Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2494617Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
  3. 2562006Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 2562007Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (3 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 2562008Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (7 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 2562191Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) beta chain [64300] (1 species)
  7. 2562192Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64301] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 1hr6:
    1. 2562193Domain d1hr6b1: 1hr6 B:24-245 [61166]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6d3, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6f3, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
    2. 2562194Domain d1hr6b2: 1hr6 B:246-462 [61167]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6d3, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6f3, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
    3. 2562195Domain d1hr6d1: 1hr6 D:21-245 [61170]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6d3, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6f3, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
    4. 2562196Domain d1hr6d2: 1hr6 D:246-462 [61171]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6d3, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6f3, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
    5. 2562197Domain d1hr6f1: 1hr6 F:21-245 [61174]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6d3, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6f3, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
    6. 2562198Domain d1hr6f2: 1hr6 F:246-462 [61175]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6d3, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6f3, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
    7. 2562199Domain d1hr6h1: 1hr6 H:23-245 [61178]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6d3, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6f3, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
    8. 2562200Domain d1hr6h2: 1hr6 H:246-462 [61179]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6d3, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6f3, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
  2. Domain(s) for 1hr7:
    1. 2562201Domain d1hr7b1: 1hr7 B:24-245 [61182]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
    2. 2562202Domain d1hr7b2: 1hr7 B:246-462 [61183]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
    3. 2562203Domain d1hr7d1: 1hr7 D:22-245 [61186]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
    4. 2562204Domain d1hr7d2: 1hr7 D:246-462 [61187]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
    5. 2562205Domain d1hr7f1: 1hr7 F:23-245 [61190]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
    6. 2562206Domain d1hr7f2: 1hr7 F:246-462 [61191]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
    7. 2562207Domain d1hr7h1: 1hr7 H:23-245 [61194]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
    8. 2562208Domain d1hr7h2: 1hr7 H:246-462 [61195]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
  3. Domain(s) for 1hr8:
    1. 2562209Domain d1hr8b1: 1hr8 B:24-245 [61198]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8d3, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8f3, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
    2. 2562210Domain d1hr8b2: 1hr8 B:246-462 [61199]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8d3, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8f3, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
    3. 2562211Domain d1hr8d1: 1hr8 D:21-245 [61202]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8d3, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8f3, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
    4. 2562212Domain d1hr8d2: 1hr8 D:246-462 [61203]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8d3, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8f3, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
    5. 2562213Domain d1hr8f1: 1hr8 F:21-245 [61206]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8d3, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8f3, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
    6. 2562214Domain d1hr8f2: 1hr8 F:246-462 [61207]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8d3, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8f3, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
    7. 2562215Domain d1hr8h1: 1hr8 H:22-245 [61210]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8d3, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8f3, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
    8. 2562216Domain d1hr8h2: 1hr8 H:246-462 [61211]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8d3, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8f3, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
  4. Domain(s) for 1hr9:
    1. 2562217Domain d1hr9b1: 1hr9 B:24-245 [61214]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9f3, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant
    2. 2562218Domain d1hr9b2: 1hr9 B:246-462 [61215]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9f3, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant
    3. 2562219Domain d1hr9d1: 1hr9 D:22-245 [61218]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9f3, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant
    4. 2562220Domain d1hr9d2: 1hr9 D:246-462 [61219]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9f3, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant
    5. 2562221Domain d1hr9f1: 1hr9 F:21-245 [61222]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9f3, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant
    6. 2562222Domain d1hr9f2: 1hr9 F:246-462 [61223]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9f3, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant
    7. 2562223Domain d1hr9h1: 1hr9 H:23-245 [61226]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9f3, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant
    8. 2562224Domain d1hr9h2: 1hr9 H:246-462 [61227]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9f3, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant

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