SCOPe 2.07: Species: Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]

Lineage for Species: Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]

Root: SCOPe 2.07
Class b: All beta proteins [48724] (178 folds)
Fold b.38: Sm-like fold [50181] (5 superfamilies)
core: barrel, open; n*=4, S*=8; meander; SH3-like topology
Superfamily b.38.1: Sm-like ribonucleoproteins [50182] (7 families)
Family b.38.1.1: Sm motif of small nuclear ribonucleoproteins, SNRNP [50183] (11 proteins)
forms homo and heteroheptameric ring structures
Pfam PF01423
Protein Archaeal homoheptameric Sm protein [63758] (6 species)
Species Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId:145262] [63759] (5 PDB entries)
MTH649, smap1

PDB entries in Species: Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]:

Domain(s) for 1i81:
1. Domain d1i81a_: 1i81 A: [61930]
2. Domain d1i81b_: 1i81 B: [61931]
3. Domain d1i81c_: 1i81 C: [61932]
4. Domain d1i81d_: 1i81 D: [61933]
5. Domain d1i81e_: 1i81 E: [61934]
6. Domain d1i81f_: 1i81 F: [61935]
7. Domain d1i81g_: 1i81 G: [61936]
Domain(s) for 1jbm:
1. Domain d1jbma1: 1jbm A:9-81 [84143]
  Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
  structural genomics
  complexed with acy, edo
2. Domain d1jbmb1: 1jbm B:10-81 [84144]
  Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
  structural genomics
  complexed with acy, edo
3. Domain d1jbmc1: 1jbm C:10-81 [84145]
  Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
  structural genomics
  complexed with acy, edo
4. Domain d1jbmd_: 1jbm D: [84146]
  Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
  structural genomics
  complexed with acy, edo
5. Domain d1jbme1: 1jbm E:9-81 [84147]
  Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
  structural genomics
  complexed with acy, edo
6. Domain d1jbmf1: 1jbm F:11-81 [84148]
  Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
  structural genomics
  complexed with acy, edo
7. Domain d1jbmg1: 1jbm G:12-81 [84149]
  Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
  structural genomics
  complexed with acy, edo
Domain(s) for 1jri:
1. Domain d1jria1: 1jri A:12-81 [67121]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
2. Domain d1jrib1: 1jri B:12-81 [67122]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
3. Domain d1jric1: 1jri C:9-81 [67123]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
4. Domain d1jrid1: 1jri D:11-81 [67124]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
5. Domain d1jrie1: 1jri E:9-81 [67125]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
6. Domain d1jrif1: 1jri F:11-81 [67126]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
7. Domain d1jrig1: 1jri G:9-81 [67127]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
8. Domain d1jrih1: 1jri H:10-81 [67128]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
9. Domain d1jrii1: 1jri I:12-81 [67129]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
10. Domain d1jrij_: 1jri J: [67130]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
11. Domain d1jrik_: 1jri K: [67131]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
12. Domain d1jril1: 1jri L:9-81 [67132]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
13. Domain d1jrim1: 1jri M:12-81 [67133]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo
14. Domain d1jrin1: 1jri N:9-81 [67134]
  Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
  complexed with cl, edo

Domain(s) for 1loj:

Domain d1loja1: 1loj A:9-80 [84650]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojb1: 1loj B:11-80 [84651]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojc1: 1loj C:11-80 [84652]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojd1: 1loj D:10-80 [84653]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1loje1: 1loj E:10-80 [84654]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojf1: 1loj F:10-80 [84655]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojg1: 1loj G:10-80 [84656]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojh1: 1loj H:10-80 [84657]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1loji1: 1loj I:10-80 [84658]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojj1: 1loj J:11-80 [84659]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojk1: 1loj K:10-80 [84660]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojl1: 1loj L:10-80 [84661]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojm1: 1loj M:11-80 [84662]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain d1lojn1: 1loj N:10-80 [84663]
Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
complexed with mpd, u, uri

Domain(s) for 1mgq:
1. Domain d1mgqa_: 1mgq A: [79099]
2. Domain d1mgqb_: 1mgq B: [79100]
3. Domain d1mgqc_: 1mgq C: [79101]
4. Domain d1mgqd_: 1mgq D: [79102]
5. Domain d1mgqe_: 1mgq E: [79103]
6. Domain d1mgqf_: 1mgq F: [79104]
7. Domain d1mgqg_: 1mgq G: [79105]

More info for Species Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId:145262] from b.38.1.1 Archaeal homoheptameric Sm protein

Timeline for Species Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId:145262] from b.38.1.1 Archaeal homoheptameric Sm protein:

Species Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId:145262] from b.38.1.1 Archaeal homoheptameric Sm protein first appeared in SCOP 1.57, called Species Archaeon Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId:145262] from b.38.1.1 Archaeal homoheptameric Sm protein
Species Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId:145262] from b.38.1.1 Archaeal homoheptameric Sm protein appears in SCOPe 2.06
Species Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId:145262] from b.38.1.1 Archaeal homoheptameric Sm protein appears in the current release, SCOPe 2.08