Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae)

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 621190Class g: Small proteins [56992] (79 folds)
  3. 624613Fold g.41: Rubredoxin-like [57769] (14 superfamilies)
    metal(zinc or iron)-bound fold; sequence contains two CX(n)C motifs, in most cases n = 2
  4. 624668Superfamily g.41.3: Zinc beta-ribbon [57783] (4 families) (S)
  5. 624669Family g.41.3.1: Transcriptional factor domain [57784] (4 proteins)
  6. 624670Protein RBP9 subunit of RNA polymerase II [57787] (2 species)
    contains two differently decorated domains of this fold
  7. 624673Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64575] (9 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae):

  1. Domain(s) for 1i3q:
    1. 624680Domain d1i3qi1: 1i3q I:1-49 [61615]
      Other proteins in same PDB: d1i3qa_, d1i3qb_, d1i3qc1, d1i3qc2, d1i3qe1, d1i3qe2, d1i3qf_, d1i3qh_, d1i3qj_, d1i3qk_, d1i3ql_
    2. 624681Domain d1i3qi2: 1i3q I:50-122 [61616]
      Other proteins in same PDB: d1i3qa_, d1i3qb_, d1i3qc1, d1i3qc2, d1i3qe1, d1i3qe2, d1i3qf_, d1i3qh_, d1i3qj_, d1i3qk_, d1i3ql_
      complexed with mg, zn
  2. Domain(s) for 1i50:
    1. 624676Domain d1i50i1: 1i50 I:1-49 [61762]
      Other proteins in same PDB: d1i50a_, d1i50b_, d1i50c1, d1i50c2, d1i50e1, d1i50e2, d1i50f_, d1i50h_, d1i50j_, d1i50k_, d1i50l_
    2. 624677Domain d1i50i2: 1i50 I:50-122 [61763]
      Other proteins in same PDB: d1i50a_, d1i50b_, d1i50c1, d1i50c2, d1i50e1, d1i50e2, d1i50f_, d1i50h_, d1i50j_, d1i50k_, d1i50l_
      complexed with mn, zn
  3. Domain(s) for 1i6h:
    1. 624688Domain d1i6hi1: 1i6h I:2-49 [61839]
      Other proteins in same PDB: d1i6ha_, d1i6hb_, d1i6hc1, d1i6hc2, d1i6he1, d1i6he2, d1i6hf_, d1i6hh_, d1i6hj_, d1i6hk_, d1i6hl_
    2. 624689Domain d1i6hi2: 1i6h I:50-120 [61840]
      Other proteins in same PDB: d1i6ha_, d1i6hb_, d1i6hc1, d1i6hc2, d1i6he1, d1i6he2, d1i6hf_, d1i6hh_, d1i6hj_, d1i6hk_, d1i6hl_
      complexed with mg, zn
  4. Domain(s) for 1k83:
    1. 624678Domain d1k83i1: 1k83 I:1-49 [68283]
      Other proteins in same PDB: d1k83a_, d1k83b_, d1k83c1, d1k83c2, d1k83e1, d1k83e2, d1k83f_, d1k83h_, d1k83j_, d1k83k_, d1k83l_
    2. 624679Domain d1k83i2: 1k83 I:50-122 [68284]
      Other proteins in same PDB: d1k83a_, d1k83b_, d1k83c1, d1k83c2, d1k83e1, d1k83e2, d1k83f_, d1k83h_, d1k83j_, d1k83k_, d1k83l_
      complexed with ilx, mn, trx, zn
  5. Domain(s) for 1twa:
    1. 624684Domain d1twai1: 1twa I:1-49 [112704]
      Other proteins in same PDB: d1twaa_, d1twab_, d1twac1, d1twac2, d1twae1, d1twae2, d1twaf_, d1twah_, d1twaj_, d1twak_, d1twal_
    2. 624685Domain d1twai2: 1twa I:50-121 [112705]
      Other proteins in same PDB: d1twaa_, d1twab_, d1twac1, d1twac2, d1twae1, d1twae2, d1twaf_, d1twah_, d1twaj_, d1twak_, d1twal_
      complexed with atp, mn, zn
  6. Domain(s) for 1twc:
    1. 624682Domain d1twci1: 1twc I:1-49 [112719]
      Other proteins in same PDB: d1twca_, d1twcb_, d1twcc1, d1twcc2, d1twce1, d1twce2, d1twcf_, d1twch_, d1twcj_, d1twck_, d1twcl_
    2. 624683Domain d1twci2: 1twc I:50-121 [112720]
      Other proteins in same PDB: d1twca_, d1twcb_, d1twcc1, d1twcc2, d1twce1, d1twce2, d1twcf_, d1twch_, d1twcj_, d1twck_, d1twcl_
      complexed with gtp, mn, zn
  7. Domain(s) for 1twf:
    1. 624674Domain d1twfi1: 1twf I:1-49 [112733]
      Other proteins in same PDB: d1twfa_, d1twfb_, d1twfc1, d1twfc2, d1twfe1, d1twfe2, d1twff_, d1twfh_, d1twfj_, d1twfk_, d1twfl_
    2. 624675Domain d1twfi2: 1twf I:50-121 [112734]
      Other proteins in same PDB: d1twfa_, d1twfb_, d1twfc1, d1twfc2, d1twfe1, d1twfe2, d1twff_, d1twfh_, d1twfj_, d1twfk_, d1twfl_
      complexed with mn, utp, zn
  8. Domain(s) for 1twg:
    1. 624690Domain d1twgi1: 1twg I:1-49 [112746]
      Other proteins in same PDB: d1twga_, d1twgb_, d1twgc1, d1twgc2, d1twge1, d1twge2, d1twgf_, d1twgh_, d1twgj_, d1twgk_, d1twgl_
    2. 624691Domain d1twgi2: 1twg I:50-121 [112747]
      Other proteins in same PDB: d1twga_, d1twgb_, d1twgc1, d1twgc2, d1twge1, d1twge2, d1twgf_, d1twgh_, d1twgj_, d1twgk_, d1twgl_
      complexed with ctp, mn, zn
  9. Domain(s) for 1twh:
    1. 624686Domain d1twhi1: 1twh I:1-49 [112759]
      Other proteins in same PDB: d1twha_, d1twhb_, d1twhc1, d1twhc2, d1twhe1, d1twhe2, d1twhf_, d1twhh_, d1twhj_, d1twhk_, d1twhl_
    2. 624687Domain d1twhi2: 1twh I:50-121 [112760]
      Other proteins in same PDB: d1twha_, d1twhb_, d1twhc1, d1twhc2, d1twhe1, d1twhe2, d1twhf_, d1twhh_, d1twhj_, d1twhk_, d1twhl_
      complexed with atp, mn, zn

More info for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from g.41.3.1 RBP9 subunit of RNA polymerase II

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