2, d1k32f3
  2. Domain(s) for 1n6d:
    1. 240633Domain d1n6da4: 1n6d A:680-762,A:854-1061 [80128]
      Other proteins in same PDB: d1n6da1, d1n6da2, d1n6da3, d1n6db1, d1n6db2, d1n6db3, d1n6dc1, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dd1, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6de1, d1n6de2, d1n6de3, d1n6df1, d1n6df2, d1n6df3
    2. 240634Domain d1n6db4: 1n6d B:680-762,B:854-1061 [80132]
      Other proteins in same PDB: d1n6da1, d1n6da2, d1n6da3, d1n6db1, d1n6db2, d1n6db3, d1n6dc1, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dd1, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6de1, d1n6de2, d1n6de3, d1n6df1, d1n6df2, d1n6df3
    3. 240635Domain d1n6dc4: 1n6d C:680-762,C:854-1061 [80136]
      Other proteins in same PDB: d1n6da1, d1n6da2, d1n6da3, d1n6db1, d1n6db2, d1n6db3, d1n6dc1, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dd1, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6de1, d1n6de2, d1n6de3, d1n6df1, d1n6df2, d1n6df3
    4. 240636Domain d1n6dd4: 1n6d D:680-762,D:854-1061 [80140]
      Other proteins in same PDB: d1n6da1, d1n6da2, d1n6da3, d1n6db1, d1n6db2, d1n6db3, d1n6dc1, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dd1, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6de1, d1n6de2, d1n6de3, d1n6df1, d1n6df2, d1n6df3
    5. 240637Domain d1n6de4: 1n6d E:680-762,E:854-1061 [80144]
      Other proteins in same PDB: d1n6da1, d1n6da2, d1n6da3, d1n6db1, d1n6db2, d1n6db3, d1n6dc1, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dd1, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6de1, d1n6de2, d1n6de3, d1n6df1, d1n6df2, d1n6df3
    6. 240638Domain d1n6df4: 1n6d F:680-762,F:854-1061 [80148]
      Other proteins in same PDB: d1n6da1, d1n6da2, d1n6da3, d1n6db1, d1n6db2, d1n6db3, d1n6dc1, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dd1, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6de1, d1n6de2, d1n6de3, d1n6df1, d1n6df2, d1n6df3
      complexed with chm, d10
  3. Domain(s) for 1n6e:
    1. 240621Domain d1n6ea4: 1n6e A:680-762,A:854-1061 [80152]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea1, d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ec1, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ee1, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6eg1, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6ei1, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ek1, d1n6ek2, d1n6ek3
    2. 240622Domain d1n6ec4: 1n6e C:680-762,C:854-1061 [80156]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea1, d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ec1, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ee1, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6eg1, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6ei1, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ek1, d1n6ek2, d1n6ek3
    3. 240623Domain d1n6ee4: 1n6e E:680-762,E:854-1061 [80160]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea1, d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ec1, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ee1, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6eg1, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6ei1, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ek1, d1n6ek2, d1n6ek3
    4. 240624Domain d1n6eg4: 1n6e G:680-762,G:854-1061 [80164]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea1, d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ec1, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ee1, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6eg1, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6ei1, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ek1, d1n6ek2, d1n6ek3
    5. 240625Domain d1n6ei4: 1n6e I:680-762,I:854-1061 [80168]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea1, d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ec1, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ee1, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6eg1, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6ei1, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ek1, d1n6ek2, d1n6ek3
    6. 240626Domain d1n6ek4: 1n6e K:680-762,K:854-1061 [80172]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea1, d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ec1, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ee1, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6eg1, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6ei1, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ek1, d1n6ek2, d1n6ek3
      complexed with chm
  4. Domain(s) for 1n6f:
    1. 240627Domain d1n6fa4: 1n6f A:680-762,A:854-1061 [80176]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa1, d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fb1, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fc1, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fd1, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fe1, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6ff1, d1n6ff2, d1n6ff3
    2. 240628Domain d1n6fb4: 1n6f B:680-762,B:854-1061 [80180]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa1, d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fb1, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fc1, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fd1, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fe1, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6ff1, d1n6ff2, d1n6ff3
    3. 240629Domain d1n6fc4: 1n6f C:680-762,C:854-1061 [80184]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa1, d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fb1, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fc1, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fd1, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fe1, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6ff1, d1n6ff2, d1n6ff3
    4. 240630Domain d1n6fd4: 1n6f D:680-762,D:854-1061 [80188]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa1, d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fb1, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fc1, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fd1, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fe1, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6ff1, d1n6ff2, d1n6ff3
    5. 240631Domain d1n6fe4: 1n6f E:680-762,E:854-1061 [80192]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa1, d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fb1, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fc1, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fd1, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fe1, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6ff1, d1n6ff2, d1n6ff3
    6. 240632Domain d1n6ff4: 1n6f F:680-762,F:854-1061 [80196]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa1, d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fb1, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fc1, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fd1, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fe1, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6ff1, d1n6ff2, d1n6ff3
      complexed with dkt

More info for Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from c.14.1.2 Tricorn protease

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