Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2170735Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2237726Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 2237727Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (3 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 2237728Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (7 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 2237877Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain [64302] (1 species)
  7. 2237878Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64303] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 1hr6:
    1. 2237879Domain d1hr6a1: 1hr6 A:14-233 [61164]
      Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
      complexed with epe, zn
    2. 2237880Domain d1hr6a2: 1hr6 A:234-470 [61165]
      Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
      complexed with epe, zn
    3. 2237881Domain d1hr6c1: 1hr6 C:16-233 [61168]
      Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
      complexed with epe, zn
    4. 2237882Domain d1hr6c2: 1hr6 C:234-468 [61169]
      Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
      complexed with epe, zn
    5. 2237883Domain d1hr6e1: 1hr6 E:14-233 [61172]
      Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
      complexed with epe, zn
    6. 2237884Domain d1hr6e2: 1hr6 E:234-468 [61173]
      Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
      complexed with epe, zn
    7. 2237885Domain d1hr6g1: 1hr6 G:14-233 [61176]
      Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
      complexed with epe, zn
    8. 2237886Domain d1hr6g2: 1hr6 G:234-470 [61177]
      Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
      complexed with epe, zn
  2. Domain(s) for 1hr7:
    1. 2237887Domain d1hr7a1: 1hr7 A:14-233 [61180]
      Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
      complexed with zn; mutant
    2. 2237888Domain d1hr7a2: 1hr7 A:234-470 [61181]
      Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
      complexed with zn; mutant
    3. 2237889Domain d1hr7c1: 1hr7 C:16-233 [61184]
      Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
      complexed with zn; mutant
    4. 2237890Domain d1hr7c2: 1hr7 C:234-468 [61185]
      Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
      complexed with zn; mutant
    5. 2237891Domain d1hr7e1: 1hr7 E:14-233 [61188]
      Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
      complexed with zn; mutant
    6. 2237892Domain d1hr7e2: 1hr7 E:234-468 [61189]
      Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
      complexed with zn; mutant
    7. 2237893Domain d1hr7g1: 1hr7 G:14-233 [61192]
      Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
      complexed with zn; mutant
    8. 2237894Domain d1hr7g2: 1hr7 G:234-467 [61193]
      Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
      complexed with zn; mutant
  3. Domain(s) for 1hr8:
    1. 2237895Domain d1hr8a1: 1hr8 A:14-233 [61196]
      Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
      complexed with epe, zn; mutant
    2. 2237896Domain d1hr8a2: 1hr8 A:234-470 [61197]
      Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
      complexed with epe, zn; mutant
    3. 2237897Domain d1hr8c1: 1hr8 C:16-233 [61200]
      Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
      complexed with epe, zn; mutant
    4. 2237898Domain d1hr8c2: 1hr8 C:234-468 [61201]
      Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
      complexed with epe, zn; mutant
    5. 2237899Domain d1hr8e1: 1hr8 E:14-233 [61204]
      Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
      complexed with epe, zn; mutant
    6. 2237900Domain d1hr8e2: 1hr8 E:234-468 [61205]
      Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
      complexed with epe, zn; mutant
    7. 2237901Domain d1hr8g1: 1hr8 G:14-233 [61208]
      Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
      complexed with epe, zn; mutant
    8. 2237902Domain d1hr8g2: 1hr8 G:234-470 [61209]
      Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
      complexed with epe, zn; mutant
  4. Domain(s) for 1hr9:
    1. 2237903Domain d1hr9a1: 1hr9 A:14-233 [61212]
      Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
      complexed with epe, zn; mutant
    2. 2237904Domain d1hr9a2: 1hr9 A:234-470 [61213]
      Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
      complexed with epe, zn; mutant
    3. 2237905Domain d1hr9c1: 1hr9 C:16-233 [61216]
      Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
      complexed with epe, zn; mutant
    4. 2237906Domain d1hr9c2: 1hr9 C:234-468 [61217]
      Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
      complexed with epe, zn; mutant
    5. 2237907Domain d1hr9e1: 1hr9 E:14-233 [61220]
      Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
      complexed with epe, zn; mutant
    6. 2237908Domain d1hr9e2: 1hr9 E:234-468 [61221]
      Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
      complexed with epe, zn; mutant
    7. 2237909Domain d1hr9g1: 1hr9 G:14-233 [61224]
      Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
      complexed with epe, zn; mutant
    8. 2237910Domain d1hr9g2: 1hr9 G:234-468 [61225]
      Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
      complexed with epe, zn; mutant

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