Lineage for Species: Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId: 3562]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2152203Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2172288Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (59 superfamilies)
    alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
  4. 2175267Superfamily d.58.9: RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain [54966] (2 families) (S)
    C-terminal domain is beta/alpha barrel
  5. 2175268Family d.58.9.1: Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [54967] (1 protein)
  6. 2175269Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [54968] (12 species)
  7. 2175363Species Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId:3562] [54970] (11 PDB entries)

PDB entries in Species: Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId: 3562]:

  1. Domain(s) for 1aa1:
    1. 2175380Domain d1aa1b2: 1aa1 B:21-147 [39254]
      Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1c_, d1aa1e1, d1aa1f_, d1aa1h1, d1aa1i_, d1aa1l1, d1aa1s_
      complexed with 3pg, mg
    2. 2175381Domain d1aa1e2: 1aa1 E:21-147 [39255]
      Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1c_, d1aa1e1, d1aa1f_, d1aa1h1, d1aa1i_, d1aa1l1, d1aa1s_
      complexed with 3pg, mg
    3. 2175382Domain d1aa1h2: 1aa1 H:21-147 [39256]
      Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1c_, d1aa1e1, d1aa1f_, d1aa1h1, d1aa1i_, d1aa1l1, d1aa1s_
      complexed with 3pg, mg
    4. 2175383Domain d1aa1l2: 1aa1 L:21-147 [39253]
      Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1c_, d1aa1e1, d1aa1f_, d1aa1h1, d1aa1i_, d1aa1l1, d1aa1s_
      complexed with 3pg, mg
  2. Domain(s) for 1aus:
    1. 2175388Domain d1ausl2: 1aus L:20-147 [39261]
      Other proteins in same PDB: d1ausl1, d1ausm1, d1ausn1, d1auso1, d1auss_, d1aust_, d1ausu_, d1ausv_
      complexed with fmt, mg
    2. 2175389Domain d1ausm2: 1aus M:20-147 [118410]
      Other proteins in same PDB: d1ausl1, d1ausm1, d1ausn1, d1auso1, d1auss_, d1aust_, d1ausu_, d1ausv_
      duplicate of 1AUS L:20-147
      complexed with fmt, mg
    3. 2175390Domain d1ausn2: 1aus N:20-147 [118412]
      Other proteins in same PDB: d1ausl1, d1ausm1, d1ausn1, d1auso1, d1auss_, d1aust_, d1ausu_, d1ausv_
      duplicate of 1AUS L:20-147
      complexed with fmt, mg
    4. 2175391Domain d1auso2: 1aus O:20-147 [118414]
      Other proteins in same PDB: d1ausl1, d1ausm1, d1ausn1, d1auso1, d1auss_, d1aust_, d1ausu_, d1ausv_
      duplicate of 1AUS L:20-147
      complexed with fmt, mg
  3. Domain(s) for 1bur:
    1. 2175368Domain d1bura3: 1bur A:12-147 [302247]
      Other proteins in same PDB: d1bura4, d1burb4, d1burc4, d1burd4, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      automated match to d8ruca2
      complexed with cap, mg
    2. 2175369Domain d1burb3: 1bur B:12-147 [302249]
      Other proteins in same PDB: d1bura4, d1burb4, d1burc4, d1burd4, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      automated match to d8ruca2
      complexed with cap, mg
    3. 2175370Domain d1burc3: 1bur C:12-147 [302251]
      Other proteins in same PDB: d1bura4, d1burb4, d1burc4, d1burd4, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      automated match to d8ruca2
      complexed with cap, mg
    4. 2175371Domain d1burd3: 1bur D:12-147 [302253]
      Other proteins in same PDB: d1bura4, d1burb4, d1burc4, d1burd4, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      automated match to d8ruca2
      complexed with cap, mg
  4. Domain(s) for 1ir1:
    1. 2175372Domain d1ir1a2: 1ir1 A:12-147 [71283]
      Other proteins in same PDB: d1ir1a1, d1ir1b1, d1ir1c1, d1ir1d1, d1ir1s_, d1ir1t_, d1ir1u_, d1ir1v_
      complexed with cap, mg
    2. 2175373Domain d1ir1b2: 1ir1 B:12-147 [71285]
      Other proteins in same PDB: d1ir1a1, d1ir1b1, d1ir1c1, d1ir1d1, d1ir1s_, d1ir1t_, d1ir1u_, d1ir1v_
      complexed with cap, mg
    3. 2175374Domain d1ir1c2: 1ir1 C:12-147 [71287]
      Other proteins in same PDB: d1ir1a1, d1ir1b1, d1ir1c1, d1ir1d1, d1ir1s_, d1ir1t_, d1ir1u_, d1ir1v_
