Lineage for Protein: RNA-polymerase beta

  1. Root: SCOP 1.75
  2. 883176Class e: Multi-domain proteins (alpha and beta) [56572] (66 folds)
  3. 885463Fold e.29: beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase [64483] (1 superfamily)
    Multidomain subunits of complex domain organization
  4. 885464Superfamily e.29.1: beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase [64484] (2 families) (S)
    The catalytic site is formed by the association of two double-psi beta-barrel domains, one from each subunit
  5. 885465Family e.29.1.1: RNA-polymerase beta [64485] (2 proteins)
  6. 885498Protein RNA-polymerase beta [64488] (2 species)

Species:

  1. 885499Thermus aquaticus [TaxId:271] [64489] (4 PDB entries)
    1. Domain for 1i6v:
    2. Domain for 1ynj:
    3. Domain for 1ynn:
    4. Domain for 2gho:
  2. 885504Thermus thermophilus [TaxId:274] [75609] (13 PDB entries)
    Uniprot Q8RQE9; part of multichain biological unit
    1. Domains for 1iw7:
      1. 885515Domain d1iw7c_: 1iw7 C: [71474]
        Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
      2. 885516Domain d1iw7m_: 1iw7 M: [71482]
        Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
        complexed with mg, pb
    2. Domains for 1smy:
      1. 885505Domain d1smyc_: 1smy C: [105778]
        Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
      2. 885506Domain d1smym_: 1smy M: [105788]
        Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
        complexed with g4p, mg, zn
    3. Domains for 1zyr:
      1. 885527Domain d1zyrc1: 1zyr C:1-1119 [125853]
        Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, std, zn
      2. 885528Domain d1zyrm1: 1zyr M:1-1119 [125863]
        Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, std, zn
    4. Domains for 2a68:
      1. 885509Domain d2a68c1: 2a68 C:1-1119 [126195]
        Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68d1, d2a68e1, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68n1, d2a68o1, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, rbt, zn
      2. 885510Domain d2a68m1: 2a68 M:1-1119 [126205]
        Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68d1, d2a68e1, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68n1, d2a68o1, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, rbt, zn
    5. Domains for 2a69:
      1. 885511Domain d2a69c1: 2a69 C:1-1119 [126215]
        Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69d1, d2a69e1, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69n1, d2a69o1, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, rpt, zn
      2. 885512Domain d2a69m1: 2a69 M:1-1119 [126225]
        Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69d1, d2a69e1, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69n1, d2a69o1, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, rpt, zn
    6. Domains for 2a6e:
      1. 885521Domain d2a6ec1: 2a6e C:1-1119 [126244]
        Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ed1, d2a6ee1, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6en1, d2a6eo1, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, zn
      2. 885522Domain d2a6em1: 2a6e M:1-1119 [126254]
        Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ed1, d2a6ee1, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6en1, d2a6eo1, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, zn
    7. Domains for 2a6h:
      1. 885507Domain d2a6hc1: 2a6h C:1-1119 [126264]
        Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hd1, d2a6he1, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hn1, d2a6ho1, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, std, zn
      2. 885508Domain d2a6hm1: 2a6h M:1-1119 [126274]
        Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hd1, d2a6he1, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hn1, d2a6ho1, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, std, zn
    8. Domains for 2be5:
      1. 885513Domain d2be5c1: 2be5 C:1-1119 [128355]
        Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5d1, d2be5e1, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5n1, d2be5o1, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, tgt, zn
      2. 885514Domain d2be5m1: 2be5 M:1-1119 [128365]
        Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5d1, d2be5e1, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5n1, d2be5o1, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, tgt, zn
    9. Domains for 2cw0:
      1. 885529Domain d2cw0c1: 2cw0 C:1-1119 [130902]
        Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, zn
      2. 885530Domain d2cw0m1: 2cw0 M:1-1119 [130912]
        Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, zn
    10. Domains for 2o5i:
      1. 885517Domain d2o5ic1: 2o5i C:1-1119 [148600]
        Other proteins in same PDB: d2o5id1, d2o5ie1, d2o5in1
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, zn
      2. 885518Domain d2o5im1: 2o5i M:1-1119 [148603]
        Other proteins in same PDB: d2o5id1, d2o5ie1, d2o5in1
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, zn
    11. Domains for 2o5j:
      1. 885523Domain d2o5jc1: 2o5j C:1-1119 [148605]
        Other proteins in same PDB: d2o5jd1, d2o5jn1
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with apc, mg, zn
      2. 885524Domain d2o5jm1: 2o5j M:1-1119 [148607]
        Other proteins in same PDB: d2o5jd1, d2o5jn1
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with apc, mg, zn
    12. Domains for 2ppb:
      1. 885525Domain d2ppbc1: 2ppb C:1-1119 [149753]
        Other proteins in same PDB: d2ppbd1, d2ppbn1
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with apc, mg, std, zn
      2. 885526Domain d2ppbm1: 2ppb M:1-1119 [149755]
        Other proteins in same PDB: d2ppbd1, d2ppbn1
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with apc, mg, std, zn
    13. Domains for 3dxj:
      1. 885519Domain d3dxjc1: 3dxj C:1-1119 [157927]
        Other proteins in same PDB: d3dxjd1, d3dxje1, d3dxjn1, d3dxjo1
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, mpd, ne6, po4, zn
      2. 885520Domain d3dxjm1: 3dxj M:1-1119 [157930]
        Other proteins in same PDB: d3dxjd1, d3dxje1, d3dxjn1, d3dxjo1
        automatically matched to d1iw7c_
        complexed with mg, mpd, ne6, po4, zn

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