Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.03
  2. 1396887Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 1444881Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 1444882Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (3 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 1444883Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (6 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 1444884Protein Cytochrome bc1 core subunit 1 [63408] (3 species)
  7. 1444885Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64304] (7 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 1ezv:
    1. 1444894Domain d1ezva1: 1ezv A:27-239 [59541]
      Other proteins in same PDB: d1ezvb1, d1ezvb2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
      complexed with fes, hem, sma, uq6
    2. 1444895Domain d1ezva2: 1ezv A:240-456 [59542]
      Other proteins in same PDB: d1ezvb1, d1ezvb2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
      complexed with fes, hem, sma, uq6
  2. Domain(s) for 1kb9:
    1. 1444890Domain d1kb9a1: 1kb9 A:27-239 [77311]
      Other proteins in same PDB: d1kb9b1, d1kb9b2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
      complexed with cdl, fes, hem, pcf, pef, pie, sma, umq, uq6
    2. 1444891Domain d1kb9a2: 1kb9 A:240-457 [77312]
      Other proteins in same PDB: d1kb9b1, d1kb9b2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
      complexed with cdl, fes, hem, pcf, pef, pie, sma, umq, uq6
  3. Domain(s) for 1kyo:
    1. 1444902Domain d1kyoa1: 1kyo A:27-239 [73249]
      Other proteins in same PDB: d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      complexed with fes, hem, sma
    2. 1444903Domain d1kyoa2: 1kyo A:240-456 [73250]
      Other proteins in same PDB: d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      complexed with fes, hem, sma
    3. 1444904Domain d1kyol1: 1kyo L:27-239 [73264]
      Other proteins in same PDB: d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      complexed with fes, hem, sma
    4. 1444905Domain d1kyol2: 1kyo L:240-456 [73265]
      Other proteins in same PDB: d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      complexed with fes, hem, sma
  4. Domain(s) for 1p84:
    1. 1444900Domain d1p84a1: 1p84 A:27-239 [87850]
      Other proteins in same PDB: d1p84b1, d1p84b2, d1p84c1, d1p84c2, d1p84d1, d1p84d2, d1p84e1, d1p84e2, d1p84f_, d1p84g_, d1p84h_, d1p84i_, d1p84j_, d1p84k_
      complexed with 3pe, 3ph, cdl, dbt, fes, hem, pc1, umq, uq6
    2. 1444901Domain d1p84a2: 1p84 A:240-457 [87851]
      Other proteins in same PDB: d1p84b1, d1p84b2, d1p84c1, d1p84c2, d1p84d1, d1p84d2, d1p84e1, d1p84e2, d1p84f_, d1p84g_, d1p84h_, d1p84i_, d1p84j_, d1p84k_
      complexed with 3pe, 3ph, cdl, dbt, fes, hem, pc1, umq, uq6
  5. Domain(s) for 2ibz:
    1. 1444892Domain d2ibza1: 2ibz A:27-239 [137215]
      Other proteins in same PDB: d2ibzb1, d2ibzb2, d2ibzc1, d2ibzc2, d2ibzd1, d2ibzd2, d2ibze1, d2ibze2, d2ibzf_, d2ibzg_, d2ibzh_, d2ibzi_, d2ibzx_, d2ibzy_
      automated match to d1kb9a1
      complexed with fes, hem, sma, uq6
    2. 1444893Domain d2ibza2: 2ibz A:240-457 [137216]
      Other proteins in same PDB: d2ibzb1, d2ibzb2, d2ibzc1, d2ibzc2, d2ibzd1, d2ibzd2, d2ibze1, d2ibze2, d2ibzf_, d2ibzg_, d2ibzh_, d2ibzi_, d2ibzx_, d2ibzy_
      automated match to d1kb9a2
      complexed with fes, hem, sma, uq6
  6. Domain(s) for 3cx5:
    1. 1444886Domain d3cx5a1: 3cx5 A:27-239 [157076]
      Other proteins in same PDB: d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
      automated match to d1kb9a1
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    2. 1444887Domain d3cx5a2: 3cx5 A:240-457 [157077]
      Other proteins in same PDB: d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
      automated match to d1kb9a2
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    3. 1444888Domain d3cx5l1: 3cx5 L:27-239 [157092]
      Other proteins in same PDB: d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
      automated match to d1kb9a1
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    4. 1444889Domain d3cx5l2: 3cx5 L:240-457 [157093]
      Other proteins in same PDB: d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
      automated match to d1kb9a2
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
  7. Domain(s) for 3cxh:
    1. 1444896Domain d3cxha1: 3cxh A:27-239 [157109]
      Other proteins in same PDB: d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
      automated match to d1kb9a1
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
    2. 1444897Domain d3cxha2: 3cxh A:240-457 [157110]
      Other proteins in same PDB: d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
      automated match to d1kb9a2
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
    3. 1444898Domain d3cxhl1: 3cxh L:27-239 [157125]
      Other proteins in same PDB: d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
      automated match to d1kb9a1
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
    4. 1444899Domain d3cxhl2: 3cxh L:240-457 [157126]
      Other proteins in same PDB: d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
      automated match to d1kb9a2
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq

More info for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from d.185.1.1 Cytochrome bc1 core subunit 1

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