      complexed with cap, mg
    4. 2175375Domain d1ir1d2: 1ir1 D:12-147 [71289]
      Other proteins in same PDB: d1ir1a1, d1ir1b1, d1ir1c1, d1ir1d1, d1ir1s_, d1ir1t_, d1ir1u_, d1ir1v_
      complexed with cap, mg
  5. Domain(s) for 1rbo:
    1. 2175376Domain d1rbob2: 1rbo B:9-147 [39250]
      Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rboc_, d1rboe1, d1rbof_, d1rboh1, d1rboi_, d1rbol1, d1rbos_
      complexed with cap
    2. 2175377Domain d1rboe2: 1rbo E:9-147 [39251]
      Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rboc_, d1rboe1, d1rbof_, d1rboh1, d1rboi_, d1rbol1, d1rbos_
      complexed with cap
    3. 2175378Domain d1rboh2: 1rbo H:9-147 [39252]
      Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rboc_, d1rboe1, d1rbof_, d1rboh1, d1rboi_, d1rbol1, d1rbos_
      complexed with cap
    4. 2175379Domain d1rbol2: 1rbo L:9-147 [39249]
      Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rboc_, d1rboe1, d1rbof_, d1rboh1, d1rboi_, d1rbol1, d1rbos_
      complexed with cap
  6. Domain(s) for 1rco:
    1. 2175392Domain d1rcob2: 1rco B:9-147 [39263]
      Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      complexed with xdp
    2. 2175393Domain d1rcoe2: 1rco E:9-147 [39264]
      Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      complexed with xdp
    3. 2175394Domain d1rcoh2: 1rco H:9-147 [39265]
      Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      complexed with xdp
    4. 2175395Domain d1rcok2: 1rco K:9-147 [39266]
      Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      complexed with xdp
    5. 2175396Domain d1rcol2: 1rco L:9-147 [39262]
      Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      complexed with xdp
    6. 2175397Domain d1rcoo2: 1rco O:9-147 [39267]
      Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      complexed with xdp
    7. 2175398Domain d1rcor2: 1rco R:9-147 [39268]
      Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      complexed with xdp
    8. 2175399Domain d1rcov2: 1rco V:9-147 [39269]
      Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      complexed with xdp
  7. Domain(s) for 1rcx:
    1. 2175408Domain d1rcxb2: 1rcx B:9-147 [39271]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      complexed with rub
    2. 2175409Domain d1rcxe2: 1rcx E:9-147 [39272]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      complexed with rub
    3. 2175410Domain d1rcxh2: 1rcx H:9-147 [39273]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      complexed with rub
    4. 2175411Domain d1rcxk2: 1rcx K:9-147 [39274]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      complexed with rub
    5. 2175412Domain d1rcxl2: 1rcx L:9-147 [39270]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      complexed with rub
    6. 2175413Domain d1rcxo2: 1rcx O:9-147 [39275]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      complexed with rub
    7. 2175414Domain d1rcxr2: 1rcx R:9-147 [39276]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      complexed with rub
    8. 2175415Domain d1rcxv2: 1rcx V:9-147 [39277]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      complexed with rub
  8. Domain(s) for 1rxo:
    1. 2175384Domain d1rxob2: 1rxo B:9-147 [39258]
      Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxoc_, d1rxoe1, d1rxof_, d1rxoh1, d1rxoi_, d1rxol1, d1rxos_
      complexed with ca, rub
    2. 2175385Domain d1rxoe2: 1rxo E:9-147 [39259]
      Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxoc_, d1rxoe1, d1rxof_, d1rxoh1, d1rxoi_, d1rxol1, d1rxos_
      complexed with ca, rub
    3. 2175386Domain d1rxoh2: 1rxo H:9-147 [39260]
      Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxoc_, d1rxoe1, d1rxof_, d1rxoh1, d1rxoi_, d1rxol1, d1rxos_
      complexed with ca, rub
    4. 2175387Domain d1rxol2: 1rxo L:9-147 [39257]
      Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxoc_, d1rxoe1, d1rxof_, d1rxoh1, d1rxoi_, d1rxol1, d1rxos_
      complexed with ca, rub
  9. Domain(s) for 1upm:
    1. 2175400Domain d1upmb1: 1upm B:9-147 [197555]
      Other proteins in same PDB: d1upmb2, d1upmc_, d1upme2, d1upmf_, d1upmh2, d1upmi_, d1upmk2, d1upml2, d1upmm_, d1upmo2, d1upmp_, d1upmr2, d1upms_, d1upmt_, d1upmv2, d1upmw_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    2. 2175401Domain d1upme1: 1upm E:9-147 [197557]
      Other proteins in same PDB: d1upmb2, d1upmc_, d1upme2, d1upmf_, d1upmh2, d1upmi_, d1upmk2, d1upml2, d1upmm_, d1upmo2, d1upmp_, d1upmr2, d1upms_, d1upmt_, d1upmv2, d1upmw_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    3. 2175402Domain d1upmh1: 1upm H:9-147 [197559]
      Other proteins in same PDB: d1upmb2, d1upmc_, d1upme2, d1upmf_, d1upmh2, d1upmi_, d1upmk2, d1upml2, d1upmm_, d1upmo2, d1upmp_, d1upmr2, d1upms_, d1upmt_, d1upmv2, d1upmw_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    4. 2175403Domain d1upmk1: 1upm K:9-147 [197561]
      Other proteins in same PDB: d1upmb2, d1upmc_, d1upme2, d1upmf_, d1upmh2, d1upmi_, d1upmk2, d1upml2, d1upmm_, d1upmo2, d1upmp_, d1upmr2, d1upms_, d1upmt_, d1upmv2, d1upmw_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    5. 2175404Domain d1upml1: 1upm L:9-147 [197563]
      Other proteins in same PDB: d1upmb2, d1upmc_, d1upme2, d1upmf_, d1upmh2, d1upmi_, d1upmk2, d1upml2, d1upmm_, d1upmo2, d1upmp_, d1upmr2, d1upms_, d1upmt_, d1upmv2, d1upmw_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    6. 2175405Domain d1upmo1: 1upm O:9-147 [197565]
      Other proteins in same PDB: d1upmb2, d1upmc_, d1upme2, d1upmf_, d1upmh2, d1upmi_, d1upmk2, d1upml2, d1upmm_, d1upmo2, d1upmp_, d1upmr2, d1upms_, d1upmt_, d1upmv2, d1upmw_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    7. 2175406Domain d1upmr1: 1upm R:9-147 [197567]
      Other proteins in same PDB: d1upmb2, d1upmc_, d1upme2, d1upmf_, d1upmh2, d1upmi_, d1upmk2, d1upml2, d1upmm_, d1upmo2, d1upmp_, d1upmr2, d1upms_, d1upmt_, d1upmv2, d1upmw_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    8. 2175407Domain d1upmv1: 1upm V:9-147 [197569]
      Other proteins in same PDB: d1upmb2, d1upmc_, d1upme2, d1upmf_, d1upmh2, d1upmi_, d1upmk2, d1upml2, d1upmm_, d1upmo2, d1upmp_, d1upmr2, d1upms_, d1upmt_, d1upmv2, d1upmw_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
  10. Domain(s) for 1upp:
    1. 2175416Domain d1uppa1: 1upp A:9-147 [197571]
      Other proteins in same PDB: d1uppa2, d1uppc2, d1uppe2, d1uppg2, d1uppi_, d1uppj_, d1uppk_, d1uppl_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    2. 2175417Domain d1uppc1: 1upp C:9-147 [197573]
      Other proteins in same PDB: d1uppa2, d1uppc2, d1uppe2, d1uppg2, d1uppi_, d1uppj_, d1uppk_, d1uppl_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    3. 2175418Domain d1uppe1: 1upp E:9-147 [197575]
      Other proteins in same PDB: d1uppa2, d1uppc2, d1uppe2, d1uppg2, d1uppi_, d1uppj_, d1uppk_, d1uppl_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
    4. 2175419Domain d1uppg1: 1upp G:9-147 [197577]
      Other proteins in same PDB: d1uppa2, d1uppc2, d1uppe2, d1uppg2, d1uppi_, d1uppj_, d1uppk_, d1uppl_
      automated match to d8ruca2
      complexed with ca, cap
  11. Domain(s) for 8ruc:
    1. 2175364Domain d8ruca2: 8ruc A:9-147 [39245]
      Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8rucc1, d8ruce1, d8rucg1, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      complexed with cap, mg
    2. 2175365Domain d8rucc2: 8ruc C:9-147 [39246]
      Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8rucc1, d8ruce1, d8rucg1, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      complexed with cap, mg
    3. 2175366Domain d8ruce2: 8ruc E:9-147 [39247]
      Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8rucc1, d8ruce1, d8rucg1, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      complexed with cap, mg
    4. 2175367Domain d8rucg2: 8ruc G:9-147 [39248]
      Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8rucc1, d8ruce1, d8rucg1, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      complexed with cap, mg

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