Lineage for Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 713694Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (334 folds)
  3. 735798Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 735799Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (6 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 735943Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (3 proteins)
  6. 736244Protein Proteasome beta subunit (catalytic) [56252] (5 species)
  7. 736253Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [56253] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]:

  1. Domain(s) for 1pma:
    1. 736275Domain d1pma1_: 1pma 1: [41874]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    2. 736276Domain d1pma2_: 1pma 2: [41875]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    3. 736277Domain d1pmab_: 1pma B: [41862]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    4. 736278Domain d1pmap_: 1pma P: [41863]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    5. 736279Domain d1pmaq_: 1pma Q: [41864]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    6. 736280Domain d1pmar_: 1pma R: [41865]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    7. 736281Domain d1pmas_: 1pma S: [41866]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    8. 736282Domain d1pmat_: 1pma T: [41867]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    9. 736283Domain d1pmau_: 1pma U: [41868]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    10. 736284Domain d1pmav_: 1pma V: [41869]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    11. 736285Domain d1pmaw_: 1pma W: [41870]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    12. 736286Domain d1pmax_: 1pma X: [41871]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    13. 736287Domain d1pmay_: 1pma Y: [41872]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    14. 736288Domain d1pmaz_: 1pma Z: [41873]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
  2. Domain(s) for 1ya7:
    1. 736261Domain d1ya7h1: 1ya7 H:1-203 [122797]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a1, d1ya7b1, d1ya7c1, d1ya7d1, d1ya7e1, d1ya7f1, d1ya7g1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    2. 736262Domain d1ya7i1: 1ya7 I:1-203 [122798]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a1, d1ya7b1, d1ya7c1, d1ya7d1, d1ya7e1, d1ya7f1, d1ya7g1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    3. 736263Domain d1ya7j1: 1ya7 J:1-203 [122799]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a1, d1ya7b1, d1ya7c1, d1ya7d1, d1ya7e1, d1ya7f1, d1ya7g1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    4. 736264Domain d1ya7k1: 1ya7 K:1-203 [122800]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a1, d1ya7b1, d1ya7c1, d1ya7d1, d1ya7e1, d1ya7f1, d1ya7g1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    5. 736265Domain d1ya7l1: 1ya7 L:1-203 [122801]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a1, d1ya7b1, d1ya7c1, d1ya7d1, d1ya7e1, d1ya7f1, d1ya7g1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    6. 736266Domain d1ya7m1: 1ya7 M:1-203 [122802]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a1, d1ya7b1, d1ya7c1, d1ya7d1, d1ya7e1, d1ya7f1, d1ya7g1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    7. 736267Domain d1ya7n1: 1ya7 N:1-203 [122803]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a1, d1ya7b1, d1ya7c1, d1ya7d1, d1ya7e1, d1ya7f1, d1ya7g1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4
  3. Domain(s) for 1yar:
    1. 736254Domain d1yarh1: 1yar H:1-203 [122844]
      Other proteins in same PDB: d1yara1, d1yarb1, d1yarc1, d1yard1, d1yare1, d1yarf1, d1yarg1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    2. 736255Domain d1yari1: 1yar I:1-203 [122845]
      Other proteins in same PDB: d1yara1, d1yarb1, d1yarc1, d1yard1, d1yare1, d1yarf1, d1yarg1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    3. 736256Domain d1yarj1: 1yar J:1-203 [122846]
      Other proteins in same PDB: d1yara1, d1yarb1, d1yarc1, d1yard1, d1yare1, d1yarf1, d1yarg1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    4. 736257Domain d1yark1: 1yar K:1-203 [122847]
      Other proteins in same PDB: d1yara1, d1yarb1, d1yarc1, d1yard1, d1yare1, d1yarf1, d1yarg1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    5. 736258Domain d1yarl1: 1yar L:1-203 [122848]
      Other proteins in same PDB: d1yara1, d1yarb1, d1yarc1, d1yard1, d1yare1, d1yarf1, d1yarg1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    6. 736259Domain d1yarm1: 1yar M:1-203 [122849]
      Other proteins in same PDB: d1yara1, d1yarb1, d1yarc1, d1yard1, d1yare1, d1yarf1, d1yarg1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    7. 736260Domain d1yarn1: 1yar N:1-203 [122850]
      Other proteins in same PDB: d1yara1, d1yarb1, d1yarc1, d1yard1, d1yare1, d1yarf1, d1yarg1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
  4. Domain(s) for 1yau:
    1. 736268Domain d1yauh1: 1yau H:1-203 [122858]
      Other proteins in same PDB: d1yaua1, d1yaub1, d1yauc1, d1yaud1, d1yaue1, d1yauf1, d1yaug1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    2. 736269Domain d1yaui1: 1yau I:1-203 [122859]
      Other proteins in same PDB: d1yaua1, d1yaub1, d1yauc1, d1yaud1, d1yaue1, d1yauf1, d1yaug1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    3. 736270Domain d1yauj1: 1yau J:1-203 [122860]
      Other proteins in same PDB: d1yaua1, d1yaub1, d1yauc1, d1yaud1, d1yaue1, d1yauf1, d1yaug1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    4. 736271Domain d1yauk1: 1yau K:1-203 [122861]
      Other proteins in same PDB: d1yaua1, d1yaub1, d1yauc1, d1yaud1, d1yaue1, d1yauf1, d1yaug1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    5. 736272Domain d1yaul1: 1yau L:1-203 [122862]
      Other proteins in same PDB: d1yaua1, d1yaub1, d1yauc1, d1yaud1, d1yaue1, d1yauf1, d1yaug1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    6. 736273Domain d1yaum1: 1yau M:1-203 [122863]
      Other proteins in same PDB: d1yaua1, d1yaub1, d1yauc1, d1yaud1, d1yaue1, d1yauf1, d1yaug1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    7. 736274Domain d1yaun1: 1yau N:1-203 [122864]
      Other proteins in same PDB: d1yaua1, d1yaub1, d1yauc1, d1yaud1, d1yaue1, d1yauf1, d1yaug1
      automatically matched to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant

More info for Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome beta subunit (catalytic)

Timeline for Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome beta subunit (catalytic):