SCOP 1.73: Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

Root: SCOP 1.73
Class g: Small proteins [56992] (85 folds)
Fold g.41: Rubredoxin-like [57769] (16 superfamilies)
metal(zinc or iron)-bound fold; sequence contains two CX(n)C motifs, in most cases n = 2
Superfamily g.41.9: RNA polymerase subunits [63393] (2 families)
Family g.41.9.2: RBP12 subunit of RNA polymerase II [64576] (1 protein)
Protein RBP12 subunit of RNA polymerase II [64577] (1 species)
Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64578] (24 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

Domain(s) for 1i3q:
- Domain d1i3ql_: 1i3q L: [61619]
  Other proteins in same PDB: d1i3qa_, d1i3qb_, d1i3qc1, d1i3qc2, d1i3qe1, d1i3qe2, d1i3qf_, d1i3qh_, d1i3qi1, d1i3qi2, d1i3qj_, d1i3qk_
  complexed with mg, zn
Domain(s) for 1i50:
- Domain d1i50l_: 1i50 L: [61766]
  Other proteins in same PDB: d1i50a_, d1i50b_, d1i50c1, d1i50c2, d1i50e1, d1i50e2, d1i50f_, d1i50h_, d1i50i1, d1i50i2, d1i50j_, d1i50k_
  complexed with mn, zn
Domain(s) for 1i6h:
- Domain d1i6hl_: 1i6h L: [61843]
  Other proteins in same PDB: d1i6ha_, d1i6hb_, d1i6hc1, d1i6hc2, d1i6he1, d1i6he2, d1i6hf_, d1i6hh_, d1i6hi1, d1i6hi2, d1i6hj_, d1i6hk_
  complexed with mg, zn
Domain(s) for 1k83:
- Domain d1k83l_: 1k83 L: [68287]
  Other proteins in same PDB: d1k83a_, d1k83b_, d1k83c1, d1k83c2, d1k83e1, d1k83e2, d1k83f_, d1k83h_, d1k83i1, d1k83i2, d1k83j_, d1k83k_
  complexed with ilx, mn, trx, zn
Domain(s) for 1twa:
- Domain d1twal_: 1twa L: [112708]
  Other proteins in same PDB: d1twaa_, d1twab_, d1twac1, d1twac2, d1twae1, d1twae2, d1twaf_, d1twah_, d1twai1, d1twai2, d1twaj_, d1twak_
  complexed with atp, mn, zn
Domain(s) for 1twc:
- Domain d1twcl_: 1twc L: [112723]
  Other proteins in same PDB: d1twca_, d1twcb_, d1twcc1, d1twcc2, d1twce1, d1twce2, d1twcf_, d1twch_, d1twci1, d1twci2, d1twcj_, d1twck_
  complexed with gtp, mn, zn
Domain(s) for 1twf:
- Domain d1twfl_: 1twf L: [112737]
  Other proteins in same PDB: d1twfa_, d1twfb_, d1twfc1, d1twfc2, d1twfe1, d1twfe2, d1twff_, d1twfh_, d1twfi1, d1twfi2, d1twfj_, d1twfk_
  complexed with mn, utp, zn
Domain(s) for 1twg:
- Domain d1twgl_: 1twg L: [112750]
  Other proteins in same PDB: d1twga_, d1twgb_, d1twgc1, d1twgc2, d1twge1, d1twge2, d1twgf_, d1twgh_, d1twgi1, d1twgi2, d1twgj_, d1twgk_
  complexed with ctp, mn, zn
Domain(s) for 1twh:
- Domain d1twhl_: 1twh L: [112763]
  Other proteins in same PDB: d1twha_, d1twhb_, d1twhc1, d1twhc2, d1twhe1, d1twhe2, d1twhf_, d1twhh_, d1twhi1, d1twhi2, d1twhj_, d1twhk_
  complexed with atp, mn, zn

Domain(s) for 2b63:

