Lineage for Species: Haemophilus influenzae

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 251695Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (224 folds)
  3. 263343Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 263344Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (5 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 263459Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (3 proteins)
  6. 263460Protein HslV (ClpQ) protease [56258] (2 species)
    dodecameric prokaryotic homologue of proteasome
  7. 263497Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] [56260] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Haemophilus influenzae:

  1. Domain(s) for 1g3i:
    1. 263516Domain d1g3ig_: 1g3i G: [41992]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    2. 263517Domain d1g3ih_: 1g3i H: [41993]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    3. 263518Domain d1g3ii_: 1g3i I: [41994]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    4. 263519Domain d1g3ij_: 1g3i J: [41995]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    5. 263520Domain d1g3ik_: 1g3i K: [41996]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    6. 263521Domain d1g3il_: 1g3i L: [41997]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    7. 263522Domain d1g3im_: 1g3i M: [41998]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    8. 263523Domain d1g3in_: 1g3i N: [41999]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    9. 263524Domain d1g3io_: 1g3i O: [42000]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    10. 263525Domain d1g3ip_: 1g3i P: [42001]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    11. 263526Domain d1g3iq_: 1g3i Q: [42002]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
    12. 263527Domain d1g3ir_: 1g3i R: [42003]
      Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      complexed with atp
  2. Domain(s) for 1g3k:
    1. 263501Domain d1g3ka_: 1g3k A: [41989]
    2. 263502Domain d1g3kb_: 1g3k B: [41990]
    3. 263503Domain d1g3kc_: 1g3k C: [41991]
      complexed with na
  3. Domain(s) for 1jjw:
    1. 263498Domain d1jjwa_: 1jjw A: [66781]
    2. 263499Domain d1jjwb_: 1jjw B: [66782]
    3. 263500Domain d1jjwc_: 1jjw C: [66783]
      complexed with k
  4. Domain(s) for 1kyi:
    1. 263504Domain d1kyig_: 1kyi G: [73229]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    2. 263505Domain d1kyih_: 1kyi H: [73230]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    3. 263506Domain d1kyii_: 1kyi I: [73231]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    4. 263507Domain d1kyij_: 1kyi J: [73232]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    5. 263508Domain d1kyik_: 1kyi K: [73233]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    6. 263509Domain d1kyil_: 1kyi L: [73234]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    7. 263510Domain d1kyim_: 1kyi M: [73235]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    8. 263511Domain d1kyin_: 1kyi N: [73236]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    9. 263512Domain d1kyio_: 1kyi O: [73237]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    10. 263513Domain d1kyip_: 1kyi P: [73238]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    11. 263514Domain d1kyiq_: 1kyi Q: [73239]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
    12. 263515Domain d1kyir_: 1kyi R: [73240]
      Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      complexed with atp, lvs

More info for Species Haemophilus influenzae [TaxId:727] from d.153.1.4 HslV (ClpQ) protease

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