Class e: Multi-domain proteins (alpha and beta) [56572] (66 folds) |
Fold e.3: beta-lactamase/transpeptidase-like [56600] (1 superfamily) contains a cluster of helices and an alpha+beta sandwich |
Superfamily e.3.1: beta-lactamase/transpeptidase-like [56601] (3 families) |
Family e.3.1.1: beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase [56602] (18 proteins) |
Protein Penicillin-binding protein 2x (pbp-2x), transpeptidase domain [56624] (1 species) |
Species Streptococcus pneumoniae [TaxId:1313] [56625] (10 PDB entries) |
Domain d1k25a4: 1k25 A:264-631 [68036] Other proteins in same PDB: d1k25a1, d1k25a2, d1k25a3, d1k25b1, d1k25b2, d1k25b3, d1k25c1, d1k25c2, d1k25c3, d1k25d1, d1k25d2, d1k25d3 |
Domain d1k25b4: 1k25 B:1264-1631 [68040] Other proteins in same PDB: d1k25a1, d1k25a2, d1k25a3, d1k25b1, d1k25b2, d1k25b3, d1k25c1, d1k25c2, d1k25c3, d1k25d1, d1k25d2, d1k25d3 |
Domain d1k25c4: 1k25 C:2264-2631 [68044] Other proteins in same PDB: d1k25a1, d1k25a2, d1k25a3, d1k25b1, d1k25b2, d1k25b3, d1k25c1, d1k25c2, d1k25c3, d1k25d1, d1k25d2, d1k25d3 |
Domain d1k25d4: 1k25 D:3264-3612 [68048] Other proteins in same PDB: d1k25a1, d1k25a2, d1k25a3, d1k25b1, d1k25b2, d1k25b3, d1k25c1, d1k25c2, d1k25c3, d1k25d1, d1k25d2, d1k25d3 mutant |
Domain d1pmda4: 1pmd A:264-630 [42771] Other proteins in same PDB: d1pmda1, d1pmda2, d1pmda3 CA-atoms only |
Domain d1pyya4: 1pyy A:264-631 [95388] Other proteins in same PDB: d1pyya1, d1pyya2, d1pyya3 complexed with mpd, osu, so4; mutant |
Domain d1qmea4: 1qme A:264-620 [42769] Other proteins in same PDB: d1qmea1, d1qmea2, d1qmea3 complexed with so4 |
Domain d1qmfa4: 1qmf A:264-620 [42770] Other proteins in same PDB: d1qmfa1, d1qmfa2, d1qmfa3 complexed with ces, kef |
Domain d2z2lb1: 2z2l B:264-620 [153937] Other proteins in same PDB: d2z2lc1, d2z2lc2, d2z2lf1, d2z2lf2 automatically matched to d1pmda4 complexed with so4 |
Domain d2z2le1: 2z2l E:264-620 [153940] Other proteins in same PDB: d2z2lc1, d2z2lc2, d2z2lf1, d2z2lf2 automatically matched to d1pmda4 complexed with so4 |
Domain d2z2mb1: 2z2m B:264-620 [153943] Other proteins in same PDB: d2z2mc1, d2z2mc2, d2z2mf1, d2z2mf2 automatically matched to d1pmda4 complexed with cds, so4 |
Domain d2z2me1: 2z2m E:264-620 [153946] Other proteins in same PDB: d2z2mc1, d2z2mc2, d2z2mf1, d2z2mf2 automatically matched to d1pmda4 complexed with cds, so4 |
Domain d2zc3b1: 2zc3 B:264-619 [154324] Other proteins in same PDB: d2zc3c1, d2zc3c2, d2zc3f1, d2zc3f2 automatically matched to d1pmda4 complexed with bmg, so4 |
Domain d2zc3e1: 2zc3 E:264-620 [154327] Other proteins in same PDB: d2zc3c1, d2zc3c2, d2zc3f1, d2zc3f2 automatically matched to d1pmda4 complexed with bmg, so4 |
Domain d2zc4b1: 2zc4 B:264-619 [154330] Other proteins in same PDB: d2zc4c1, d2zc4c2, d2zc4f1, d2zc4f2 automatically matched to d1pmda4 complexed with so4, teb |
Domain d2zc4e1: 2zc4 E:264-620 [154333] Other proteins in same PDB: d2zc4c1, d2zc4c2, d2zc4f1, d2zc4f2 automatically matched to d1pmda4 complexed with so4, teb |
Timeline for Species Streptococcus pneumoniae [TaxId:1313] from e.3.1.1 Penicillin-binding protein 2x (pbp-2x), transpeptidase domain: