SCOPe 2.06: Protein: Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain

Lineage for Protein: Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain

Root: SCOPe 2.06
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
Fold d.45: ClpS-like [54735] (1 superfamily)
beta-alpha(2)-beta-alpha-beta; 2 layers, alpha/beta
Superfamily d.45.1: ClpS-like [54736] (3 families)
Family d.45.1.1: Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain [54737] (1 protein)
automatically mapped to Pfam PF00542
Protein Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain [54738] (3 species)

Species:

Deinococcus radiodurans [TaxId:1299] [160198] (1 PDB entry)
Uniprot Q9RST0 52-122

Domain for 2zjq:

Domain d2zjq51: 2zjq 5:52-122 [154521]
Other proteins in same PDB: d2zjq11, d2zjq21, d2zjq31, d2zjq41, d2zjqa1, d2zjqa2, d2zjqb1, d2zjqc1, d2zjqd1, d2zjqe1, d2zjqe2, d2zjqf1, d2zjqf2, d2zjqg1, d2zjqh1, d2zjqi1, d2zjqj1, d2zjqk1, d2zjql1, d2zjqm1, d2zjqn1, d2zjqo1, d2zjqp1, d2zjqq1, d2zjqr1, d2zjqs1, d2zjqt1, d2zjqu1, d2zjqv1, d2zjqw1, d2zjqz1
Representative structure
protein/RNA complex

Escherichia coli [TaxId:562] [54739] (7 PDB entries)

Domain for 1ctf:
- Domain d1ctfa_: 1ctf A: [38759]
  complexed with so4
Domain for 1rqs:
- Domain d1rqsa_: 1rqs A: [97770]
Domains for 1rqu:
1. Domain d1rqua2: 1rqu A:52-120 [97774]
  Other proteins in same PDB: d1rqua1, d1rqub1
2. Domain d1rqub2: 1rqu B:52-120 [97776]
  Other proteins in same PDB: d1rqua1, d1rqub1
Domains for 1rqv:
1. Domain d1rqva2: 1rqv A:52-120 [97778]
  Other proteins in same PDB: d1rqva1, d1rqvb1
2. Domain d1rqvb2: 1rqv B:52-120 [97780]
  Other proteins in same PDB: d1rqva1, d1rqvb1
Domain for 2bcw:
- Domain d2bcwb1: 2bcw B:53-120 [128320]
  Other proteins in same PDB: d2bcwa1
  automatically matched to d1rqsa_

Domains for 2gya:

Domain d2gya32: 2gya 3:49-120 [135835]
Other proteins in same PDB: d2gya11, d2gya31, d2gya51, d2gyab1, d2gyac1, d2gyad1, d2gyaf1, d2gyaf2, d2gyag1, d2gyag2, d2gyah1, d2gyai1, d2gyaj1, d2gyak1, d2gyam1, d2gyan1, d2gyao1, d2gyaq1, d2gyas1, d2gyat1, d2gyau1, d2gyaw1, d2gyax1

2190295

Domain d2gya52: 2gya 5:49-120 [135837]
Other proteins in same PDB: d2gya11, d2gya31, d2gya51, d2gyab1, d2gyac1, d2gyad1, d2gyaf1, d2gyaf2, d2gyag1, d2gyag2, d2gyah1, d2gyai1, d2gyaj1, d2gyak1, d2gyam1, d2gyan1, d2gyao1, d2gyaq1, d2gyas1, d2gyat1, d2gyau1, d2gyaw1, d2gyax1

Domains for 2gyc:

Domain d2gyc32: 2gyc 3:49-120 [135847]
Other proteins in same PDB: d2gyc11, d2gyc31, d2gyc51, d2gycb1, d2gycc1, d2gycd1, d2gycf1, d2gycf2, d2gycg1, d2gycg2, d2gych1, d2gyci1, d2gycj1, d2gyck1, d2gycm1, d2gycn1, d2gyco1, d2gycq1, d2gycs1, d2gyct1, d2gycu1, d2gycw1, d2gycx1
protein/RNA complex
protein/RNA complex

Domain d2gyc52: 2gyc 5:49-120 [135849]
Other proteins in same PDB: d2gyc11, d2gyc31, d2gyc51, d2gycb1, d2gycc1, d2gycd1, d2gycf1, d2gycf2, d2gycg1, d2gycg2, d2gych1, d2gyci1, d2gycj1, d2gyck1, d2gycm1, d2gycn1, d2gyco1, d2gycq1, d2gycs1, d2gyct1, d2gycu1, d2gycw1, d2gycx1
protein/RNA complex
protein/RNA complex

Thermotoga maritima [TaxId:2336] [54740] (3 PDB entries)

Domains for 1dd3:
1. Domain d1dd3a2: 1dd3 A:58-128 [38760]
  Other proteins in same PDB: d1dd3a1, d1dd3b1, d1dd3c_, d1dd3d_
2. Domain d1dd3b2: 1dd3 B:58-128 [38761]
  Other proteins in same PDB: d1dd3a1, d1dd3b1, d1dd3c_, d1dd3d_
Domains for 1dd4:
1. Domain d1dd4a2: 1dd4 A:58-128 [38762]
  Other proteins in same PDB: d1dd4a1, d1dd4b1, d1dd4c_, d1dd4d_
  complexed with tbr
2. Domain d1dd4b2: 1dd4 B:58-128 [38763]
  Other proteins in same PDB: d1dd4a1, d1dd4b1, d1dd4c_, d1dd4d_
  complexed with tbr

Domains for 1yl3:

Domain d1yl3i2: 1yl3 I:58-128 [123581]
Other proteins in same PDB: d1yl301, d1yl311, d1yl321, d1yl331, d1yl351, d1yl371, d1yl381, d1yl391, d1yl3c1, d1yl3d1, d1yl3d2, d1yl3f1, d1yl3h1, d1yl3h2, d1yl3i1, d1yl3j1, d1yl3k1, d1yl3k2, d1yl3l1, d1yl3l2, d1yl3m1, d1yl3n1, d1yl3r1, d1yl3s1, d1yl3t1, d1yl3u1, d1yl3v1, d1yl3w1, d1yl3x1

Domain d1yl3j2: 1yl3 J:58-128 [123583]
Other proteins in same PDB: d1yl301, d1yl311, d1yl321, d1yl331, d1yl351, d1yl371, d1yl381, d1yl391, d1yl3c1, d1yl3d1, d1yl3d2, d1yl3f1, d1yl3h1, d1yl3h2, d1yl3i1, d1yl3j1, d1yl3k1, d1yl3k2, d1yl3l1, d1yl3l2, d1yl3m1, d1yl3n1, d1yl3r1, d1yl3s1, d1yl3t1, d1yl3u1, d1yl3v1, d1yl3w1, d1yl3x1

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Protein Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain from d.45.1.1: Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain from d.45.1.1: Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain appears in SCOPe 2.05
Protein Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain from d.45.1.1: Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain appears in SCOPe 2.07
Protein Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain from d.45.1.1: Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08