Lineage for Species: Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2344607Class b: All beta proteins [48724] (178 folds)
  3. 2380450Fold b.38: Sm-like fold [50181] (5 superfamilies)
    core: barrel, open; n*=4, S*=8; meander; SH3-like topology
  4. 2380451Superfamily b.38.1: Sm-like ribonucleoproteins [50182] (7 families) (S)
  5. 2380452Family b.38.1.1: Sm motif of small nuclear ribonucleoproteins, SNRNP [50183] (10 protein domains)
    forms homo and heteroheptameric ring structures
    Pfam PF01423
  6. 2380453Protein Archaeal homoheptameric Sm protein [63758] (6 species)
  7. 2380499Species Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId:145262] [63759] (5 PDB entries)
    MTH649, smap1

PDB entries in Species: Methanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]:

  1. Domain(s) for 1i81:
    1. 2380528Domain d1i81a_: 1i81 A: [61930]
    2. 2380529Domain d1i81b_: 1i81 B: [61931]
    3. 2380530Domain d1i81c_: 1i81 C: [61932]
    4. 2380531Domain d1i81d_: 1i81 D: [61933]
    5. 2380532Domain d1i81e_: 1i81 E: [61934]
    6. 2380533Domain d1i81f_: 1i81 F: [61935]
    7. 2380534Domain d1i81g_: 1i81 G: [61936]
  2. Domain(s) for 1jbm:
    1. 2380507Domain d1jbma1: 1jbm A:9-81 [84143]
      Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
      structural genomics
      complexed with acy, edo
    2. 2380508Domain d1jbmb1: 1jbm B:10-81 [84144]
      Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
      structural genomics
      complexed with acy, edo
    3. 2380509Domain d1jbmc1: 1jbm C:10-81 [84145]
      Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
      structural genomics
      complexed with acy, edo
    4. 2380510Domain d1jbmd_: 1jbm D: [84146]
      Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
      structural genomics
      complexed with acy, edo
    5. 2380511Domain d1jbme1: 1jbm E:9-81 [84147]
      Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
      structural genomics
      complexed with acy, edo
    6. 2380512Domain d1jbmf1: 1jbm F:11-81 [84148]
      Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
      structural genomics
      complexed with acy, edo
    7. 2380513Domain d1jbmg1: 1jbm G:12-81 [84149]
      Other proteins in same PDB: d1jbma2, d1jbmb2, d1jbmc2, d1jbme2, d1jbmf2, d1jbmg2
      structural genomics
      complexed with acy, edo
  3. Domain(s) for 1jri:
    1. 2380535Domain d1jria1: 1jri A:12-81 [67121]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    2. 2380536Domain d1jrib1: 1jri B:12-81 [67122]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    3. 2380537Domain d1jric1: 1jri C:9-81 [67123]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    4. 2380538Domain d1jrid1: 1jri D:11-81 [67124]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    5. 2380539Domain d1jrie1: 1jri E:9-81 [67125]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    6. 2380540Domain d1jrif1: 1jri F:11-81 [67126]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    7. 2380541Domain d1jrig1: 1jri G:9-81 [67127]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    8. 2380542Domain d1jrih1: 1jri H:10-81 [67128]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    9. 2380543Domain d1jrii1: 1jri I:12-81 [67129]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    10. 2380544Domain d1jrij_: 1jri J: [67130]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    11. 2380545Domain d1jrik_: 1jri K: [67131]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    12. 2380546Domain d1jril1: 1jri L:9-81 [67132]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    13. 2380547Domain d1jrim1: 1jri M:12-81 [67133]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
    14. 2380548Domain d1jrin1: 1jri N:9-81 [67134]
      Other proteins in same PDB: d1jria2, d1jrib2, d1jric2, d1jrid2, d1jrie2, d1jrif2, d1jrig2, d1jrih2, d1jrii2, d1jril2, d1jrim2, d1jrin2
      complexed with cl, edo
  4. Domain(s) for 1loj:
    1. 2380514Domain d1loja1: 1loj A:9-80 [84650]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    2. 2380515Domain d1lojb1: 1loj B:11-80 [84651]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    3. 2380516Domain d1lojc1: 1loj C:11-80 [84652]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    4. 2380517Domain d1lojd1: 1loj D:10-80 [84653]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    5. 2380518Domain d1loje1: 1loj E:10-80 [84654]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    6. 2380519Domain d1lojf1: 1loj F:10-80 [84655]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    7. 2380520Domain d1lojg1: 1loj G:10-80 [84656]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    8. 2380521Domain d1lojh1: 1loj H:10-80 [84657]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    9. 2380522Domain d1loji1: 1loj I:10-80 [84658]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    10. 2380523Domain d1lojj1: 1loj J:11-80 [84659]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    11. 2380524Domain d1lojk1: 1loj K:10-80 [84660]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    12. 2380525Domain d1lojl1: 1loj L:10-80 [84661]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    13. 2380526Domain d1lojm1: 1loj M:11-80 [84662]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
    14. 2380527Domain d1lojn1: 1loj N:10-80 [84663]
      Other proteins in same PDB: d1loja2, d1lojb2, d1lojc2, d1lojd2, d1loje2, d1lojf2, d1lojg2, d1lojh2, d1loji2, d1lojj2, d1lojk2, d1lojl2, d1lojm2, d1lojn2
      complexed with mpd, u, uri
  5. Domain(s) for 1mgq:
    1. 2380500Domain d1mgqa_: 1mgq A: [79099]
    2. 2380501Domain d1mgqb_: 1mgq B: [79100]
    3. 2380502Domain d1mgqc_: 1mgq C: [79101]
    4. 2380503Domain d1mgqd_: 1mgq D: [79102]
    5. 2380504Domain d1mgqe_: 1mgq E: [79103]
    6. 2380505Domain d1mgqf_: 1mgq F: [79104]
    7. 2380506Domain d1mgqg_: 1mgq G: [79105]

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