Lineage for Protein: HslV (ClpQ) protease

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 1013083Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 1044569Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 1044570Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (8 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 1044729Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (4 proteins)
  6. 1044730Protein HslV (ClpQ) protease [56258] (4 species)
    dodecameric prokaryotic homologue of proteasome

Species:

  1. 1044731Bacillus subtilis [TaxId:1423] [160845] (2 PDB entries)
    Uniprot P39070 2-181
    1. Domains for 1yyf:
      1. 1044744Domain d1yyfc1: 1yyf C:2-181 [144719]
        Other proteins in same PDB: d1yyfa1, d1yyfb1
        complexed with adp
      2. 1044745Domain d1yyfd1: 1yyf D:2-181 [144720]
        Other proteins in same PDB: d1yyfa1, d1yyfb1
        automatically matched to 1YYF C:2-181
        complexed with adp
    2. Domains for 2z3a:
      1. 1044732Domain d2z3aa1: 2z3a A:1-180 [153959]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      2. 1044733Domain d2z3ab1: 2z3a B:1-180 [153960]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      3. 1044734Domain d2z3ac1: 2z3a C:1-180 [153961]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      4. 1044735Domain d2z3ad1: 2z3a D:1-180 [153962]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      5. 1044736Domain d2z3ae1: 2z3a E:1-180 [153963]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      6. 1044737Domain d2z3af1: 2z3a F:1-180 [153964]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      7. 1044738Domain d2z3ag1: 2z3a G:1-180 [153965]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      8. 1044739Domain d2z3ah1: 2z3a H:1-180 [153966]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      9. 1044740Domain d2z3ai1: 2z3a I:1-180 [153967]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      10. 1044741Domain d2z3aj1: 2z3a J:1-180 [153968]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      11. 1044742Domain d2z3ak1: 2z3a K:1-180 [153969]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
      12. 1044743Domain d2z3al1: 2z3a L:1-180 [153970]
        automatically matched to 1YYF C:2-181
  2. 1044746Escherichia coli [TaxId:562] [56259] (7 PDB entries)
    1. Domains for 1e94:
      1. 1044747Domain d1e94a_: 1e94 A: [41977]
        Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_
        complexed with anp
      2. 1044748Domain d1e94b_: 1e94 B: [41978]
        Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_
        complexed with anp
      3. 1044749Domain d1e94c_: 1e94 C: [41979]
        Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_
        complexed with anp
      4. 1044750Domain d1e94d_: 1e94 D: [41980]
        Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_
        complexed with anp
    2. Domains for 1g4a:
      1. 1044771Domain d1g4aa_: 1g4a A: [41981]
        Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_
        complexed with dat
      2. 1044772Domain d1g4ab_: 1g4a B: [41982]
        Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_
        complexed with dat
      3. 1044773Domain d1g4ac_: 1g4a C: [41983]
        Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_
        complexed with dat
      4. 1044774Domain d1g4ad_: 1g4a D: [41984]
        Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_
        complexed with dat
    3. Domains for 1g4b:
      1. 1044778Domain d1g4bm_: 1g4b M: [41985]
        Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_
      2. 1044779Domain d1g4bn_: 1g4b N: [41986]
        Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_
      3. 1044780Domain d1g4bo_: 1g4b O: [41987]
        Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_
      4. 1044781Domain d1g4bp_: 1g4b P: [41988]
        Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_
    4. Domains for 1hqy:
      1. 1044767Domain d1hqya_: 1hqy A: [65909]
        Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_
        complexed with adp
      2. 1044768Domain d1hqyb_: 1hqy B: [65910]
        Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_
        complexed with adp
      3. 1044769Domain d1hqyc_: 1hqy C: [65911]
        Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_
        complexed with adp
      4. 1044770Domain d1hqyd_: 1hqy D: [65912]
        Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_
        complexed with adp
    5. Domains for 1ht1:
      1. 1044751Domain d1ht1a_: 1ht1 A: [65924]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
      2. 1044752Domain d1ht1b_: 1ht1 B: [65925]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
      3. 1044753Domain d1ht1c_: 1ht1 C: [65926]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
      4. 1044754Domain d1ht1d_: 1ht1 D: [65927]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
      5. 1044755Domain d1ht1v_: 1ht1 V: [65932]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
      6. 1044756Domain d1ht1x_: 1ht1 X: [65933]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
      7. 1044757Domain d1ht1y_: 1ht1 Y: [65934]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
      8. 1044758Domain d1ht1z_: 1ht1 Z: [65935]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
    6. Domains for 1ht2:
      1. 1044759Domain d1ht2a_: 1ht2 A: [65936]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
      2. 1044760Domain d1ht2b_: 1ht2 B: [65937]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
      3. 1044761Domain d1ht2c_: 1ht2 C: [65938]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
      4. 1044762Domain d1ht2d_: 1ht2 D: [65939]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
      5. 1044763Domain d1ht2i_: 1ht2 I: [65944]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
      6. 1044764Domain d1ht2j_: 1ht2 J: [65945]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
      7. 1044765Domain d1ht2k_: 1ht2 K: [65946]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
      8. 1044766Domain d1ht2l_: 1ht2 L: [65947]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
    7. Domains for 1ned:
      1. 1044775Domain d1neda_: 1ned A: [41974]
      2. 1044776Domain d1nedb_: 1ned B: [41975]
      3. 1044777Domain d1nedc_: 1ned C: [41976]
  3. 1044782Haemophilus influenzae [TaxId:727] [56260] (6 PDB entries)
    1. Domains for 1g3i:
      1. 1044813Domain d1g3ig_: 1g3i G: [41992]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      2. 1044814Domain d1g3ih_: 1g3i H: [41993]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      3. 1044815Domain d1g3ii_: 1g3i I: [41994]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      4. 1044816Domain d1g3ij_: 1g3i J: [41995]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      5. 1044817Domain d1g3ik_: 1g3i K: [41996]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      6. 1044818Domain d1g3il_: 1g3i L: [41997]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      7. 1044819Domain d1g3im_: 1g3i M: [41998]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      8. 1044820Domain d1g3in_: 1g3i N: [41999]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      9. 1044821Domain d1g3io_: 1g3i O: [42000]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      10. 1044822Domain d1g3ip_: 1g3i P: [42001]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      11. 1044823Domain d1g3iq_: 1g3i Q: [42002]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
      12. 1044824Domain d1g3ir_: 1g3i R: [42003]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
    2. Domains for 1g3k:
      1. 1044783Domain d1g3ka_: 1g3k A: [41989]
        complexed with na
      2. 1044784Domain d1g3kb_: 1g3k B: [41990]
        complexed with na
      3. 1044785Domain d1g3kc_: 1g3k C: [41991]
        complexed with na
    3. Domains for 1jjw:
      1. 1044786Domain d1jjwa_: 1jjw A: [66781]
        complexed with k
      2. 1044787Domain d1jjwb_: 1jjw B: [66782]
        complexed with k
      3. 1044788Domain d1jjwc_: 1jjw C: [66783]
        complexed with k
    4. Domains for 1kyi:
      1. 1044795Domain d1kyig_: 1kyi G: [73229]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      2. 1044796Domain d1kyih_: 1kyi H: [73230]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      3. 1044797Domain d1kyii_: 1kyi I: [73231]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      4. 1044798Domain d1kyij_: 1kyi J: [73232]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      5. 1044799Domain d1kyik_: 1kyi K: [73233]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      6. 1044800Domain d1kyil_: 1kyi L: [73234]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      7. 1044801Domain d1kyim_: 1kyi M: [73235]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      8. 1044802Domain d1kyin_: 1kyi N: [73236]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      9. 1044803Domain d1kyio_: 1kyi O: [73237]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      10. 1044804Domain d1kyip_: 1kyi P: [73238]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      11. 1044805Domain d1kyiq_: 1kyi Q: [73239]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
      12. 1044806Domain d1kyir_: 1kyi R: [73240]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
    5. Domains for 1ofh:
      1. 1044789Domain d1ofhg_: 1ofh G: [86951]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
        complexed with adp, mg, po4
      2. 1044790Domain d1ofhh_: 1ofh H: [86952]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
        complexed with adp, mg, po4
      3. 1044791Domain d1ofhi_: 1ofh I: [86953]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
        complexed with adp, mg, po4
      4. 1044792Domain d1ofhl_: 1ofh L: [86954]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
        complexed with adp, mg, po4
      5. 1044793Domain d1ofhm_: 1ofh M: [86955]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
        complexed with adp, mg, po4
      6. 1044794Domain d1ofhn_: 1ofh N: [86956]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
        complexed with adp, mg, po4
    6. Domains for 1ofi:
      1. 1044807Domain d1ofig_: 1ofi G: [86960]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
        complexed with adp, lvs, mg, po4
      2. 1044808Domain d1ofih_: 1ofi H: [86961]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
        complexed with adp, lvs, mg, po4
      3. 1044809Domain d1ofii_: 1ofi I: [86962]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
        complexed with adp, lvs, mg, po4
      4. 1044810Domain d1ofil_: 1ofi L: [86963]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
        complexed with adp, lvs, mg, po4
      5. 1044811Domain d1ofim_: 1ofi M: [86964]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
        complexed with adp, lvs, mg, po4
      6. 1044812Domain d1ofin_: 1ofi N: [86965]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
        complexed with adp, lvs, mg, po4
  4. 1044825Thermotoga maritima [TaxId:2336] [90045] (1 PDB entry)

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