Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae)

  1. Root: SCOP 1.69
  2. 496776Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (279 folds)
  3. 515367Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 515368Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (2 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 515369Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (4 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 515420Protein Cytochrome bc1 core subunit 2 [63409] (3 species)
  7. 515421Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64305] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae):

  1. Domain(s) for 1ezv:
    1. 515422Domain d1ezvb1: 1ezv B:17-218 [59543]
      Other proteins in same PDB: d1ezva1, d1ezva2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
    2. 515423Domain d1ezvb2: 1ezv B:219-368 [59544]
      Other proteins in same PDB: d1ezva1, d1ezva2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
  2. Domain(s) for 1kb9:
    1. 515424Domain d1kb9b1: 1kb9 B:17-218 [77313]
      Other proteins in same PDB: d1kb9a1, d1kb9a2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
    2. 515425Domain d1kb9b2: 1kb9 B:219-368 [77314]
      Other proteins in same PDB: d1kb9a1, d1kb9a2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
  3. Domain(s) for 1kyo:
    1. 515428Domain d1kyob1: 1kyo B:17-218 [73251]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
    2. 515429Domain d1kyob2: 1kyo B:219-368 [73252]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
    3. 515430Domain d1kyom1: 1kyo M:17-218 [73266]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
    4. 515431Domain d1kyom2: 1kyo M:219-368 [73267]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
  4. Domain(s) for 1p84:
    1. 515426Domain d1p84b1: 1p84 B:17-218 [87852]
      Other proteins in same PDB: d1p84a1, d1p84a2, d1p84c1, d1p84c2, d1p84d1, d1p84d2, d1p84e1, d1p84e2, d1p84f_, d1p84g_, d1p84h_, d1p84i_, d1p84j_, d1p84k_
    2. 515427Domain d1p84b2: 1p84 B:219-368 [87853]
      Other proteins in same PDB: d1p84a1, d1p84a2, d1p84c1, d1p84c2, d1p84d1, d1p84d2, d1p84e1, d1p84e2, d1p84f_, d1p84g_, d1p84h_, d1p84i_, d1p84j_, d1p84k_

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