Lineage for Species: Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId: 3055]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2078560Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2088460Superfamily c.1.14: RuBisCo, C-terminal domain [51649] (2 families) (S)
    automatically mapped to Pfam PF00016
  5. 2088461Family c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain [51650] (2 protein domains)
    N-terminal domain is alpha+beta
  6. 2088462Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [51651] (12 species)
  7. 2088486Species Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId:3055] [69403] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId: 3055]:

  1. Domain(s) for 1gk8:
    1. 2088503Domain d1gk8a1: 1gk8 A:150-475 [65234]
      Other proteins in same PDB: d1gk8a2, d1gk8c2, d1gk8e2, d1gk8g2, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
      complexed with cap, edo, mg
    2. 2088504Domain d1gk8c1: 1gk8 C:150-475 [65236]
      Other proteins in same PDB: d1gk8a2, d1gk8c2, d1gk8e2, d1gk8g2, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
      complexed with cap, edo, mg
    3. 2088505Domain d1gk8e1: 1gk8 E:150-475 [65238]
      Other proteins in same PDB: d1gk8a2, d1gk8c2, d1gk8e2, d1gk8g2, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
      complexed with cap, edo, mg
    4. 2088506Domain d1gk8g1: 1gk8 G:150-475 [65240]
      Other proteins in same PDB: d1gk8a2, d1gk8c2, d1gk8e2, d1gk8g2, d1gk8i_, d1gk8k_, d1gk8m_, d1gk8o_
      complexed with cap, edo, mg
  2. Domain(s) for 1ir2:
    1. 2088487Domain d1ir2a1: 1ir2 A:150-475 [71302]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    2. 2088488Domain d1ir2b1: 1ir2 B:150-475 [71304]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    3. 2088489Domain d1ir2c1: 1ir2 C:150-475 [71306]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    4. 2088490Domain d1ir2d1: 1ir2 D:150-475 [71308]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    5. 2088491Domain d1ir2e1: 1ir2 E:150-475 [71310]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    6. 2088492Domain d1ir2f1: 1ir2 F:150-475 [71312]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    7. 2088493Domain d1ir2g1: 1ir2 G:150-475 [71314]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    8. 2088494Domain d1ir2h1: 1ir2 H:150-475 [71316]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    9. 2088495Domain d1ir2s1: 1ir2 S:150-475 [71326]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    10. 2088496Domain d1ir2t1: 1ir2 T:150-475 [71328]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    11. 2088497Domain d1ir2u1: 1ir2 U:150-475 [71330]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    12. 2088498Domain d1ir2v1: 1ir2 V:150-475 [71332]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    13. 2088499Domain d1ir2w1: 1ir2 W:150-475 [71334]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    14. 2088500Domain d1ir2x1: 1ir2 X:150-475 [71336]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    15. 2088501Domain d1ir2y1: 1ir2 Y:150-475 [71338]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    16. 2088502Domain d1ir2z1: 1ir2 Z:150-475 [71340]
      Other proteins in same PDB: d1ir21_, d1ir22_, d1ir23_, d1ir24_, d1ir25_, d1ir26_, d1ir27_, d1ir28_, d1ir2a2, d1ir2b2, d1ir2c2, d1ir2d2, d1ir2e2, d1ir2f2, d1ir2g2, d1ir2h2, d1ir2i_, d1ir2j_, d1ir2k_, d1ir2l_, d1ir2m_, d1ir2n_, d1ir2o_, d1ir2p_, d1ir2s2, d1ir2t2, d1ir2u2, d1ir2v2, d1ir2w2, d1ir2x2, d1ir2y2, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
  3. Domain(s) for 1uzd:
    1. 2088515Domain d1uzda1: 1uzd A:150-475 [119774]
      Other proteins in same PDB: d1uzda2, d1uzdb2, d1uzdc1, d1uzde2, d1uzdf_, d1uzdh2, d1uzdi_, d1uzdj_, d1uzdk2, d1uzdm_, d1uzdo2, d1uzdp_, d1uzdr2, d1uzdt_, d1uzdv2, d1uzdw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    2. 2088516Domain d1uzdb1: 1uzd B:150-475 [119776]
      Other proteins in same PDB: d1uzda2, d1uzdb2, d1uzdc1, d1uzde2, d1uzdf_, d1uzdh2, d1uzdi_, d1uzdj_, d1uzdk2, d1uzdm_, d1uzdo2, d1uzdp_, d1uzdr2, d1uzdt_, d1uzdv2, d1uzdw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    3. 2088517Domain d1uzde1: 1uzd E:150-475 [119778]
