Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds) |
Fold d.68: IF3-like [55199] (8 superfamilies) beta-alpha-beta-alpha-beta(2); 2 layers; mixed sheet 1243, strand 4 is antiparallel to the rest |
Superfamily d.68.5: C-terminal domain of ProRS [64586] (1 family) contains a metal (zinc)-binding site |
Family d.68.5.1: C-terminal domain of ProRS [64587] (1 protein) |
Protein C-terminal domain of ProRS [64588] (3 species) |
Methanocaldococcus jannaschii [TaxId:2190] [89974] (1 PDB entry) |
Domain d1nj8a2: 1nj8 A:394-455 [85770] Other proteins in same PDB: d1nj8a1, d1nj8a3, d1nj8a4, d1nj8b1, d1nj8b3, d1nj8b4, d1nj8c1, d1nj8c3, d1nj8c4, d1nj8d1, d1nj8d3, d1nj8d4 |
Domain d1nj8b2: 1nj8 B:394-455 [85773] Other proteins in same PDB: d1nj8a1, d1nj8a3, d1nj8a4, d1nj8b1, d1nj8b3, d1nj8b4, d1nj8c1, d1nj8c3, d1nj8c4, d1nj8d1, d1nj8d3, d1nj8d4 |
Domain d1nj8c2: 1nj8 C:394-455 [85776] Other proteins in same PDB: d1nj8a1, d1nj8a3, d1nj8a4, d1nj8b1, d1nj8b3, d1nj8b4, d1nj8c1, d1nj8c3, d1nj8c4, d1nj8d1, d1nj8d3, d1nj8d4 |
Domain d1nj8d2: 1nj8 D:394-455 [85779] Other proteins in same PDB: d1nj8a1, d1nj8a3, d1nj8a4, d1nj8b1, d1nj8b3, d1nj8b4, d1nj8c1, d1nj8c3, d1nj8c4, d1nj8d1, d1nj8d3, d1nj8d4 |
Methanothermobacter thermautotrophicus [TaxId:145262] [89973] (4 PDB entries) |
Domain d1nj1a2: 1nj1 A:411-481 [85756] Other proteins in same PDB: d1nj1a1, d1nj1a3 protein/RNA complex; complexed with 5ca, mg, zn |
Domain d1nj2a2: 1nj2 A:411-481 [85759] Other proteins in same PDB: d1nj2a1, d1nj2a3 complexed with mg, zn |
Domain d1nj5a2: 1nj5 A:411-481 [85763] Other proteins in same PDB: d1nj5a1, d1nj5a3 protein/RNA complex; complexed with mg, p5a, zn |
Domain d1nj6a2: 1nj6 A:411-481 [85766] Other proteins in same PDB: d1nj6a1, d1nj6a3 protein/RNA complex; complexed with a5a, mg, zn |
Thermus thermophilus [TaxId:274] [64589] (4 PDB entries) |
Domain d1h4qa3: 1h4q A:404-477 [60600] Other proteins in same PDB: d1h4qa1, d1h4qa2, d1h4qb1, d1h4qb2 protein/RNA complex; complexed with atp, pri, so4, zn |
Domain d1h4qb3: 1h4q B:404-477 [60603] Other proteins in same PDB: d1h4qa1, d1h4qa2, d1h4qb1, d1h4qb2 protein/RNA complex; complexed with atp, pri, so4, zn |
Domain d1h4sa3: 1h4s A:404-477 [60606] Other proteins in same PDB: d1h4sa1, d1h4sa2, d1h4sb1, d1h4sb2 protein/RNA complex; complexed with psd, so4, zn |
Domain d1h4sb3: 1h4s B:404-477 [60609] Other proteins in same PDB: d1h4sa1, d1h4sa2, d1h4sb1, d1h4sb2 protein/RNA complex; complexed with psd, so4, zn |
Domain d1h4ta3: 1h4t A:404-477 [60612] Other proteins in same PDB: d1h4ta1, d1h4ta2, d1h4tb1, d1h4tb2, d1h4tc1, d1h4tc2, d1h4td1, d1h4td2 protein/RNA complex; complexed with pro, zn |
Domain d1h4tb3: 1h4t B:404-477 [60615] Other proteins in same PDB: d1h4ta1, d1h4ta2, d1h4tb1, d1h4tb2, d1h4tc1, d1h4tc2, d1h4td1, d1h4td2 protein/RNA complex; complexed with pro, zn |
Domain d1h4tc3: 1h4t C:404-477 [60618] Other proteins in same PDB: d1h4ta1, d1h4ta2, d1h4tb1, d1h4tb2, d1h4tc1, d1h4tc2, d1h4td1, d1h4td2 protein/RNA complex; complexed with pro, zn |
Domain d1h4td3: 1h4t D:404-477 [60621] Other proteins in same PDB: d1h4ta1, d1h4ta2, d1h4tb1, d1h4tb2, d1h4tc1, d1h4tc2, d1h4td1, d1h4td2 protein/RNA complex; complexed with pro, zn |
Domain d1hc7a3: 1hc7 A:404-477 [60940] Other proteins in same PDB: d1hc7a1, d1hc7a2, d1hc7b1, d1hc7b2, d1hc7c1, d1hc7c2, d1hc7d1, d1hc7d2 complexed with zn |
Domain d1hc7b3: 1hc7 B:404-477 [60943] Other proteins in same PDB: d1hc7a1, d1hc7a2, d1hc7b1, d1hc7b2, d1hc7c1, d1hc7c2, d1hc7d1, d1hc7d2 complexed with zn |
Domain d1hc7c3: 1hc7 C:404-477 [60946] Other proteins in same PDB: d1hc7a1, d1hc7a2, d1hc7b1, d1hc7b2, d1hc7c1, d1hc7c2, d1hc7d1, d1hc7d2 complexed with zn |
Domain d1hc7d3: 1hc7 D:404-477 [60949] Other proteins in same PDB: d1hc7a1, d1hc7a2, d1hc7b1, d1hc7b2, d1hc7c1, d1hc7c2, d1hc7d1, d1hc7d2 complexed with zn |
Timeline for Protein C-terminal domain of ProRS from d.68.5.1: C-terminal domain of ProRS: