Lineage for Protein: gamma subunit

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2685877Class a: All alpha proteins [46456] (290 folds)
  3. 2719131Fold a.80: post-AAA+ oligomerization domain-like [48018] (1 superfamily)
    core: 5 helices: bundle
  4. 2719132Superfamily a.80.1: post-AAA+ oligomerization domain-like [48019] (2 families) (S)
    associated with N-terminal domain from the AAA+ family of P-loop hydrolases
  5. 2719133Family a.80.1.1: DNA polymerase III clamp loader subunits, C-terminal domain [48020] (9 proteins)
    contains an extra helix
  6. 2719151Protein gamma subunit [63578] (2 species)

Species:

  1. 2719152Escherichia coli [TaxId:562] [63579] (3 PDB entries)
    Uniprot P06710 5-368
    1. Domains for 1jr3:
      1. 2719153Domain d1jr3a1: 1jr3 A:243-368 [63245]
        Other proteins in same PDB: d1jr3a2, d1jr3b2, d1jr3c2, d1jr3d1, d1jr3d2, d1jr3e1, d1jr3e2
        protein/DNA complex; complexed with so4, zn
      2. 2719154Domain d1jr3b1: 1jr3 B:243-368 [63247]
        Other proteins in same PDB: d1jr3a2, d1jr3b2, d1jr3c2, d1jr3d1, d1jr3d2, d1jr3e1, d1jr3e2
        protein/DNA complex; complexed with so4, zn
      3. 2719155Domain d1jr3c1: 1jr3 C:243-368 [63249]
        Other proteins in same PDB: d1jr3a2, d1jr3b2, d1jr3c2, d1jr3d1, d1jr3d2, d1jr3e1, d1jr3e2
        protein/DNA complex; complexed with so4, zn
    2. Domains for 1xxh:
      1. 2719156Domain d1xxhb1: 1xxh B:243-368 [116165]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb2, d1xxhc2, d1xxhd2, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg2, d1xxhh2, d1xxhi2, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      2. 2719157Domain d1xxhc1: 1xxh C:243-368 [116167]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb2, d1xxhc2, d1xxhd2, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg2, d1xxhh2, d1xxhi2, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      3. 2719158Domain d1xxhd1: 1xxh D:243-368 [116169]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb2, d1xxhc2, d1xxhd2, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg2, d1xxhh2, d1xxhi2, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      4. 2719159Domain d1xxhg1: 1xxh G:243-368 [116175]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb2, d1xxhc2, d1xxhd2, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg2, d1xxhh2, d1xxhi2, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      5. 2719160Domain d1xxhh1: 1xxh H:243-368 [116177]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb2, d1xxhc2, d1xxhd2, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg2, d1xxhh2, d1xxhi2, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
      6. 2719161Domain d1xxhi1: 1xxh I:243-368 [116179]
        Other proteins in same PDB: d1xxha1, d1xxha2, d1xxhb2, d1xxhc2, d1xxhd2, d1xxhe1, d1xxhe2, d1xxhf1, d1xxhf2, d1xxhg2, d1xxhh2, d1xxhi2, d1xxhj1, d1xxhj2
        protein/DNA complex; complexed with ags, po4, zn
    3. Domains for 1xxi:
      1. 2719162Domain d1xxib1: 1xxi B:243-368 [116185]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib2, d1xxic2, d1xxid2, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig2, d1xxih2, d1xxii2, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      2. 2719163Domain d1xxic1: 1xxi C:243-368 [116187]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib2, d1xxic2, d1xxid2, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig2, d1xxih2, d1xxii2, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      3. 2719164Domain d1xxid1: 1xxi D:243-368 [116189]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib2, d1xxic2, d1xxid2, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig2, d1xxih2, d1xxii2, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      4. 2719165Domain d1xxig1: 1xxi G:243-368 [116195]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib2, d1xxic2, d1xxid2, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig2, d1xxih2, d1xxii2, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      5. 2719166Domain d1xxih1: 1xxi H:243-368 [116197]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib2, d1xxic2, d1xxid2, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig2, d1xxih2, d1xxii2, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
      6. 2719167Domain d1xxii1: 1xxi I:243-368 [116199]
        Other proteins in same PDB: d1xxia1, d1xxia2, d1xxib2, d1xxic2, d1xxid2, d1xxie1, d1xxie2, d1xxif1, d1xxif2, d1xxig2, d1xxih2, d1xxii2, d1xxij1, d1xxij2
        protein/DNA complex; complexed with adp, po4, zn
  2. 2719168Thermotoga maritima [TaxId:2336] [140678] (1 PDB entry)
    Uniprot Q9WZM9 209-306

More info for Protein gamma subunit from a.80.1.1: DNA polymerase III clamp loader subunits, C-terminal domain

Timeline for Protein gamma subunit from a.80.1.1: DNA polymerase III clamp loader subunits, C-terminal domain:

  • Protein gamma subunit from a.80.1.1: DNA polymerase III clamp loader subunits, C-terminal domain first appeared in SCOP 1.57
  • Protein gamma subunit from a.80.1.1: DNA polymerase III clamp loader subunits, C-terminal domain appears in SCOPe 2.07