Lineage for Species: Mouse (Mus musculus)

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 570216Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (134 folds)
  3. 581392Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 581393Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (23 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 583379Family c.37.1.20: Extended AAA-ATPase domain [81269] (26 proteins)
    fold is similar to that of RecA, but lacks the last two strands, followed by a family-specific Arg-finger domain
  6. 583548Protein Membrane fusion ATPase VCP/p97 [64038] (1 species)
  7. 583549Species Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] [64039] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus):

  1. Domain(s) for 1e32:
  2. Domain(s) for 1oz4:
    1. 583553Domain d1oz4a2: 1oz4 A:201-470 [93794]
      Other proteins in same PDB: d1oz4a1, d1oz4a4, d1oz4b1, d1oz4b4, d1oz4c1, d1oz4c4
    2. 583554Domain d1oz4a3: 1oz4 A:471-763 [93795]
      Other proteins in same PDB: d1oz4a1, d1oz4a4, d1oz4b1, d1oz4b4, d1oz4c1, d1oz4c4
    3. 583555Domain d1oz4b2: 1oz4 B:201-470 [93798]
      Other proteins in same PDB: d1oz4a1, d1oz4a4, d1oz4b1, d1oz4b4, d1oz4c1, d1oz4c4
    4. 583556Domain d1oz4b3: 1oz4 B:471-763 [93799]
      Other proteins in same PDB: d1oz4a1, d1oz4a4, d1oz4b1, d1oz4b4, d1oz4c1, d1oz4c4
    5. 583557Domain d1oz4c2: 1oz4 C:201-470 [93802]
      Other proteins in same PDB: d1oz4a1, d1oz4a4, d1oz4b1, d1oz4b4, d1oz4c1, d1oz4c4
    6. 583558Domain d1oz4c3: 1oz4 C:471-763 [93803]
      Other proteins in same PDB: d1oz4a1, d1oz4a4, d1oz4b1, d1oz4b4, d1oz4c1, d1oz4c4
      complete low resolution structure
      complexed with adp, af3, zn
  3. Domain(s) for 1r7r:
    1. 583551Domain d1r7ra2: 1r7r A:201-470 [97204]
      Other proteins in same PDB: d1r7ra1, d1r7ra4
    2. 583552Domain d1r7ra3: 1r7r A:471-735 [97205]
      Other proteins in same PDB: d1r7ra1, d1r7ra4
      complexed with adp
  4. Domain(s) for 1s3s:
    1. 583559Domain d1s3sa2: 1s3s A:201-458 [98440]
      Other proteins in same PDB: d1s3sa1, d1s3sa3, d1s3sb1, d1s3sb3, d1s3sc1, d1s3sc3, d1s3sd1, d1s3sd3, d1s3se1, d1s3se3, d1s3sf1, d1s3sf3, d1s3sg_, d1s3sh_, d1s3si_
    2. 583560Domain d1s3sb2: 1s3s B:201-458 [98443]
      Other proteins in same PDB: d1s3sa1, d1s3sa3, d1s3sb1, d1s3sb3, d1s3sc1, d1s3sc3, d1s3sd1, d1s3sd3, d1s3se1, d1s3se3, d1s3sf1, d1s3sf3, d1s3sg_, d1s3sh_, d1s3si_
    3. 583561Domain d1s3sc2: 1s3s C:201-458 [98446]
      Other proteins in same PDB: d1s3sa1, d1s3sa3, d1s3sb1, d1s3sb3, d1s3sc1, d1s3sc3, d1s3sd1, d1s3sd3, d1s3se1, d1s3se3, d1s3sf1, d1s3sf3, d1s3sg_, d1s3sh_, d1s3si_
    4. 583562Domain d1s3sd2: 1s3s D:201-458 [98449]
      Other proteins in same PDB: d1s3sa1, d1s3sa3, d1s3sb1, d1s3sb3, d1s3sc1, d1s3sc3, d1s3sd1, d1s3sd3, d1s3se1, d1s3se3, d1s3sf1, d1s3sf3, d1s3sg_, d1s3sh_, d1s3si_
    5. 583563Domain d1s3se2: 1s3s E:201-458 [98452]
      Other proteins in same PDB: d1s3sa1, d1s3sa3, d1s3sb1, d1s3sb3, d1s3sc1, d1s3sc3, d1s3sd1, d1s3sd3, d1s3se1, d1s3se3, d1s3sf1, d1s3sf3, d1s3sg_, d1s3sh_, d1s3si_
    6. 583564Domain d1s3sf2: 1s3s F:201-458 [98455]
      Other proteins in same PDB: d1s3sa1, d1s3sa3, d1s3sb1, d1s3sb3, d1s3sc1, d1s3sc3, d1s3sd1, d1s3sd3, d1s3se1, d1s3se3, d1s3sf1, d1s3sf3, d1s3sg_, d1s3sh_, d1s3si_
      D1 domain from the N-D1 fragment
      complexed with adp

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