Class e: Multi-domain proteins (alpha and beta) [56572] (66 folds) |
Fold e.29: beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase [64483] (1 superfamily) Multidomain subunits of complex domain organization |
Superfamily e.29.1: beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase [64484] (2 families) The catalytic site is formed by the association of two double-psi beta-barrel domains, one from each subunit |
Family e.29.1.1: RNA-polymerase beta [64485] (3 proteins) |
Protein RNA-polymerase beta [64488] (2 species) |
Thermus aquaticus [TaxId:271] [64489] (4 PDB entries) |
Thermus thermophilus [TaxId:274] [75609] (9 PDB entries) Uniprot Q8RQE9; part of multichain biological unit |
Domain d1iw7c_: 1iw7 C: [71474] Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3 complexed with mg, pb |
Domain d1iw7m_: 1iw7 M: [71482] Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3 complexed with mg, pb |
Domain d1smyc_: 1smy C: [105778] Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3 complexed with g4p, mg, zn |
Domain d1smym_: 1smy M: [105788] Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3 complexed with g4p, mg, zn |
Domain d1zyrc1: 1zyr C:1-1119 [125853] Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3 automatically matched to d1iw7c_ protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn |
Domain d1zyrm1: 1zyr M:1-1119 [125863] Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3 automatically matched to d1iw7c_ protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn |
Domain d2cw0c1: 2cw0 C:1-1119 [130902] Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3 automatically matched to d1iw7c_ complexed with mg, zn |
Domain d2cw0m1: 2cw0 M:1-1119 [130912] Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3 automatically matched to d1iw7c_ complexed with mg, zn |
Domain d2o5jc1: 2o5j C:1-1119 [148605] Other proteins in same PDB: d2o5jd1, d2o5jn1 automatically matched to d1iw7c_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with apc, mg, zn |
Domain d2o5jm1: 2o5j M:1-1119 [148607] Other proteins in same PDB: d2o5jd1, d2o5jn1 automatically matched to d1iw7c_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with apc, mg, zn |
Domain d2ppbc1: 2ppb C:1-1119 [149753] Other proteins in same PDB: d2ppbd1, d2ppbn1 automatically matched to d1iw7c_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with apc, mg, std, zn |
Domain d2ppbm1: 2ppb M:1-1119 [149755] Other proteins in same PDB: d2ppbd1, d2ppbn1 automatically matched to d1iw7c_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with apc, mg, std, zn |
Domain d3dxjc1: 3dxj C:1-1119 [157927] Other proteins in same PDB: d3dxjd1, d3dxje1, d3dxjn1, d3dxjo1 automatically matched to d1iw7c_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mpd, ne6, po4, zn |
Domain d3dxjm1: 3dxj M:1-1119 [157930] Other proteins in same PDB: d3dxjd1, d3dxje1, d3dxjn1, d3dxjo1 automatically matched to d1iw7c_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mpd, ne6, po4, zn |
Domain d4g7hc_: 4g7h C: [192523] Other proteins in same PDB: d4g7ha1, d4g7ha2, d4g7hb1, d4g7hb2, d4g7hd_, d4g7he_, d4g7hk1, d4g7hk2, d4g7hl1, d4g7hl2, d4g7hn_, d4g7ho_ automated match to d1smyc_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn |
Domain d4g7hm_: 4g7h M: [192829] Other proteins in same PDB: d4g7ha1, d4g7ha2, d4g7hb1, d4g7hb2, d4g7hd_, d4g7he_, d4g7hk1, d4g7hk2, d4g7hl1, d4g7hl2, d4g7hn_, d4g7ho_ automated match to d1smyc_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn |
Domain d4g7oc_: 4g7o C: [192522] Other proteins in same PDB: d4g7oa1, d4g7oa2, d4g7ob1, d4g7ob2, d4g7od_, d4g7oe_, d4g7ok1, d4g7ok2, d4g7ol1, d4g7ol2, d4g7on_, d4g7oo_ automated match to d1smyc_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn |
Domain d4g7om_: 4g7o M: [192828] Other proteins in same PDB: d4g7oa1, d4g7oa2, d4g7ob1, d4g7ob2, d4g7od_, d4g7oe_, d4g7ok1, d4g7ok2, d4g7ol1, d4g7ol2, d4g7on_, d4g7oo_ automated match to d1smyc_ protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn |
Timeline for Protein RNA-polymerase beta from e.29.1.1: RNA-polymerase beta: