Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds) |
Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies) 4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing |
Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (8 families) N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor |
Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (4 proteins) |
Protein HslV (ClpQ) protease [56258] (4 species) dodecameric prokaryotic homologue of proteasome |
Bacillus subtilis [TaxId:1423] [160845] (2 PDB entries) Uniprot P39070 2-181 |
Domain d1yyfc1: 1yyf C:2-181 [144719] Other proteins in same PDB: d1yyfa1, d1yyfb1 complexed with adp |
Domain d1yyfd1: 1yyf D:2-181 [144720] Other proteins in same PDB: d1yyfa1, d1yyfb1 automatically matched to 1YYF C:2-181 complexed with adp |
Domain d2z3aa1: 2z3a A:1-180 [153959] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3ab1: 2z3a B:1-180 [153960] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3ac1: 2z3a C:1-180 [153961] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3ad1: 2z3a D:1-180 [153962] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3ae1: 2z3a E:1-180 [153963] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3af1: 2z3a F:1-180 [153964] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3ag1: 2z3a G:1-180 [153965] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3ah1: 2z3a H:1-180 [153966] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3ai1: 2z3a I:1-180 [153967] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3aj1: 2z3a J:1-180 [153968] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3ak1: 2z3a K:1-180 [153969] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Domain d2z3al1: 2z3a L:1-180 [153970] automatically matched to 1YYF C:2-181 |
Escherichia coli [TaxId:562] [56259] (7 PDB entries) |
Domain d1e94a_: 1e94 A: [41977] Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_ complexed with anp |
Domain d1e94b_: 1e94 B: [41978] Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_ complexed with anp |
Domain d1e94c_: 1e94 C: [41979] Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_ complexed with anp |
Domain d1e94d_: 1e94 D: [41980] Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_ complexed with anp |
Domain d1g4aa_: 1g4a A: [41981] Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_ complexed with dat |
Domain d1g4ab_: 1g4a B: [41982] Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_ complexed with dat |
Domain d1g4ac_: 1g4a C: [41983] Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_ complexed with dat |
Domain d1g4ad_: 1g4a D: [41984] Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_ complexed with dat |
Domain d1g4bm_: 1g4b M: [41985] Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_ |
Domain d1g4bn_: 1g4b N: [41986] Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_ |
Domain d1g4bo_: 1g4b O: [41987] Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_ |
Domain d1g4bp_: 1g4b P: [41988] Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_ |
Domain d1hqya_: 1hqy A: [65909] Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_ complexed with adp |
Domain d1hqyb_: 1hqy B: [65910] Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_ complexed with adp |
Domain d1hqyc_: 1hqy C: [65911] Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_ complexed with adp |
Domain d1hqyd_: 1hqy D: [65912] Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_ complexed with adp |
Domain d1ht1a_: 1ht1 A: [65924] Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_ complexed with adp |
Domain d1ht1b_: 1ht1 B: [65925] Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_ complexed with adp |
Domain d1ht1c_: 1ht1 C: [65926] Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_ complexed with adp |
Domain d1ht1d_: 1ht1 D: [65927] Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_ complexed with adp |
Domain d1ht1v_: 1ht1 V: [65932] Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_ complexed with adp |
Domain d1ht1x_: 1ht1 X: [65933] Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_ complexed with adp |
Domain d1ht1y_: 1ht1 Y: [65934] Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_ complexed with adp |
Domain d1ht1z_: 1ht1 Z: [65935] Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_ complexed with adp |
Domain d1ht2a_: 1ht2 A: [65936] Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_ complexed with adp |
Domain d1ht2b_: 1ht2 B: [65937] Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_ complexed with adp |
Domain d1ht2c_: 1ht2 C: [65938] Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_ complexed with adp |
Domain d1ht2d_: 1ht2 D: [65939] Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_ complexed with adp |
Domain d1ht2i_: 1ht2 I: [65944] Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_ complexed with adp |
Domain d1ht2j_: 1ht2 J: [65945] Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_ complexed with adp |
Domain d1ht2k_: 1ht2 K: [65946] Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_ complexed with adp |
Domain d1ht2l_: 1ht2 L: [65947] Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_ complexed with adp |
Domain d1neda_: 1ned A: [41974] |
Domain d1nedb_: 1ned B: [41975] |
Domain d1nedc_: 1ned C: [41976] |
Haemophilus influenzae [TaxId:727] [56260] (6 PDB entries) |
Domain d1g3ig_: 1g3i G: [41992] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3ih_: 1g3i H: [41993] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3ii_: 1g3i I: [41994] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3ij_: 1g3i J: [41995] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3ik_: 1g3i K: [41996] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3il_: 1g3i L: [41997] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3im_: 1g3i M: [41998] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3in_: 1g3i N: [41999] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3io_: 1g3i O: [42000] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3ip_: 1g3i P: [42001] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3iq_: 1g3i Q: [42002] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3ir_: 1g3i R: [42003] Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_ complexed with atp |
Domain d1g3ka_: 1g3k A: [41989] complexed with na |
Domain d1g3kb_: 1g3k B: [41990] complexed with na |
Domain d1g3kc_: 1g3k C: [41991] complexed with na |
Domain d1jjwa_: 1jjw A: [66781] complexed with k |
Domain d1jjwb_: 1jjw B: [66782] complexed with k |
Domain d1jjwc_: 1jjw C: [66783] complexed with k |
Domain d1kyig_: 1kyi G: [73229] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyih_: 1kyi H: [73230] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyii_: 1kyi I: [73231] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyij_: 1kyi J: [73232] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyik_: 1kyi K: [73233] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyil_: 1kyi L: [73234] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyim_: 1kyi M: [73235] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyin_: 1kyi N: [73236] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyio_: 1kyi O: [73237] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyip_: 1kyi P: [73238] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyiq_: 1kyi Q: [73239] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1kyir_: 1kyi R: [73240] Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_ complexed with atp, lvs |
Domain d1ofhg_: 1ofh G: [86951] Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_ complexed with adp, mg, po4 |
Domain d1ofhh_: 1ofh H: [86952] Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_ complexed with adp, mg, po4 |
Domain d1ofhi_: 1ofh I: [86953] Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_ complexed with adp, mg, po4 |
Domain d1ofhl_: 1ofh L: [86954] Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_ complexed with adp, mg, po4 |
Domain d1ofhm_: 1ofh M: [86955] Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_ complexed with adp, mg, po4 |
Domain d1ofhn_: 1ofh N: [86956] Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_ complexed with adp, mg, po4 |
Domain d1ofig_: 1ofi G: [86960] Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_ complexed with adp, lvs, mg, po4 |
Domain d1ofih_: 1ofi H: [86961] Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_ complexed with adp, lvs, mg, po4 |
Domain d1ofii_: 1ofi I: [86962] Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_ complexed with adp, lvs, mg, po4 |
Domain d1ofil_: 1ofi L: [86963] Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_ complexed with adp, lvs, mg, po4 |
Domain d1ofim_: 1ofi M: [86964] Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_ complexed with adp, lvs, mg, po4 |
Domain d1ofin_: 1ofi N: [86965] Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_ complexed with adp, lvs, mg, po4 |
Thermotoga maritima [TaxId:2336] [90045] (1 PDB entry) |
Domain d1m4ya_: 1m4y A: [84802] complexed with na |
Domain d1m4yb_: 1m4y B: [84803] complexed with na |
Domain d1m4yc_: 1m4y C: [84804] complexed with na |
Timeline for Protein HslV (ClpQ) protease from d.153.1.4: Proteasome subunits: