Lineage for Species: Haemophilus influenzae [TaxId: 727]

  1. Root: SCOP 1.75
  2. 849709Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 875596Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 875597Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (7 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 875747Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (3 proteins)
  6. 875748Protein HslV (ClpQ) protease [56258] (4 species)
    dodecameric prokaryotic homologue of proteasome
  7. 875812Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] [56260] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Haemophilus influenzae [TaxId: 727]:

  1. Domain(s) for 1g3i:
    1. 875843Domain d1g3ig_: 1g3i G: [41992]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    2. 875844Domain d1g3ih_: 1g3i H: [41993]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    3. 875845Domain d1g3ii_: 1g3i I: [41994]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    4. 875846Domain d1g3ij_: 1g3i J: [41995]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    5. 875847Domain d1g3ik_: 1g3i K: [41996]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    6. 875848Domain d1g3il_: 1g3i L: [41997]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    7. 875849Domain d1g3im_: 1g3i M: [41998]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    8. 875850Domain d1g3in_: 1g3i N: [41999]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    9. 875851Domain d1g3io_: 1g3i O: [42000]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    10. 875852Domain d1g3ip_: 1g3i P: [42001]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    11. 875853Domain d1g3iq_: 1g3i Q: [42002]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    12. 875854Domain d1g3ir_: 1g3i R: [42003]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      complexed with atp
  2. Domain(s) for 1g3k:
    1. 875813Domain d1g3ka_: 1g3k A: [41989]
    2. 875814Domain d1g3kb_: 1g3k B: [41990]
    3. 875815Domain d1g3kc_: 1g3k C: [41991]
      complexed with na
  3. Domain(s) for 1jjw:
    1. 875816Domain d1jjwa_: 1jjw A: [66781]
    2. 875817Domain d1jjwb_: 1jjw B: [66782]
    3. 875818Domain d1jjwc_: 1jjw C: [66783]
      complexed with k
  4. Domain(s) for 1kyi:
    1. 875825Domain d1kyig_: 1kyi G: [73229]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    2. 875826Domain d1kyih_: 1kyi H: [73230]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    3. 875827Domain d1kyii_: 1kyi I: [73231]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    4. 875828Domain d1kyij_: 1kyi J: [73232]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    5. 875829Domain d1kyik_: 1kyi K: [73233]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    6. 875830Domain d1kyil_: 1kyi L: [73234]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    7. 875831Domain d1kyim_: 1kyi M: [73235]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    8. 875832Domain d1kyin_: 1kyi N: [73236]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    9. 875833Domain d1kyio_: 1kyi O: [73237]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    10. 875834Domain d1kyip_: 1kyi P: [73238]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    11. 875835Domain d1kyiq_: 1kyi Q: [73239]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    12. 875836Domain d1kyir_: 1kyi R: [73240]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      complexed with atp, lvs
  5. Domain(s) for 1ofh:
    1. 875819Domain d1ofhg_: 1ofh G: [86951]
      Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
    2. 875820Domain d1ofhh_: 1ofh H: [86952]
      Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
    3. 875821Domain d1ofhi_: 1ofh I: [86953]
      Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
    4. 875822Domain d1ofhl_: 1ofh L: [86954]
      Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
    5. 875823Domain d1ofhm_: 1ofh M: [86955]
      Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
    6. 875824Domain d1ofhn_: 1ofh N: [86956]
      Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
      complexed with adp, mg, mo3, mo4, po4
  6. Domain(s) for 1ofi:
    1. 875837Domain d1ofig_: 1ofi G: [86960]
      Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
    2. 875838Domain d1ofih_: 1ofi H: [86961]
      Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
    3. 875839Domain d1ofii_: 1ofi I: [86962]
      Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
    4. 875840Domain d1ofil_: 1ofi L: [86963]
      Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
    5. 875841Domain d1ofim_: 1ofi M: [86964]
      Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
    6. 875842Domain d1ofin_: 1ofi N: [86965]
      Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
      complexed with adp, lvs, mg, mo3, mo4, po4

More info for Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease

Timeline for Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease: