Lineage for Species: Desulfovibrio africanus [TaxId: 873]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2152203Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2172288Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (59 superfamilies)
    alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
  4. 2172289Superfamily d.58.1: 4Fe-4S ferredoxins [54862] (7 families) (S)
  5. 2172425Family d.58.1.5: Ferredoxin domains from multidomain proteins [54884] (14 protein domains)
    members of this "family" may be more closely related to other ferredoxins than to each other
  6. 2172532Protein Pyruvate-ferredoxin oxidoreductase, PFOR, domain V [54889] (1 species)
  7. 2172533Species Desulfovibrio africanus [TaxId:873] [54890] (10 PDB entries)

PDB entries in Species: Desulfovibrio africanus [TaxId: 873]:

  1. Domain(s) for 1b0p:
    1. 2172546Domain d1b0pa5: 1b0p A:669-785 [39003]
      Other proteins in same PDB: d1b0pa1, d1b0pa2, d1b0pa3, d1b0pa4, d1b0pb1, d1b0pb2, d1b0pb3, d1b0pb4
      complexed with ca, mg, sf4, tpp
    2. 2172547Domain d1b0pb5: 1b0p B:669-785 [39004]
      Other proteins in same PDB: d1b0pa1, d1b0pa2, d1b0pa3, d1b0pa4, d1b0pb1, d1b0pb2, d1b0pb3, d1b0pb4
      complexed with ca, mg, sf4, tpp
  2. Domain(s) for 1kek:
    1. 2172538Domain d1keka5: 1kek A:669-785 [68528]
      Other proteins in same PDB: d1keka1, d1keka2, d1keka3, d1keka4, d1kekb1, d1kekb2, d1kekb3, d1kekb4
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
    2. 2172539Domain d1kekb5: 1kek B:669-785 [68533]
      Other proteins in same PDB: d1keka1, d1keka2, d1keka3, d1keka4, d1kekb1, d1kekb2, d1kekb3, d1kekb4
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
  3. Domain(s) for 2c3m:
    1. 2172536Domain d2c3ma5: 2c3m A:669-785 [129744]
      Other proteins in same PDB: d2c3ma1, d2c3ma2, d2c3ma3, d2c3ma4, d2c3mb1, d2c3mb2, d2c3mb3, d2c3mb4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, cl, mg, sf4, tpp
    2. 2172537Domain d2c3mb5: 2c3m B:669-785 [129749]
      Other proteins in same PDB: d2c3ma1, d2c3ma2, d2c3ma3, d2c3ma4, d2c3mb1, d2c3mb2, d2c3mb3, d2c3mb4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, cl, mg, sf4, tpp
  4. Domain(s) for 2c3o:
    1. 2172550Domain d2c3oa5: 2c3o A:669-785 [129754]
      Other proteins in same PDB: d2c3oa1, d2c3oa2, d2c3oa3, d2c3oa4, d2c3ob1, d2c3ob2, d2c3ob3, d2c3ob4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
    2. 2172551Domain d2c3ob5: 2c3o B:669-785 [129759]
      Other proteins in same PDB: d2c3oa1, d2c3oa2, d2c3oa3, d2c3oa4, d2c3ob1, d2c3ob2, d2c3ob3, d2c3ob4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
  5. Domain(s) for 2c3p:
    1. 2172542Domain d2c3pa5: 2c3p A:669-785 [129764]
      Other proteins in same PDB: d2c3pa1, d2c3pa2, d2c3pa3, d2c3pa4, d2c3pb1, d2c3pb2, d2c3pb3, d2c3pb4
      automated match to d1keka5
      complexed with 1tp, ca, mg, sf4
    2. 2172543Domain d2c3pb5: 2c3p B:669-785 [129769]
      Other proteins in same PDB: d2c3pa1, d2c3pa2, d2c3pa3, d2c3pa4, d2c3pb1, d2c3pb2, d2c3pb3, d2c3pb4
      automated match to d1keka5
      complexed with 1tp, ca, mg, sf4
  6. Domain(s) for 2c3u:
    1. 2172544Domain d2c3ua5: 2c3u A:669-785 [129774]
      Other proteins in same PDB: d2c3ua1, d2c3ua2, d2c3ua3, d2c3ua4, d2c3ub1, d2c3ub2, d2c3ub3, d2c3ub4
      automated match to d1keka5
      complexed with 2tp, ca, mg, pyr, sf4
    2. 2172545Domain d2c3ub5: 2c3u B:669-785 [129779]
      Other proteins in same PDB: d2c3ua1, d2c3ua2, d2c3ua3, d2c3ua4, d2c3ub1, d2c3ub2, d2c3ub3, d2c3ub4
      automated match to d1keka5
      complexed with 2tp, ca, mg, pyr, sf4
  7. Domain(s) for 2c3y:
    1. 2172540Domain d2c3ya5: 2c3y A:669-785 [129784]
      Other proteins in same PDB: d2c3ya1, d2c3ya2, d2c3ya3, d2c3ya4, d2c3yb1, d2c3yb2, d2c3yb3, d2c3yb4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
    2. 2172541Domain d2c3yb5: 2c3y B:669-785 [129789]
      Other proteins in same PDB: d2c3ya1, d2c3ya2, d2c3ya3, d2c3ya4, d2c3yb1, d2c3yb2, d2c3yb3, d2c3yb4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
  8. Domain(s) for 2c42:
    1. 2172534Domain d2c42a5: 2c42 A:669-785 [129794]
      Other proteins in same PDB: d2c42a1, d2c42a2, d2c42a3, d2c42a4, d2c42b1, d2c42b2, d2c42b3, d2c42b4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
    2. 2172535Domain d2c42b5: 2c42 B:669-785 [129799]
      Other proteins in same PDB: d2c42a1, d2c42a2, d2c42a3, d2c42a4, d2c42b1, d2c42b2, d2c42b3, d2c42b4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
  9. Domain(s) for 2pda:
    1. 2172552Domain d2pdaa5: 2pda A:669-785 [39005]
      Other proteins in same PDB: d2pdaa1, d2pdaa2, d2pdaa3, d2pdaa4, d2pdab1, d2pdab2, d2pdab3, d2pdab4
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
    2. 2172553Domain d2pdab5: 2pda B:669-785 [39006]
      Other proteins in same PDB: d2pdaa1, d2pdaa2, d2pdaa3, d2pdaa4, d2pdab1, d2pdab2, d2pdab3, d2pdab4
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
  10. Domain(s) for 2uza:
    1. 2172548Domain d2uzaa5: 2uza A:669-785 [152329]
      Other proteins in same PDB: d2uzaa1, d2uzaa2, d2uzaa3, d2uzaa4, d2uzab1, d2uzab2, d2uzab3, d2uzab4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
    2. 2172549Domain d2uzab5: 2uza B:669-785 [152334]
      Other proteins in same PDB: d2uzaa1, d2uzaa2, d2uzaa3, d2uzaa4, d2uzab1, d2uzab2, d2uzab3, d2uzab4
      automated match to d1keka5
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4

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