Lineage for Protein: HslV (ClpQ) protease

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 323018Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (234 folds)
  3. 335536Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 335537Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (5 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 335658Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (3 proteins)
  6. 335659Protein HslV (ClpQ) protease [56258] (3 species)
    dodecameric prokaryotic homologue of proteasome

Species:

  1. 335660Escherichia coli [TaxId:562] [56259] (7 PDB entries)
    1. Domains for 1e94:
      1. 335681Domain d1e94a_: 1e94 A: [41977]
        Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_
      2. 335682Domain d1e94b_: 1e94 B: [41978]
        Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_
      3. 335683Domain d1e94c_: 1e94 C: [41979]
        Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_
      4. 335684Domain d1e94d_: 1e94 D: [41980]
        Other proteins in same PDB: d1e94e_, d1e94f_
        complexed with anp
    2. Domains for 1g4a:
      1. 335685Domain d1g4aa_: 1g4a A: [41981]
        Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_
      2. 335686Domain d1g4ab_: 1g4a B: [41982]
        Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_
      3. 335687Domain d1g4ac_: 1g4a C: [41983]
        Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_
      4. 335688Domain d1g4ad_: 1g4a D: [41984]
        Other proteins in same PDB: d1g4ae_, d1g4af_
        complexed with dat
    3. Domains for 1g4b:
      1. 335692Domain d1g4bm_: 1g4b M: [41985]
        Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_
      2. 335693Domain d1g4bn_: 1g4b N: [41986]
        Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_
      3. 335694Domain d1g4bo_: 1g4b O: [41987]
        Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_
      4. 335695Domain d1g4bp_: 1g4b P: [41988]
        Other proteins in same PDB: d1g4be_, d1g4bf_, d1g4bk_, d1g4bl_
    4. Domains for 1hqy:
      1. 335677Domain d1hqya_: 1hqy A: [65909]
        Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_
      2. 335678Domain d1hqyb_: 1hqy B: [65910]
        Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_
      3. 335679Domain d1hqyc_: 1hqy C: [65911]
        Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_
      4. 335680Domain d1hqyd_: 1hqy D: [65912]
        Other proteins in same PDB: d1hqye_, d1hqyf_
        complexed with adp
    5. Domains for 1ht1:
      1. 335661Domain d1ht1a_: 1ht1 A: [65924]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
      2. 335662Domain d1ht1b_: 1ht1 B: [65925]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
      3. 335663Domain d1ht1c_: 1ht1 C: [65926]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
      4. 335664Domain d1ht1d_: 1ht1 D: [65927]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
      5. 335665Domain d1ht1v_: 1ht1 V: [65932]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
      6. 335666Domain d1ht1x_: 1ht1 X: [65933]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
      7. 335667Domain d1ht1y_: 1ht1 Y: [65934]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
        complexed with adp
      8. 335668Domain d1ht1z_: 1ht1 Z: [65935]
        Other proteins in same PDB: d1ht1e_, d1ht1f_, d1ht1g_, d1ht1i_
    6. Domains for 1ht2:
      1. 335669Domain d1ht2a_: 1ht2 A: [65936]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
      2. 335670Domain d1ht2b_: 1ht2 B: [65937]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
      3. 335671Domain d1ht2c_: 1ht2 C: [65938]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
      4. 335672Domain d1ht2d_: 1ht2 D: [65939]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
      5. 335673Domain d1ht2i_: 1ht2 I: [65944]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
      6. 335674Domain d1ht2j_: 1ht2 J: [65945]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
      7. 335675Domain d1ht2k_: 1ht2 K: [65946]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
      8. 335676Domain d1ht2l_: 1ht2 L: [65947]
        Other proteins in same PDB: d1ht2e_, d1ht2f_, d1ht2g_, d1ht2h_
        complexed with adp
    7. Domains for 1ned:
      1. 335689Domain d1neda_: 1ned A: [41974]
      2. 335690Domain d1nedb_: 1ned B: [41975]
      3. 335691Domain d1nedc_: 1ned C: [41976]
  2. 335696Haemophilus influenzae [TaxId:727] [56260] (6 PDB entries)
    1. Domains for 1g3i:
      1. 335727Domain d1g3ig_: 1g3i G: [41992]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      2. 335728Domain d1g3ih_: 1g3i H: [41993]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      3. 335729Domain d1g3ii_: 1g3i I: [41994]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      4. 335730Domain d1g3ij_: 1g3i J: [41995]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      5. 335731Domain d1g3ik_: 1g3i K: [41996]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      6. 335732Domain d1g3il_: 1g3i L: [41997]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      7. 335733Domain d1g3im_: 1g3i M: [41998]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      8. 335734Domain d1g3in_: 1g3i N: [41999]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      9. 335735Domain d1g3io_: 1g3i O: [42000]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      10. 335736Domain d1g3ip_: 1g3i P: [42001]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      11. 335737Domain d1g3iq_: 1g3i Q: [42002]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
      12. 335738Domain d1g3ir_: 1g3i R: [42003]
        Other proteins in same PDB: d1g3ia_, d1g3ib_, d1g3ic_, d1g3id_, d1g3ie_, d1g3if_, d1g3is_, d1g3it_, d1g3iu_, d1g3iv_, d1g3iw_, d1g3ix_
        complexed with atp
    2. Domains for 1g3k:
      1. 335700Domain d1g3ka_: 1g3k A: [41989]
      2. 335701Domain d1g3kb_: 1g3k B: [41990]
      3. 335702Domain d1g3kc_: 1g3k C: [41991]
        complexed with na
    3. Domains for 1jjw:
      1. 335697Domain d1jjwa_: 1jjw A: [66781]
      2. 335698Domain d1jjwb_: 1jjw B: [66782]
      3. 335699Domain d1jjwc_: 1jjw C: [66783]
        complexed with k
    4. Domains for 1kyi:
      1. 335715Domain d1kyig_: 1kyi G: [73229]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      2. 335716Domain d1kyih_: 1kyi H: [73230]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      3. 335717Domain d1kyii_: 1kyi I: [73231]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      4. 335718Domain d1kyij_: 1kyi J: [73232]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      5. 335719Domain d1kyik_: 1kyi K: [73233]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      6. 335720Domain d1kyil_: 1kyi L: [73234]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      7. 335721Domain d1kyim_: 1kyi M: [73235]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      8. 335722Domain d1kyin_: 1kyi N: [73236]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      9. 335723Domain d1kyio_: 1kyi O: [73237]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      10. 335724Domain d1kyip_: 1kyi P: [73238]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      11. 335725Domain d1kyiq_: 1kyi Q: [73239]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
      12. 335726Domain d1kyir_: 1kyi R: [73240]
        Other proteins in same PDB: d1kyia_, d1kyib_, d1kyic_, d1kyid_, d1kyie_, d1kyif_, d1kyis_, d1kyit_, d1kyiu_, d1kyiv_, d1kyiw_, d1kyix_
        complexed with atp, lvs
    5. Domains for 1ofh:
      1. 335703Domain d1ofhg_: 1ofh G: [86951]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
      2. 335704Domain d1ofhh_: 1ofh H: [86952]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
      3. 335705Domain d1ofhi_: 1ofh I: [86953]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
      4. 335706Domain d1ofhl_: 1ofh L: [86954]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
      5. 335707Domain d1ofhm_: 1ofh M: [86955]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
      6. 335708Domain d1ofhn_: 1ofh N: [86956]
        Other proteins in same PDB: d1ofha_, d1ofhb_, d1ofhc_
        complexed with adp, mg, mo3, mo4, po4
    6. Domains for 1ofi:
      1. 335709Domain d1ofig_: 1ofi G: [86960]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
      2. 335710Domain d1ofih_: 1ofi H: [86961]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
      3. 335711Domain d1ofii_: 1ofi I: [86962]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
      4. 335712Domain d1ofil_: 1ofi L: [86963]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
      5. 335713Domain d1ofim_: 1ofi M: [86964]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
      6. 335714Domain d1ofin_: 1ofi N: [86965]
        Other proteins in same PDB: d1ofia_, d1ofib_, d1ofic_
        complexed with adp, lvs, mg, mo3, mo4, po4
  3. 335739Thermotoga maritima [TaxId:243274] [90045] (1 PDB entry)

More info for Protein HslV (ClpQ) protease from d.153.1.4: Proteasome subunits

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