SCOPe 2.07: Species: Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]

Lineage for Species: Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]

Root: SCOPe 2.07
Class b: All beta proteins [48724] (178 folds)
Fold b.22: TNF-like [49841] (1 superfamily)
sandwich, 10 strands in 2 sheets; jelly-roll
Superfamily b.22.1: TNF-like [49842] (2 families)
Family b.22.1.1: TNF-like [49843] (15 proteins)
Protein Soluble part of TALL-1, sTALL-1 (BAFF) [69228] (1 species)

Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [69229] (8 PDB entries)
also includes the PDB entry (1otz) that together with the entry (1p0t) provides the multimeric structure of the complex of this protein with its receptor, BAFF-R. In these entries protein chains are designated by both upper case and lower case letters creating problems with its processing and presentation in SCOP

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]:

Domain(s) for 1jh5:
1. Domain d1jh5a_: 1jh5 A: [66697]
2. Domain d1jh5b_: 1jh5 B: [66698]
3. Domain d1jh5c_: 1jh5 C: [66699]
4. Domain d1jh5d_: 1jh5 D: [66700]
5. Domain d1jh5e_: 1jh5 E: [66701]
6. Domain d1jh5f_: 1jh5 F: [66702]
7. Domain d1jh5g_: 1jh5 G: [66703]
8. Domain d1jh5h_: 1jh5 H: [66704]
9. Domain d1jh5i_: 1jh5 I: [66705]
10. Domain d1jh5j_: 1jh5 J: [66706]
Domain(s) for 1kd7:
1. Domain d1kd7a_: 1kd7 A: [77331]
2. Domain d1kd7b_: 1kd7 B: [77332]
3. Domain d1kd7c_: 1kd7 C: [77333]
4. Domain d1kd7k_: 1kd7 K: [77334]
5. Domain d1kd7l_: 1kd7 L: [77335]
6. Domain d1kd7m_: 1kd7 M: [77336]
Domain(s) for 1kxg:
1. Domain d1kxga_: 1kxg A: [73145]
  complexed with cit, dio, mg
2. Domain d1kxgb_: 1kxg B: [73146]
  complexed with cit, dio, mg
3. Domain d1kxgc_: 1kxg C: [73147]
  complexed with cit, dio, mg
4. Domain d1kxgd_: 1kxg D: [73148]
  complexed with cit, dio, mg
5. Domain d1kxge_: 1kxg E: [73149]
  complexed with cit, dio, mg
6. Domain d1kxgf_: 1kxg F: [73150]
  complexed with cit, dio, mg
Domain(s) for 1oqd:
1. Domain d1oqda_: 1oqd A: [87268]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
2. Domain d1oqdb_: 1oqd B: [87269]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
3. Domain d1oqdc_: 1oqd C: [87270]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
4. Domain d1oqdd_: 1oqd D: [87271]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
5. Domain d1oqde_: 1oqd E: [87272]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
6. Domain d1oqdf_: 1oqd F: [87273]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
7. Domain d1oqdg_: 1oqd G: [87274]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
8. Domain d1oqdh_: 1oqd H: [87275]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
9. Domain d1oqdi_: 1oqd I: [87276]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
10. Domain d1oqdj_: 1oqd J: [87277]
  Other proteins in same PDB: d1oqdk_, d1oqdl_, d1oqdm_, d1oqdn_, d1oqdo_, d1oqdp_, d1oqdq_, d1oqdr_
Domain(s) for 1oqe:
1. Domain d1oqea_: 1oqe A: [87286]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
2. Domain d1oqeb_: 1oqe B: [87287]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
3. Domain d1oqec_: 1oqe C: [87288]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
4. Domain d1oqed_: 1oqe D: [87289]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