Domain d2b63l1: 2b63 L:25-70 [127931]
Other proteins in same PDB: d2b63a1, d2b63b1, d2b63c1, d2b63c2, d2b63d1, d2b63e1, d2b63e2, d2b63f1, d2b63g1, d2b63h1, d2b63i1, d2b63i2, d2b63j1, d2b63k1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with 5bu, mg, zn

Domain(s) for 2b8k:

Domain d2b8kl1: 2b8k L:25-70 [128091]
Other proteins in same PDB: d2b8ka1, d2b8kb1, d2b8kc1, d2b8kc2, d2b8kd1, d2b8ke1, d2b8ke2, d2b8kf1, d2b8kg1, d2b8kg2, d2b8kh1, d2b8ki1, d2b8ki2, d2b8kj1, d2b8kk1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with zn

Domain(s) for 2e2h:

Domain d2e2hl1: 2e2h L:25-70 [131993]
Other proteins in same PDB: d2e2ha1, d2e2hb1, d2e2hc1, d2e2hc2, d2e2he1, d2e2he2, d2e2hf1, d2e2hh1, d2e2hi1, d2e2hi2, d2e2hj1, d2e2hk1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with gtp, mg, zn

Domain(s) for 2e2i:

Domain d2e2il1: 2e2i L:25-70 [132006]
Other proteins in same PDB: d2e2ia1, d2e2ib1, d2e2ic1, d2e2ic2, d2e2ie1, d2e2ie2, d2e2if1, d2e2ih1, d2e2ii1, d2e2ii2, d2e2ij1, d2e2ik1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with dgt, mg, zn

Domain(s) for 2e2j:

Domain d2e2jl1: 2e2j L:25-70 [132019]
Other proteins in same PDB: d2e2ja1, d2e2jb1, d2e2jc1, d2e2jc2, d2e2je1, d2e2je2, d2e2jf1, d2e2jh1, d2e2ji1, d2e2ji2, d2e2jj1, d2e2jk1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with g2p, mg, zn

Domain(s) for 2ja5:

Domain d2ja5l1: 2ja5 L:25-70 [138173]
Other proteins in same PDB: d2ja5a1, d2ja5b1, d2ja5c1, d2ja5c2, d2ja5d1, d2ja5e1, d2ja5e2, d2ja5f1, d2ja5g1, d2ja5g2, d2ja5h1, d2ja5i1, d2ja5i2, d2ja5j1, d2ja5k1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with bru, mg, zn

Domain(s) for 2ja6:

Domain d2ja6l1: 2ja6 L:25-70 [138189]
Other proteins in same PDB: d2ja6a1, d2ja6b1, d2ja6c1, d2ja6c2, d2ja6d1, d2ja6e1, d2ja6e2, d2ja6f1, d2ja6g1, d2ja6g2, d2ja6h1, d2ja6i1, d2ja6i2, d2ja6j1, d2ja6k1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with bru, mg, tt, zn

Domain(s) for 2ja7:

Domain d2ja7l1: 2ja7 L:25-70 [138205]
Other proteins in same PDB: d2ja7a1, d2ja7b1, d2ja7c1, d2ja7c2, d2ja7d1, d2ja7e1, d2ja7e2, d2ja7f1, d2ja7g1, d2ja7g2, d2ja7h1, d2ja7i1, d2ja7i2, d2ja7j1, d2ja7k1, d2ja7m1, d2ja7n1, d2ja7o1, d2ja7o2, d2ja7p1, d2ja7q1, d2ja7q2, d2ja7r1, d2ja7s1, d2ja7s2, d2ja7t1, d2ja7u1, d2ja7u2, d2ja7v1, d2ja7w1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with bru, mg, tt, zn

