Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 651986Class b: All beta proteins [48724] (165 folds)
  3. 667292Fold b.40: OB-fold [50198] (12 superfamilies)
    barrel, closed or partly opened n=5, S=10 or S=8; greek-key
  4. 668013Superfamily b.40.4: Nucleic acid-binding proteins [50249] (14 families) (S)
  5. 668307Family b.40.4.5: Cold shock DNA-binding domain-like [50282] (22 proteins)
    barrel, closed; n=5, S=8
  6. 668444Protein Rho termination factor, RNA-binding domain [68910] (1 species)
  7. 668445Species Escherichia coli [TaxId:562] [68911] (9 PDB entries)

PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:

  1. Domain(s) for 1a62:
  2. Domain(s) for 1a63:
  3. Domain(s) for 1a8v:
    1. 668447Domain d1a8va2: 1a8v A:48-118 [64713]
      Other proteins in same PDB: d1a8va1, d1a8vb1
    2. 668448Domain d1a8vb2: 1a8v B:48-118 [64715]
      Other proteins in same PDB: d1a8va1, d1a8vb1
      complexed with cu
  4. Domain(s) for 1pv4:
    1. 668464Domain d1pv4a2: 1pv4 A:48-126 [88296]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a3, d1pv4b2, d1pv4c1, d1pv4c3, d1pv4d1, d1pv4d3, d1pv4e1, d1pv4e3, d1pv4f1, d1pv4f3
    2. 668465Domain d1pv4b1: 1pv4 B:51-126 [88298]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a3, d1pv4b2, d1pv4c1, d1pv4c3, d1pv4d1, d1pv4d3, d1pv4e1, d1pv4e3, d1pv4f1, d1pv4f3
    3. 668466Domain d1pv4c2: 1pv4 C:48-126 [88301]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a3, d1pv4b2, d1pv4c1, d1pv4c3, d1pv4d1, d1pv4d3, d1pv4e1, d1pv4e3, d1pv4f1, d1pv4f3
    4. 668467Domain d1pv4d2: 1pv4 D:48-126 [88304]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a3, d1pv4b2, d1pv4c1, d1pv4c3, d1pv4d1, d1pv4d3, d1pv4e1, d1pv4e3, d1pv4f1, d1pv4f3
    5. 668468Domain d1pv4e2: 1pv4 E:48-126 [88307]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a3, d1pv4b2, d1pv4c1, d1pv4c3, d1pv4d1, d1pv4d3, d1pv4e1, d1pv4e3, d1pv4f1, d1pv4f3
    6. 668469Domain d1pv4f2: 1pv4 F:48-126 [88310]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a3, d1pv4b2, d1pv4c1, d1pv4c3, d1pv4d1, d1pv4d3, d1pv4e1, d1pv4e3, d1pv4f1, d1pv4f3
      complexed with mse
  5. Domain(s) for 1pvo:
    1. 668458Domain d1pvoa2: 1pvo A:48-126 [88317]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa3, d1pvob2, d1pvoc1, d1pvoc3, d1pvod1, d1pvod3, d1pvoe1, d1pvoe3, d1pvof1, d1pvof3
    2. 668459Domain d1pvob1: 1pvo B:51-126 [88319]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa3, d1pvob2, d1pvoc1, d1pvoc3, d1pvod1, d1pvod3, d1pvoe1, d1pvoe3, d1pvof1, d1pvof3
    3. 668460Domain d1pvoc2: 1pvo C:48-126 [88322]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa3, d1pvob2, d1pvoc1, d1pvoc3, d1pvod1, d1pvod3, d1pvoe1, d1pvoe3, d1pvof1, d1pvof3
    4. 668461Domain d1pvod2: 1pvo D:48-126 [88325]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa3, d1pvob2, d1pvoc1, d1pvoc3, d1pvod1, d1pvod3, d1pvoe1, d1pvoe3, d1pvof1, d1pvof3
    5. 668462Domain d1pvoe2: 1pvo E:48-126 [88328]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa3, d1pvob2, d1pvoc1, d1pvoc3, d1pvod1, d1pvod3, d1pvoe1, d1pvoe3, d1pvof1, d1pvof3
    6. 668463Domain d1pvof2: 1pvo F:48-126 [88331]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa3, d1pvob2, d1pvoc1, d1pvoc3, d1pvod1, d1pvod3, d1pvoe1, d1pvoe3, d1pvof1, d1pvof3
      complexed with anp
  6. Domain(s) for 1xpo:
    1. 668476Domain d1xpoa2: 1xpo A:48-129 [122213]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa3, d1xpob1, d1xpob3, d1xpoc1, d1xpoc3, d1xpod1, d1xpod3, d1xpoe1, d1xpoe3, d1xpof1, d1xpof3
      automatically matched to d1a63_2
      complexed with ags, bcm, mg
    2. 668477Domain d1xpob2: 1xpo B:48-129 [122216]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa3, d1xpob1, d1xpob3, d1xpoc1, d1xpoc3, d1xpod1, d1xpod3, d1xpoe1, d1xpoe3, d1xpof1, d1xpof3
      automatically matched to d1a63_2
      complexed with ags, bcm, mg
    3. 668478Domain d1xpoc2: 1xpo C:48-129 [122219]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa3, d1xpob1, d1xpob3, d1xpoc1, d1xpoc3, d1xpod1, d1xpod3, d1xpoe1, d1xpoe3, d1xpof1, d1xpof3
