SCOP 1.67: Species: Chlamydomonas reinhardtii

Lineage for Species: Chlamydomonas reinhardtii

Root: SCOP 1.67
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (130 folds)

Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (28 superfamilies)
contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites

Superfamily c.1.14: RuBisCo, C-terminal domain [51649] (1 family)
Family c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain [51650] (1 protein)
N-terminal domain is alpha+beta
Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [51651] (8 species)
Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] [69403] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Chlamydomonas reinhardtii:

Domain(s) for 1gk8:
1. Domain d1gk8a1: 1gk8 A:150-475 [65234]
  Other proteins in same PDB: d1gk8a2, d1gk8c2, d1gk8e2, d1gk8g2, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
2. Domain d1gk8c1: 1gk8 C:150-475 [65236]
  Other proteins in same PDB: d1gk8a2, d1gk8c2, d1gk8e2, d1gk8g2, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
3. Domain d1gk8e1: 1gk8 E:150-475 [65238]
  Other proteins in same PDB: d1gk8a2, d1gk8c2, d1gk8e2, d1gk8g2, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
4. Domain d1gk8g1: 1gk8 G:150-475 [65240]
  Other proteins in same PDB: d1gk8a2, d1gk8c2, d1gk8e2, d1gk8g2, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
  complexed with cap, egl, mg, mme

Domain(s) for 1ir2:

Domain d1ir2a1: 1ir2 A:150-475 [71302]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2b1: 1ir2 B:150-475 [71304]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2c1: 1ir2 C:150-475 [71306]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2d1: 1ir2 D:150-475 [71308]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2e1: 1ir2 E:150-475 [71310]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2f1: 1ir2 F:150-475 [71312]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2g1: 1ir2 G:150-475 [71314]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2h1: 1ir2 H:150-475 [71316]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2s1: 1ir2 S:150-475 [71326]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2t1: 1ir2 T:150-475 [71328]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2u1: 1ir2 U:150-475 [71330]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2v1: 1ir2 V:150-475 [71332]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2w1: 1ir2 W:150-475 [71334]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2x1: 1ir2 X:150-475 [71336]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2y1: 1ir2 Y:150-475 [71338]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2

Domain d1ir2z1: 1ir2 Z:150-475 [71340]
Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
complexed with cap, cry, hyp, kcx, mg, mme, smc

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Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] from c.1.14.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase first appeared in SCOP 1.59
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Species Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] from c.1.14.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase appears in the current release, SCOPe 2.08, called Species Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId:3055] from c.1.14.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase