Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds) |
Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily) core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta |
Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (3 families) Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues |
Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (7 proteins) Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal |
Protein Cytochrome bc1 core subunit 2 [63409] (4 species) |
Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [56000] (19 PDB entries) Uniprot P23004 |
Domain d1be3b1: 1be3 B:21-235 [58952] Other proteins in same PDB: d1be3a1, d1be3a2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3i_, d1be3j_, d1be3k_ complexed with fes, hec, hem |
Domain d1be3b2: 1be3 B:236-439 [58953] Other proteins in same PDB: d1be3a1, d1be3a2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3i_, d1be3j_, d1be3k_ complexed with fes, hec, hem |
Domain d1bgyb1: 1bgy B:21-235 [58956] Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_ complexed with fes, hec, hem |
Domain d1bgyb2: 1bgy B:236-439 [58957] Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_ complexed with fes, hec, hem |
Domain d1bgyn1: 1bgy N:21-235 [58960] Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_ complexed with fes, hec, hem |
Domain d1bgyn2: 1bgy N:236-439 [58961] Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_ complexed with fes, hec, hem |
Domain d1l0lb1: 1l0l B:17-235 [84484] Other proteins in same PDB: d1l0la1, d1l0la2, d1l0lc1, d1l0lc2, d1l0ld1, d1l0ld2, d1l0le1, d1l0le2, d1l0lf_, d1l0lg_, d1l0lh_, d1l0li_, d1l0lj_, d1l0lk_ complexed with fes, fmx, hem |
Domain d1l0lb2: 1l0l B:236-439 [84485] Other proteins in same PDB: d1l0la1, d1l0la2, d1l0lc1, d1l0lc2, d1l0ld1, d1l0ld2, d1l0le1, d1l0le2, d1l0lf_, d1l0lg_, d1l0lh_, d1l0li_, d1l0lj_, d1l0lk_ complexed with fes, fmx, hem |
Domain d1l0nb1: 1l0n B:17-235 [84500] Other proteins in same PDB: d1l0na1, d1l0na2, d1l0nc1, d1l0nc2, d1l0nd1, d1l0nd2, d1l0ne1, d1l0ne2, d1l0nf_, d1l0ng_, d1l0nh_, d1l0ni_, d1l0nj_, d1l0nk_ complexed with fes, hem |
Domain d1l0nb2: 1l0n B:236-439 [84501] Other proteins in same PDB: d1l0na1, d1l0na2, d1l0nc1, d1l0nc2, d1l0nd1, d1l0nd2, d1l0ne1, d1l0ne2, d1l0nf_, d1l0ng_, d1l0nh_, d1l0ni_, d1l0nj_, d1l0nk_ complexed with fes, hem |
Domain d1ntkb1: 1ntk B:17-235 [92107] Other proteins in same PDB: d1ntka1, d1ntka2, d1ntkc1, d1ntkc2, d1ntkd1, d1ntkd2, d1ntke1, d1ntke2, d1ntkf_, d1ntkg_, d1ntkh_, d1ntki_, d1ntkj_, d1ntkk_ complexed with ay1, fes, hem |
Domain d1ntkb2: 1ntk B:236-439 [92108] Other proteins in same PDB: d1ntka1, d1ntka2, d1ntkc1, d1ntkc2, d1ntkd1, d1ntkd2, d1ntke1, d1ntke2, d1ntkf_, d1ntkg_, d1ntkh_, d1ntki_, d1ntkj_, d1ntkk_ complexed with ay1, fes, hem |
Domain d1ntmb1: 1ntm B:17-235 [92123] Other proteins in same PDB: d1ntma1, d1ntma2, d1ntmc1, d1ntmc2, d1ntmd1, d1ntmd2, d1ntme1, d1ntme2, d1ntmf_, d1ntmg_, d1ntmh_, d1ntmi_, d1ntmj_, d1ntmk_ complexed with fes, hem |
Domain d1ntmb2: 1ntm B:236-439 [92124] Other proteins in same PDB: d1ntma1, d1ntma2, d1ntmc1, d1ntmc2, d1ntmd1, d1ntmd2, d1ntme1, d1ntme2, d1ntmf_, d1ntmg_, d1ntmh_, d1ntmi_, d1ntmj_, d1ntmk_ complexed with fes, hem |
Domain d1ntzb1: 1ntz B:17-235 [92151] Other proteins in same PDB: d1ntza1, d1ntza2, d1ntzc1, d1ntzc2, d1ntzd1, d1ntzd2, d1ntze1, d1ntze2, d1ntzf_, d1ntzg_, d1ntzh_, d1ntzi_, d1ntzj_, d1ntzk_ complexed with fes, hem, uq2 |
Domain d1ntzb2: 1ntz B:236-439 [92152] Other proteins in same PDB: d1ntza1, d1ntza2, d1ntzc1, d1ntzc2, d1ntzd1, d1ntzd2, d1ntze1, d1ntze2, d1ntzf_, d1ntzg_, d1ntzh_, d1ntzi_, d1ntzj_, d1ntzk_ complexed with fes, hem, uq2 |
Domain d1nu1b1: 1nu1 B:17-235 [92169] Other proteins in same PDB: d1nu1a1, d1nu1a2, d1nu1c1, d1nu1c2, d1nu1d1, d1nu1d2, d1nu1e1, d1nu1e2, d1nu1f_, d1nu1g_, d1nu1h_, d1nu1i_, d1nu1j_, d1nu1k_ complexed with fes, hem, qno |
Domain d1nu1b2: 1nu1 B:236-439 [92170] Other proteins in same PDB: d1nu1a1, d1nu1a2, d1nu1c1, d1nu1c2, d1nu1d1, d1nu1d2, d1nu1e1, d1nu1e2, d1nu1f_, d1nu1g_, d1nu1h_, d1nu1i_, d1nu1j_, d1nu1k_ complexed with fes, hem, qno |
Domain d1pp9b1: 1pp9 B:17-235 [104224] Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_ complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, uq |
Domain d1pp9b2: 1pp9 B:236-439 [104225] Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_ complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, uq |
Domain d1pp9o1: 1pp9 O:17-235 [104239] Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_ complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, uq |
Domain d1pp9o2: 1pp9 O:236-439 [104240] Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_ complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, uq |
Domain d1ppjb1: 1ppj B:17-235 [104254] Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_ complexed with any, azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma |
Domain d1ppjb2: 1ppj B:236-439 [104255] Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_ complexed with any, azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma |
Domain d1ppjo1: 1ppj O:17-235 [104269] Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_ complexed with any, azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma |
Domain d1ppjo2: 1ppj O:236-439 [104270] Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_ complexed with any, azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma |
Domain d1qcrb1: 1qcr B:17-235 [59027] Other proteins in same PDB: d1qcra1, d1qcra2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_ complexed with hem |
Domain d1qcrb2: 1qcr B:236-439 [59028] Other proteins in same PDB: d1qcra1, d1qcra2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_ complexed with hem |
Domain d1sqbb1: 1sqb B:17-235 [105892] Other proteins in same PDB: d1sqba1, d1sqba2, d1sqbc1, d1sqbc2, d1sqbd1, d1sqbd2, d1sqbe1, d1sqbe2, d1sqbf_, d1sqbg_, d1sqbh_, d1sqbi_, d1sqbj_, d1sqbk_ complexed with azo, fes, hem |
Domain d1sqbb2: 1sqb B:236-439 [105893] Other proteins in same PDB: d1sqba1, d1sqba2, d1sqbc1, d1sqbc2, d1sqbd1, d1sqbd2, d1sqbe1, d1sqbe2, d1sqbf_, d1sqbg_, d1sqbh_, d1sqbi_, d1sqbj_, d1sqbk_ complexed with azo, fes, hem |
Domain d1sqpb1: 1sqp B:17-235 [118997] Other proteins in same PDB: d1sqpa1, d1sqpa2, d1sqpc1, d1sqpc2, d1sqpd1, d1sqpd2, d1sqpe1, d1sqpe2, d1sqpf1, d1sqpg_, d1sqph_, d1sqpi_, d1sqpj_, d1sqpk1 automated match to d1sqbb1 complexed with cdl, fes, hem, myx, pee, plx |
Domain d1sqpb2: 1sqp B:236-439 [118998] Other proteins in same PDB: d1sqpa1, d1sqpa2, d1sqpc1, d1sqpc2, d1sqpd1, d1sqpd2, d1sqpe1, d1sqpe2, d1sqpf1, d1sqpg_, d1sqph_, d1sqpi_, d1sqpj_, d1sqpk1 automated match to d1sqbb2 complexed with cdl, fes, hem, myx, pee, plx |
Domain d1sqvb1: 1sqv B:17-235 [119022] Other proteins in same PDB: d1sqva1, d1sqva2, d1sqvc1, d1sqvc2, d1sqvd1, d1sqvd2, d1sqve1, d1sqve2, d1sqvf_, d1sqvg_, d1sqvh_, d1sqvi_, d1sqvj_, d1sqvk_ automated match to d1ppjb1 complexed with fes, hem, uhd, uq2 |
Domain d1sqvb2: 1sqv B:236-439 [119023] Other proteins in same PDB: d1sqva1, d1sqva2, d1sqvc1, d1sqvc2, d1sqvd1, d1sqvd2, d1sqve1, d1sqve2, d1sqvf_, d1sqvg_, d1sqvh_, d1sqvi_, d1sqvj_, d1sqvk_ automated match to d1ppjb2 complexed with fes, hem, uhd, uq2 |
Domain d1sqxb1: 1sqx B:17-235 [119037] Other proteins in same PDB: d1sqxa1, d1sqxa2, d1sqxc1, d1sqxc2, d1sqxd1, d1sqxd2, d1sqxe1, d1sqxe2, d1sqxf_, d1sqxg_, d1sqxh_, d1sqxi_, d1sqxj_, d1sqxk_ automated match to d1ppjb1 complexed with fes, hem, sma, uq2 |
Domain d1sqxb2: 1sqx B:236-439 [119038] Other proteins in same PDB: d1sqxa1, d1sqxa2, d1sqxc1, d1sqxc2, d1sqxd1, d1sqxd2, d1sqxe1, d1sqxe2, d1sqxf_, d1sqxg_, d1sqxh_, d1sqxi_, d1sqxj_, d1sqxk_ automated match to d1ppjb2 complexed with fes, hem, sma, uq2 |
Domain d2a06b1: 2a06 B:17-235 [125921] Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_ automated match to d1ppjb1 complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, unl, uq |
Domain d2a06b2: 2a06 B:236-439 [125922] Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_ automated match to d1ppjb2 complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, unl, uq |
Domain d2a06o1: 2a06 O:17-235 [125930] Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_ automated match to d1ppjb1 complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, unl, uq |
Domain d2a06o2: 2a06 O:236-439 [125931] Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_ automated match to d1ppjb2 complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, unl, uq |
Domain d2fyub1: 2fyu B:17-235 [134394] Other proteins in same PDB: d2fyua1, d2fyua2, d2fyuc1, d2fyuc2, d2fyud1, d2fyud2, d2fyue1, d2fyue2, d2fyuf_, d2fyug_, d2fyuh_, d2fyui_, d2fyuj_, d2fyuk_ automated match to d1ppjb1 complexed with fdn, fes, hem |
Domain d2fyub2: 2fyu B:236-439 [134395] Other proteins in same PDB: d2fyua1, d2fyua2, d2fyuc1, d2fyuc2, d2fyud1, d2fyud2, d2fyue1, d2fyue2, d2fyuf_, d2fyug_, d2fyuh_, d2fyui_, d2fyuj_, d2fyuk_ automated match to d1ppjb2 complexed with fdn, fes, hem |
Domain d5klvb1: 5klv B:15-235 [323993] Other proteins in same PDB: d5klva1, d5klva2, d5klvc1, d5klvc2, d5klvd1, d5klvd2, d5klve1, d5klve2, d5klvg_, d5klvh_, d5klvj_, d5klvk_ automated match to d1ntmb1 complexed with 6pe, 8pe, cdl, cl, fes, fnm, gol, hec, hem, pef, px4 |
Domain d5klvb2: 5klv B:236-439 [323994] Other proteins in same PDB: d5klva1, d5klva2, d5klvc1, d5klvc2, d5klvd1, d5klvd2, d5klve1, d5klve2, d5klvg_, d5klvh_, d5klvj_, d5klvk_ automated match to d1ntmb2 complexed with 6pe, 8pe, cdl, cl, fes, fnm, gol, hec, hem, pef, px4 |
Domain d6nhgb1: 6nhg B:15-235 [370756] Other proteins in same PDB: d6nhga1, d6nhga2, d6nhgc1, d6nhgc2, d6nhgd1, d6nhgd2, d6nhge1, d6nhge2, d6nhgg_, d6nhgh_, d6nhgj_, d6nhgk_ automated match to d1ntmb1 complexed with 6pe, 8pe, azo, cdl, fes, hec, hem, mc3 |
Domain d6nhgb2: 6nhg B:236-439 [370757] Other proteins in same PDB: d6nhga1, d6nhga2, d6nhgc1, d6nhgc2, d6nhgd1, d6nhgd2, d6nhge1, d6nhge2, d6nhgg_, d6nhgh_, d6nhgj_, d6nhgk_ automated match to d1ntmb2 complexed with 6pe, 8pe, azo, cdl, fes, hec, hem, mc3 |
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