Lineage for Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2021373Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2056344Fold b.36: PDZ domain-like [50155] (1 superfamily)
    contains barrel, partly opened; n*=4, S*=8; meander; capped by alpha-helix
  4. 2056345Superfamily b.36.1: PDZ domain-like [50156] (7 families) (S)
    peptide-binding domain
  5. 2056775Family b.36.1.3: Tail specific protease PDZ domain [68933] (2 proteins)
  6. 2056782Protein Tricorn protease [69253] (1 species)
  7. 2056783Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [69254] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]:

  1. Domain(s) for 1k32:
    1. 2056784Domain d1k32a1: 1k32 A:763-853 [68068]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    2. 2056785Domain d1k32b1: 1k32 B:763-853 [68072]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    3. 2056786Domain d1k32c1: 1k32 C:763-853 [68076]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    4. 2056787Domain d1k32d1: 1k32 D:763-853 [68080]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    5. 2056788Domain d1k32e1: 1k32 E:763-853 [68084]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    6. 2056789Domain d1k32f1: 1k32 F:763-853 [68088]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
  2. Domain(s) for 1n6d:
    1. 2056802Domain d1n6da1: 1n6d A:763-853 [80125]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
      complexed with chm, d10
    2. 2056803Domain d1n6db1: 1n6d B:763-853 [80129]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
      complexed with chm, d10
    3. 2056804Domain d1n6dc1: 1n6d C:763-853 [80133]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
      complexed with chm, d10
    4. 2056805Domain d1n6dd1: 1n6d D:763-853 [80137]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
      complexed with chm, d10
    5. 2056806Domain d1n6de1: 1n6d E:763-853 [80141]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
      complexed with chm, d10
    6. 2056807Domain d1n6df1: 1n6d F:763-853 [80145]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
      complexed with chm, d10
  3. Domain(s) for 1n6e:
    1. 2056790Domain d1n6ea1: 1n6e A:763-853 [80149]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
      complexed with chm
    2. 2056791Domain d1n6ec1: 1n6e C:763-853 [80153]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
      complexed with chm
    3. 2056792Domain d1n6ee1: 1n6e E:763-853 [80157]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
      complexed with chm
    4. 2056793Domain d1n6eg1: 1n6e G:763-853 [80161]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
      complexed with chm
    5. 2056794Domain d1n6ei1: 1n6e I:763-853 [80165]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
      complexed with chm
    6. 2056795Domain d1n6ek1: 1n6e K:763-853 [80169]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
      complexed with chm
  4. Domain(s) for 1n6f:
    1. 2056796Domain d1n6fa1: 1n6f A:763-853 [80173]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
      complexed with dkt
    2. 2056797Domain d1n6fb1: 1n6f B:763-853 [80177]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
      complexed with dkt
    3. 2056798Domain d1n6fc1: 1n6f C:763-853 [80181]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
      complexed with dkt
    4. 2056799Domain d1n6fd1: 1n6f D:763-853 [80185]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
      complexed with dkt
    5. 2056800Domain d1n6fe1: 1n6f E:763-853 [80189]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
      complexed with dkt
    6. 2056801Domain d1n6ff1: 1n6f F:763-853 [80193]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
      complexed with dkt

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