Domain d2ja7x1: 2ja7 X:25-70 [138221]
Other proteins in same PDB: d2ja7a1, d2ja7b1, d2ja7c1, d2ja7c2, d2ja7d1, d2ja7e1, d2ja7e2, d2ja7f1, d2ja7g1, d2ja7g2, d2ja7h1, d2ja7i1, d2ja7i2, d2ja7j1, d2ja7k1, d2ja7m1, d2ja7n1, d2ja7o1, d2ja7o2, d2ja7p1, d2ja7q1, d2ja7q2, d2ja7r1, d2ja7s1, d2ja7s2, d2ja7t1, d2ja7u1, d2ja7u2, d2ja7v1, d2ja7w1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with bru, mg, tt, zn

Domain(s) for 2ja8:

Domain d2ja8l1: 2ja8 L:25-70 [138237]
Other proteins in same PDB: d2ja8a1, d2ja8b1, d2ja8c1, d2ja8c2, d2ja8d1, d2ja8e1, d2ja8e2, d2ja8f1, d2ja8g1, d2ja8g2, d2ja8h1, d2ja8i1, d2ja8i2, d2ja8j1, d2ja8k1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with bru, mg, tt, zn

Domain(s) for 2nvq:

Domain d2nvql1: 2nvq L:25-70 [138646]
Other proteins in same PDB: d2nvqa1, d2nvqb1, d2nvqc1, d2nvqc2, d2nvqe1, d2nvqe2, d2nvqf1, d2nvqh1, d2nvqi1, d2nvqi2, d2nvqj1, d2nvqk1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with dut, mg, zn

Domain(s) for 2nvt:

Domain d2nvtl1: 2nvt L:25-70 [138659]
Other proteins in same PDB: d2nvta1, d2nvtb1, d2nvtc1, d2nvtc2, d2nvte1, d2nvte2, d2nvtf1, d2nvth1, d2nvti1, d2nvti2, d2nvtj1, d2nvtk1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with g2p, mg, zn

Domain(s) for 2nvx:

Domain d2nvxl1: 2nvx L:25-70 [138679]
Other proteins in same PDB: d2nvxa1, d2nvxb1, d2nvxc1, d2nvxc2, d2nvxe1, d2nvxe2, d2nvxf1, d2nvxh1, d2nvxi1, d2nvxi2, d2nvxj1, d2nvxk1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with dut, mg, zn

Domain(s) for 2nvy:

Domain d2nvyl1: 2nvy L:25-70 [138692]
Other proteins in same PDB: d2nvya1, d2nvyb1, d2nvyc1, d2nvyc2, d2nvye1, d2nvye2, d2nvyf1, d2nvyh1, d2nvyi1, d2nvyi2, d2nvyj1, d2nvyk1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with mn, zn

Domain(s) for 2nvz:

Domain d2nvzl1: 2nvz L:25-70 [138705]
Other proteins in same PDB: d2nvza1, d2nvzb1, d2nvzc1, d2nvzc2, d2nvze1, d2nvze2, d2nvzf1, d2nvzh1, d2nvzi1, d2nvzi2, d2nvzj1, d2nvzk1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with mg, utp, zn

Domain(s) for 2yu9:

Domain d2yu9l1: 2yu9 L:25-70 [140076]
Other proteins in same PDB: d2yu9a1, d2yu9b1, d2yu9c1, d2yu9c2, d2yu9e1, d2yu9e2, d2yu9f1, d2yu9h1, d2yu9i1, d2yu9i2, d2yu9j1, d2yu9k1
automatically matched to d1i3ql_
complexed with mg, utp, zn

More info for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from g.41.9.2 RBP12 subunit of RNA polymerase II

Timeline for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from g.41.9.2 RBP12 subunit of RNA polymerase II:

Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from g.41.9.2 RBP12 subunit of RNA polymerase II first appeared in SCOP 1.57
Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from g.41.9.2 RBP12 subunit of RNA polymerase II appears in SCOP 1.71
Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from g.41.9.2 RBP12 subunit of RNA polymerase II appears in SCOP 1.75
Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from g.41.9.2 RBP12 subunit of RNA polymerase II appears in the current release, SCOPe 2.08