Lineage for Protein: gamma subunit of DNA polymerase III, N-domain

  1. Root: SCOPe 2.02
  2. 1143363Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (147 folds)
  3. 1162955Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 1162956Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (25 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 1166163Family c.37.1.20: Extended AAA-ATPase domain [81269] (29 proteins)
    fold is similar to that of RecA, but lacks the last two strands, followed by a family-specific Arg-finger domain
  6. 1166259Protein gamma subunit of DNA polymerase III, N-domain [64031] (2 species)

Species:

  1. 1166260Escherichia coli [TaxId:562] [64032] (3 PDB entries)
    Uniprot P06710 5-368
    1. Domains for 1jr3:
      1. 1166261Domain d1jr3a2: 1jr3 A:3-242 [63246]
        Other proteins in same PDB: d1jr3a1, d1jr3b1, d1jr3c1, d1jr3d1, d1jr3d2, d1jr3e1, d1jr3e2
        protein/DNA complex; complexed with so4, zn
      2. 1166262Domain d1jr3b2: 1jr3 B:4-242 [63248]
        Other proteins in same PDB: d1jr3a1, d1jr3b1, d1jr3c1, d1jr3d1, d1jr3d2, d1jr3e1, d1jr3e2
        protein/DNA complex; complexed with so4, zn
      3. 1166263Domain d1jr3c2: 1jr3 C:3-242 [63250]
        Other proteins in same PDB: d1jr3a1, d1jr3b1, d1jr3c1, d1jr3d1, d1jr3d2, d1jr3e1, d1jr3e2
        protein/DNA complex; complexed with so4, zn
    2. Domains for 1xxh:
      1. 1166264Domain d1xxhb2: 1xxh B:5-242 [116166]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb1, d1xxhc1, d1xxhd1, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg1, d1xxhh1, d1xxhi1, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      2. 1166265Domain d1xxhc2: 1xxh C:5-242 [116168]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb1, d1xxhc1, d1xxhd1, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg1, d1xxhh1, d1xxhi1, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      3. 1166266Domain d1xxhd2: 1xxh D:5-242 [116170]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb1, d1xxhc1, d1xxhd1, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg1, d1xxhh1, d1xxhi1, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      4. 1166267Domain d1xxhg2: 1xxh G:5-242 [116176]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb1, d1xxhc1, d1xxhd1, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg1, d1xxhh1, d1xxhi1, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      5. 1166268Domain d1xxhh2: 1xxh H:5-242 [116178]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb1, d1xxhc1, d1xxhd1, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg1, d1xxhh1, d1xxhi1, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      6. 1166269Domain d1xxhi2: 1xxh I:5-242 [116180]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb1, d1xxhc1, d1xxhd1, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg1, d1xxhh1, d1xxhi1, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
    3. Domains for 1xxi:
      1. 1166270Domain d1xxib2: 1xxi B:5-242 [116186]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib1, d1xxic1, d1xxid1, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig1, d1xxih1, d1xxii1, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      2. 1166271Domain d1xxic2: 1xxi C:5-242 [116188]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib1, d1xxic1, d1xxid1, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig1, d1xxih1, d1xxii1, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      3. 1166272Domain d1xxid2: 1xxi D:5-242 [116190]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib1, d1xxic1, d1xxid1, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig1, d1xxih1, d1xxii1, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      4. 1166273Domain d1xxig2: 1xxi G:5-242 [116196]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib1, d1xxic1, d1xxid1, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig1, d1xxih1, d1xxii1, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      5. 1166274Domain d1xxih2: 1xxi H:5-242 [116198]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib1, d1xxic1, d1xxid1, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig1, d1xxih1, d1xxii1, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      6. 1166275Domain d1xxii2: 1xxi I:5-242 [116200]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib1, d1xxic1, d1xxid1, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig1, d1xxih1, d1xxii1, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
  2. 1166276Thermotoga maritima [TaxId:2336] [142324] (1 PDB entry)
    Uniprot Q9WZM9 11-208

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