5. Domain d1oqee_: 1oqe E: [87290]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
6. Domain d1oqef_: 1oqe F: [87291]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
7. Domain d1oqeg_: 1oqe G: [87292]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
8. Domain d1oqeh_: 1oqe H: [87293]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
9. Domain d1oqei_: 1oqe I: [87294]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
10. Domain d1oqej_: 1oqe J: [87295]
  Other proteins in same PDB: d1oqek_, d1oqel_, d1oqem_, d1oqen_, d1oqeo_, d1oqep_, d1oqeq_, d1oqer_
Domain(s) for 1osg:
1. Domain d1osga_: 1osg A: [87381]
  complexed with a br3 derived peptide; chains G, H, I, J, K and L
  complexed with mg
2. Domain d1osgb_: 1osg B: [87382]
  complexed with a br3 derived peptide; chains G, H, I, J, K and L
  complexed with mg
3. Domain d1osgc_: 1osg C: [87383]
  complexed with a br3 derived peptide; chains G, H, I, J, K and L
  complexed with mg
4. Domain d1osgd_: 1osg D: [87384]
  complexed with a br3 derived peptide; chains G, H, I, J, K and L
  complexed with mg
5. Domain d1osge_: 1osg E: [87385]
  complexed with a br3 derived peptide; chains G, H, I, J, K and L
  complexed with mg
6. Domain d1osgf_: 1osg F: [87386]
  complexed with a br3 derived peptide; chains G, H, I, J, K and L
  complexed with mg
Domain(s) for 5y9j:
- Domain d5y9ja_: 5y9j A: [348899]
  Other proteins in same PDB: d5y9jl1, d5y9jl2
  automated match to d1kxga_
Domain(s) for 6fxn:
1. Domain d6fxnl_: 6fxn L: [350647]
  Other proteins in same PDB: d6fxne1, d6fxne2, d6fxng1, d6fxng2, d6fxni1, d6fxni2, d6fxnn1, d6fxnn2, d6fxnp1, d6fxnp2, d6fxnr1, d6fxnr2
  automated match to d1kxga_
2. Domain d6fxnb_: 6fxn B: [350648]
  Other proteins in same PDB: d6fxne1, d6fxne2, d6fxng1, d6fxng2, d6fxni1, d6fxni2, d6fxnn1, d6fxnn2, d6fxnp1, d6fxnp2, d6fxnr1, d6fxnr2
  automated match to d1kxga_
3. Domain d6fxna_: 6fxn A: [350709]
  Other proteins in same PDB: d6fxne1, d6fxne2, d6fxng1, d6fxng2, d6fxni1, d6fxni2, d6fxnn1, d6fxnn2, d6fxnp1, d6fxnp2, d6fxnr1, d6fxnr2
  automated match to d1kxga_
4. Domain d6fxnc_: 6fxn C: [350721]
  Other proteins in same PDB: d6fxne1, d6fxne2, d6fxng1, d6fxng2, d6fxni1, d6fxni2, d6fxnn1, d6fxnn2, d6fxnp1, d6fxnp2, d6fxnr1, d6fxnr2
  automated match to d1kxga_
5. Domain d6fxnk_: 6fxn K: [350805]
  Other proteins in same PDB: d6fxne1, d6fxne2, d6fxng1, d6fxng2, d6fxni1, d6fxni2, d6fxnn1, d6fxnn2, d6fxnp1, d6fxnp2, d6fxnr1, d6fxnr2
  automated match to d1kxga_
6. Domain d6fxnj_: 6fxn J: [350808]
  Other proteins in same PDB: d6fxne1, d6fxne2, d6fxng1, d6fxng2, d6fxni1, d6fxni2, d6fxnn1, d6fxnn2, d6fxnp1, d6fxnp2, d6fxnr1, d6fxnr2
  automated match to d1kxga_

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Timeline for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.22.1.1 Soluble part of TALL-1, sTALL-1 (BAFF):

Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.22.1.1 Soluble part of TALL-1, sTALL-1 (BAFF) first appeared in SCOP 1.59, called Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.22.1.1 Soluble part of TALL-1, sTALL-1
Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.22.1.1 Soluble part of TALL-1, sTALL-1 (BAFF) appears in SCOPe 2.06