      automatically matched to d1a63_2
      complexed with ags, bcm, mg
    4. 668479Domain d1xpod2: 1xpo D:48-129 [122222]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa3, d1xpob1, d1xpob3, d1xpoc1, d1xpoc3, d1xpod1, d1xpod3, d1xpoe1, d1xpoe3, d1xpof1, d1xpof3
      automatically matched to d1a63_2
      complexed with ags, bcm, mg
    5. 668480Domain d1xpoe2: 1xpo E:48-129 [122225]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa3, d1xpob1, d1xpob3, d1xpoc1, d1xpoc3, d1xpod1, d1xpod3, d1xpoe1, d1xpoe3, d1xpof1, d1xpof3
      automatically matched to d1a63_2
      complexed with ags, bcm, mg
    6. 668481Domain d1xpof2: 1xpo F:48-129 [122228]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa3, d1xpob1, d1xpob3, d1xpoc1, d1xpoc3, d1xpod1, d1xpod3, d1xpoe1, d1xpoe3, d1xpof1, d1xpof3
      automatically matched to d1a63_2
      complexed with ags, bcm, mg
  7. Domain(s) for 1xpr:
    1. 668470Domain d1xpra2: 1xpr A:48-126 [115773]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra3, d1xprb1, d1xprb3, d1xprc1, d1xprc3, d1xprd1, d1xprd3, d1xpre1, d1xpre3, d1xprf1, d1xprf3
    2. 668471Domain d1xprb2: 1xpr B:48-126 [115776]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra3, d1xprb1, d1xprb3, d1xprc1, d1xprc3, d1xprd1, d1xprd3, d1xpre1, d1xpre3, d1xprf1, d1xprf3
    3. 668472Domain d1xprc2: 1xpr C:48-126 [115779]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra3, d1xprb1, d1xprb3, d1xprc1, d1xprc3, d1xprd1, d1xprd3, d1xpre1, d1xpre3, d1xprf1, d1xprf3
    4. 668473Domain d1xprd2: 1xpr D:48-126 [115782]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra3, d1xprb1, d1xprb3, d1xprc1, d1xprc3, d1xprd1, d1xprd3, d1xpre1, d1xpre3, d1xprf1, d1xprf3
    5. 668474Domain d1xpre2: 1xpr E:48-126 [115785]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra3, d1xprb1, d1xprb3, d1xprc1, d1xprc3, d1xprd1, d1xprd3, d1xpre1, d1xpre3, d1xprf1, d1xprf3
    6. 668475Domain d1xprf2: 1xpr F:48-126 [115788]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra3, d1xprb1, d1xprb3, d1xprc1, d1xprc3, d1xprd1, d1xprd3, d1xpre1, d1xpre3, d1xprf1, d1xprf3
      complexed with ags, fb, mg
  8. Domain(s) for 1xpu:
    1. 668452Domain d1xpua2: 1xpu A:48-126 [115791]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua3, d1xpub1, d1xpub3, d1xpuc1, d1xpuc3, d1xpud1, d1xpud3, d1xpue1, d1xpue3, d1xpuf1, d1xpuf3
    2. 668453Domain d1xpub2: 1xpu B:48-126 [115794]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua3, d1xpub1, d1xpub3, d1xpuc1, d1xpuc3, d1xpud1, d1xpud3, d1xpue1, d1xpue3, d1xpuf1, d1xpuf3
    3. 668454Domain d1xpuc2: 1xpu C:48-126 [115797]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua3, d1xpub1, d1xpub3, d1xpuc1, d1xpuc3, d1xpud1, d1xpud3, d1xpue1, d1xpue3, d1xpuf1, d1xpuf3
    4. 668455Domain d1xpud2: 1xpu D:48-126 [115800]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua3, d1xpub1, d1xpub3, d1xpuc1, d1xpuc3, d1xpud1, d1xpud3, d1xpue1, d1xpue3, d1xpuf1, d1xpuf3
    5. 668456Domain d1xpue2: 1xpu E:48-126 [115803]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua3, d1xpub1, d1xpub3, d1xpuc1, d1xpuc3, d1xpud1, d1xpud3, d1xpue1, d1xpue3, d1xpuf1, d1xpuf3
    6. 668457Domain d1xpuf2: 1xpu F:48-126 [115806]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua3, d1xpub1, d1xpub3, d1xpuc1, d1xpuc3, d1xpud1, d1xpud3, d1xpue1, d1xpue3, d1xpuf1, d1xpuf3
      complexed with ags, fpd, mg
  9. Domain(s) for 2a8v:
    1. 668449Domain d2a8va2: 2a8v A:48-118 [64753]
      Other proteins in same PDB: d2a8va1, d2a8vb1, d2a8vc1
    2. 668450Domain d2a8vb2: 2a8v B:48-118 [64755]
      Other proteins in same PDB: d2a8va1, d2a8vb1, d2a8vc1
    3. 668451Domain d2a8vc2: 2a8v C:48-118 [64757]
      Other proteins in same PDB: d2a8va1, d2a8vb1, d2a8vc1
      protein/RNA complex

More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from b.40.4.5 Rho termination factor, RNA-binding domain

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