      Other proteins in same PDB: d1uzda2, d1uzdb2, d1uzdc1, d1uzde2, d1uzdf_, d1uzdh2, d1uzdi_, d1uzdj_, d1uzdk2, d1uzdm_, d1uzdo2, d1uzdp_, d1uzdr2, d1uzdt_, d1uzdv2, d1uzdw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    4. 2088518Domain d1uzdh1: 1uzd H:150-475 [119780]
      Other proteins in same PDB: d1uzda2, d1uzdb2, d1uzdc1, d1uzde2, d1uzdf_, d1uzdh2, d1uzdi_, d1uzdj_, d1uzdk2, d1uzdm_, d1uzdo2, d1uzdp_, d1uzdr2, d1uzdt_, d1uzdv2, d1uzdw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    5. 2088519Domain d1uzdk1: 1uzd K:150-475 [119782]
      Other proteins in same PDB: d1uzda2, d1uzdb2, d1uzdc1, d1uzde2, d1uzdf_, d1uzdh2, d1uzdi_, d1uzdj_, d1uzdk2, d1uzdm_, d1uzdo2, d1uzdp_, d1uzdr2, d1uzdt_, d1uzdv2, d1uzdw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    6. 2088520Domain d1uzdo1: 1uzd O:150-475 [119784]
      Other proteins in same PDB: d1uzda2, d1uzdb2, d1uzdc1, d1uzde2, d1uzdf_, d1uzdh2, d1uzdi_, d1uzdj_, d1uzdk2, d1uzdm_, d1uzdo2, d1uzdp_, d1uzdr2, d1uzdt_, d1uzdv2, d1uzdw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    7. 2088521Domain d1uzdr1: 1uzd R:150-475 [119786]
      Other proteins in same PDB: d1uzda2, d1uzdb2, d1uzdc1, d1uzde2, d1uzdf_, d1uzdh2, d1uzdi_, d1uzdj_, d1uzdk2, d1uzdm_, d1uzdo2, d1uzdp_, d1uzdr2, d1uzdt_, d1uzdv2, d1uzdw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    8. 2088522Domain d1uzdv1: 1uzd V:150-475 [119788]
      Other proteins in same PDB: d1uzda2, d1uzdb2, d1uzdc1, d1uzde2, d1uzdf_, d1uzdh2, d1uzdi_, d1uzdj_, d1uzdk2, d1uzdm_, d1uzdo2, d1uzdp_, d1uzdr2, d1uzdt_, d1uzdv2, d1uzdw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
  4. Domain(s) for 1uzh:
    1. 2088507Domain d1uzha1: 1uzh A:150-475 [119790]
      Other proteins in same PDB: d1uzha2, d1uzhb2, d1uzhc1, d1uzhe2, d1uzhf_, d1uzhh2, d1uzhi_, d1uzhj_, d1uzhk2, d1uzhm_, d1uzho2, d1uzhp_, d1uzhr2, d1uzht_, d1uzhv2, d1uzhw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    2. 2088508Domain d1uzhb1: 1uzh B:150-475 [119792]
      Other proteins in same PDB: d1uzha2, d1uzhb2, d1uzhc1, d1uzhe2, d1uzhf_, d1uzhh2, d1uzhi_, d1uzhj_, d1uzhk2, d1uzhm_, d1uzho2, d1uzhp_, d1uzhr2, d1uzht_, d1uzhv2, d1uzhw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    3. 2088509Domain d1uzhe1: 1uzh E:150-475 [119794]
      Other proteins in same PDB: d1uzha2, d1uzhb2, d1uzhc1, d1uzhe2, d1uzhf_, d1uzhh2, d1uzhi_, d1uzhj_, d1uzhk2, d1uzhm_, d1uzho2, d1uzhp_, d1uzhr2, d1uzht_, d1uzhv2, d1uzhw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    4. 2088510Domain d1uzhh1: 1uzh H:150-475 [119796]
      Other proteins in same PDB: d1uzha2, d1uzhb2, d1uzhc1, d1uzhe2, d1uzhf_, d1uzhh2, d1uzhi_, d1uzhj_, d1uzhk2, d1uzhm_, d1uzho2, d1uzhp_, d1uzhr2, d1uzht_, d1uzhv2, d1uzhw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    5. 2088511Domain d1uzhk1: 1uzh K:150-475 [119798]
      Other proteins in same PDB: d1uzha2, d1uzhb2, d1uzhc1, d1uzhe2, d1uzhf_, d1uzhh2, d1uzhi_, d1uzhj_, d1uzhk2, d1uzhm_, d1uzho2, d1uzhp_, d1uzhr2, d1uzht_, d1uzhv2, d1uzhw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    6. 2088512Domain d1uzho1: 1uzh O:150-475 [119800]
      Other proteins in same PDB: d1uzha2, d1uzhb2, d1uzhc1, d1uzhe2, d1uzhf_, d1uzhh2, d1uzhi_, d1uzhj_, d1uzhk2, d1uzhm_, d1uzho2, d1uzhp_, d1uzhr2, d1uzht_, d1uzhv2, d1uzhw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    7. 2088513Domain d1uzhr1: 1uzh R:150-475 [119802]
      Other proteins in same PDB: d1uzha2, d1uzhb2, d1uzhc1, d1uzhe2, d1uzhf_, d1uzhh2, d1uzhi_, d1uzhj_, d1uzhk2, d1uzhm_, d1uzho2, d1uzhp_, d1uzhr2, d1uzht_, d1uzhv2, d1uzhw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg
    8. 2088514Domain d1uzhv1: 1uzh V:150-475 [119804]
      Other proteins in same PDB: d1uzha2, d1uzhb2, d1uzhc1, d1uzhe2, d1uzhf_, d1uzhh2, d1uzhi_, d1uzhj_, d1uzhk2, d1uzhm_, d1uzho2, d1uzhp_, d1uzhr2, d1uzht_, d1uzhv2, d1uzhw_
      automated match to d1gk8a1
      complexed with cap, edo, mg

More info for Species Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId:3055] from c.1.14.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

Timeline for Species Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId:3055] from c.1.14.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase: