SCOPe 2.02: Species: Haemophilus influenzae [TaxId: 727]

Lineage for Species: Haemophilus influenzae [TaxId: 727]

Root: SCOPe 2.02
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (8 families)
N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (4 proteins)
Protein HslV (ClpQ) protease [56258] (4 species)
dodecameric prokaryotic homologue of proteasome
Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] [56260] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Haemophilus influenzae [TaxId: 727]:

Domain(s) for 1g3i:
1. Domain d1g3ig_: 1g3i G: [41992]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
2. Domain d1g3ih_: 1g3i H: [41993]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
3. Domain d1g3ii_: 1g3i I: [41994]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
4. Domain d1g3ij_: 1g3i J: [41995]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
5. Domain d1g3ik_: 1g3i K: [41996]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
6. Domain d1g3il_: 1g3i L: [41997]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
7. Domain d1g3im_: 1g3i M: [41998]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
8. Domain d1g3in_: 1g3i N: [41999]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
9. Domain d1g3io_: 1g3i O: [42000]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
10. Domain d1g3ip_: 1g3i P: [42001]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
11. Domain d1g3iq_: 1g3i Q: [42002]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
12. Domain d1g3ir_: 1g3i R: [42003]
  Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
  complexed with atp
Domain(s) for 1g3k:
1. Domain d1g3ka_: 1g3k A: [41989]
  complexed with na
2. Domain d1g3kb_: 1g3k B: [41990]
  complexed with na
3. Domain d1g3kc_: 1g3k C: [41991]
  complexed with na
Domain(s) for 1jjw:
1. Domain d1jjwa_: 1jjw A: [66781]
  complexed with k
2. Domain d1jjwb_: 1jjw B: [66782]
  complexed with k
3. Domain d1jjwc_: 1jjw C: [66783]
  complexed with k
Domain(s) for 1kyi:
1. Domain d1kyig_: 1kyi G: [73229]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
2. Domain d1kyih_: 1kyi H: [73230]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
3. Domain d1kyii_: 1kyi I: [73231]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
4. Domain d1kyij_: 1kyi J: [73232]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
5. Domain d1kyik_: 1kyi K: [73233]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
6. Domain d1kyil_: 1kyi L: [73234]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
7. Domain d1kyim_: 1kyi M: [73235]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
8. Domain d1kyin_: 1kyi N: [73236]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
9. Domain d1kyio_: 1kyi O: [73237]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
10. Domain d1kyip_: 1kyi P: [73238]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
11. Domain d1kyiq_: 1kyi Q: [73239]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
12. Domain d1kyir_: 1kyi R: [73240]
  Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
  complexed with atp, lvs
Domain(s) for 1ofh:
1. Domain d1ofhg_: 1ofh G: [86951]
  Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
  complexed with adp, mg, po4
2. Domain d1ofhh_: 1ofh H: [86952]
  Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
  complexed with adp, mg, po4
3. Domain d1ofhi_: 1ofh I: [86953]
  Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
  complexed with adp, mg, po4
4. Domain d1ofhl_: 1ofh L: [86954]
  Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
  complexed with adp, mg, po4
5. Domain d1ofhm_: 1ofh M: [86955]
  Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
  complexed with adp, mg, po4
6. Domain d1ofhn_: 1ofh N: [86956]
  Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
  complexed with adp, mg, po4
Domain(s) for 1ofi:
1. Domain d1ofig_: 1ofi G: [86960]
  Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
  complexed with adp, lvs, mg, po4
2. Domain d1ofih_: 1ofi H: [86961]
  Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
  complexed with adp, lvs, mg, po4
3. Domain d1ofii_: 1ofi I: [86962]
  Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
  complexed with adp, lvs, mg, po4
4. Domain d1ofil_: 1ofi L: [86963]
  Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
  complexed with adp, lvs, mg, po4
5. Domain d1ofim_: 1ofi M: [86964]
  Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
  complexed with adp, lvs, mg, po4
6. Domain d1ofin_: 1ofi N: [86965]
  Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
  complexed with adp, lvs, mg, po4

More info for Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease

Timeline for Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease:

Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease appears in SCOPe 2.01
Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease appears in SCOPe 2.03
Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease appears in the current release, SCOPe 2.08