Lineage for Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 287094Class b: All beta proteins [48724] (126 folds)
  3. 296371Fold b.36: PDZ domain-like [50155] (1 superfamily)
    contains barrel, partly opened; n*=4, S*=8; meander; capped by alpha-helix
  4. 296372Superfamily b.36.1: PDZ domain-like [50156] (4 families) (S)
    peptide-binding domain
  5. 296450Family b.36.1.3: Tail specific protease PDZ domain [68933] (2 proteins)
  6. 296457Protein Tricorn protease [69253] (1 species)
  7. 296458Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [69254] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum:

  1. Domain(s) for 1k32:
    1. 296459Domain d1k32a1: 1k32 A:763-853 [68068]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    2. 296460Domain d1k32b1: 1k32 B:763-853 [68072]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    3. 296461Domain d1k32c1: 1k32 C:763-853 [68076]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    4. 296462Domain d1k32d1: 1k32 D:763-853 [68080]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    5. 296463Domain d1k32e1: 1k32 E:763-853 [68084]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
    6. 296464Domain d1k32f1: 1k32 F:763-853 [68088]
      Other proteins in same PDB: d1k32a2, d1k32a3, d1k32a4, d1k32b2, d1k32b3, d1k32b4, d1k32c2, d1k32c3, d1k32c4, d1k32d2, d1k32d3, d1k32d4, d1k32e2, d1k32e3, d1k32e4, d1k32f2, d1k32f3, d1k32f4
  2. Domain(s) for 1n6d:
    1. 296477Domain d1n6da1: 1n6d A:763-853 [80125]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
    2. 296478Domain d1n6db1: 1n6d B:763-853 [80129]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
    3. 296479Domain d1n6dc1: 1n6d C:763-853 [80133]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
    4. 296480Domain d1n6dd1: 1n6d D:763-853 [80137]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
    5. 296481Domain d1n6de1: 1n6d E:763-853 [80141]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
    6. 296482Domain d1n6df1: 1n6d F:763-853 [80145]
      Other proteins in same PDB: d1n6da2, d1n6da3, d1n6da4, d1n6db2, d1n6db3, d1n6db4, d1n6dc2, d1n6dc3, d1n6dc4, d1n6dd2, d1n6dd3, d1n6dd4, d1n6de2, d1n6de3, d1n6de4, d1n6df2, d1n6df3, d1n6df4
      complexed with chm, d10
  3. Domain(s) for 1n6e:
    1. 296465Domain d1n6ea1: 1n6e A:763-853 [80149]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
    2. 296466Domain d1n6ec1: 1n6e C:763-853 [80153]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
    3. 296467Domain d1n6ee1: 1n6e E:763-853 [80157]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
    4. 296468Domain d1n6eg1: 1n6e G:763-853 [80161]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
    5. 296469Domain d1n6ei1: 1n6e I:763-853 [80165]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
    6. 296470Domain d1n6ek1: 1n6e K:763-853 [80169]
      Other proteins in same PDB: d1n6ea2, d1n6ea3, d1n6ea4, d1n6ec2, d1n6ec3, d1n6ec4, d1n6ee2, d1n6ee3, d1n6ee4, d1n6eg2, d1n6eg3, d1n6eg4, d1n6ei2, d1n6ei3, d1n6ei4, d1n6ek2, d1n6ek3, d1n6ek4
      complexed with chm
  4. Domain(s) for 1n6f:
    1. 296471Domain d1n6fa1: 1n6f A:763-853 [80173]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
    2. 296472Domain d1n6fb1: 1n6f B:763-853 [80177]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
    3. 296473Domain d1n6fc1: 1n6f C:763-853 [80181]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
    4. 296474Domain d1n6fd1: 1n6f D:763-853 [80185]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
    5. 296475Domain d1n6fe1: 1n6f E:763-853 [80189]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
    6. 296476Domain d1n6ff1: 1n6f F:763-853 [80193]
      Other proteins in same PDB: d1n6fa2, d1n6fa3, d1n6fa4, d1n6fb2, d1n6fb3, d1n6fb4, d1n6fc2, d1n6fc3, d1n6fc4, d1n6fd2, d1n6fd3, d1n6fd4, d1n6fe2, d1n6fe3, d1n6fe4, d1n6ff2, d1n6ff3, d1n6ff4
      complexed with dkt

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