Lineage for Protein: Transglutaminase catalytic domain

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 713694Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (334 folds)
  3. 715176Fold d.3: Cysteine proteinases [54000] (1 superfamily)
    consists of one alpha-helix and 4 strands of antiparallel beta-sheet and contains the catalytic triad Cys-His-Asn
  4. 715177Superfamily d.3.1: Cysteine proteinases [54001] (16 families) (S)
    the constitute families differ by insertion into and circular permutation of the common catalytic core made of one alpha-helix and 3-strands of beta-sheet
  5. 715480Family d.3.1.4: Transglutaminase core [54044] (2 proteins)
  6. 715485Protein Transglutaminase catalytic domain [54045] (4 species)

Species:

  1. 715486Human (Homo sapiens), blood isozyme [TaxId:9606] [54046] (8 PDB entries)
    Coagulation factor XIII
    1. Domains for 1evu:
      1. 715491Domain d1evua4: 1evu A:191-508 [37113]
        Other proteins in same PDB: d1evua1, d1evua2, d1evua3, d1evub1, d1evub2, d1evub3
      2. 715492Domain d1evub4: 1evu B:191-508 [37114]
        Other proteins in same PDB: d1evua1, d1evua2, d1evua3, d1evub1, d1evub2, d1evub3
        complexed with ca, pgo
    2. Domains for 1ex0:
      1. 715487Domain d1ex0a4: 1ex0 A:191-510 [90468]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a1, d1ex0a2, d1ex0a3, d1ex0b1, d1ex0b2, d1ex0b3
      2. 715488Domain d1ex0b4: 1ex0 B:191-511 [90472]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a1, d1ex0a2, d1ex0a3, d1ex0b1, d1ex0b2, d1ex0b3
        complexed with ca, pgo, po4; mutant
    3. Domains for 1f13:
      1. 715489Domain d1f13a4: 1f13 A:191-515 [37107]
        Other proteins in same PDB: d1f13a1, d1f13a2, d1f13a3, d1f13b1, d1f13b2, d1f13b3
      2. 715490Domain d1f13b4: 1f13 B:191-515 [37108]
        Other proteins in same PDB: d1f13a1, d1f13a2, d1f13a3, d1f13b1, d1f13b2, d1f13b3
    4. Domains for 1fie:
      1. 715493Domain d1fiea4: 1fie A:191-515 [37109]
        Other proteins in same PDB: d1fiea1, d1fiea2, d1fiea3, d1fieb1, d1fieb2, d1fieb3
      2. 715494Domain d1fieb4: 1fie B:191-515 [37110]
        Other proteins in same PDB: d1fiea1, d1fiea2, d1fiea3, d1fieb1, d1fieb2, d1fieb3
    5. Domains for 1ggt:
      1. 715499Domain d1ggta4: 1ggt A:191-515 [37111]
        Other proteins in same PDB: d1ggta1, d1ggta2, d1ggta3, d1ggtb1, d1ggtb2, d1ggtb3
      2. 715500Domain d1ggtb4: 1ggt B:191-515 [37112]
        Other proteins in same PDB: d1ggta1, d1ggta2, d1ggta3, d1ggtb1, d1ggtb2, d1ggtb3
    6. Domains for 1ggu:
      1. 715501Domain d1ggua4: 1ggu A:191-508 [37115]
        Other proteins in same PDB: d1ggua1, d1ggua2, d1ggua3, d1ggub1, d1ggub2, d1ggub3
      2. 715502Domain d1ggub4: 1ggu B:191-508 [37116]
        Other proteins in same PDB: d1ggua1, d1ggua2, d1ggua3, d1ggub1, d1ggub2, d1ggub3
        complexed with ca
    7. Domains for 1ggy:
      1. 715497Domain d1ggya4: 1ggy A:191-508 [37117]
        Other proteins in same PDB: d1ggya1, d1ggya2, d1ggya3, d1ggyb1, d1ggyb2, d1ggyb3
      2. 715498Domain d1ggyb4: 1ggy B:191-508 [37118]
        Other proteins in same PDB: d1ggya1, d1ggya2, d1ggya3, d1ggyb1, d1ggyb2, d1ggyb3
        complexed with yb
    8. Domains for 1qrk:
      1. 715495Domain d1qrka4: 1qrk A:191-511 [37119]
        Other proteins in same PDB: d1qrka1, d1qrka2, d1qrka3, d1qrkb1, d1qrkb2, d1qrkb3
      2. 715496Domain d1qrkb4: 1qrk B:191-507 [37120]
        Other proteins in same PDB: d1qrka1, d1qrka2, d1qrka3, d1qrkb1, d1qrkb2, d1qrkb3
        complexed with sr
  2. 715503Human (Homo sapiens), TGase E3 [TaxId:9606] [75334] (8 PDB entries)
    1. Domains for 1l9m:
      1. 715510Domain d1l9ma4: 1l9m A:141-461 [73735]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma1, d1l9ma2, d1l9ma3, d1l9mb1, d1l9mb2, d1l9mb3
      2. 715511Domain d1l9mb4: 1l9m B:141-460 [73739]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma1, d1l9ma2, d1l9ma3, d1l9mb1, d1l9mb2, d1l9mb3
        complexed with br, ca, cl; mutant
    2. Domains for 1l9n:
      1. 715508Domain d1l9na4: 1l9n A:141-460 [73743]
        Other proteins in same PDB: d1l9na1, d1l9na2, d1l9na3, d1l9nb1, d1l9nb2, d1l9nb3
      2. 715509Domain d1l9nb4: 1l9n B:141-460 [73747]
        Other proteins in same PDB: d1l9na1, d1l9na2, d1l9na3, d1l9nb1, d1l9nb2, d1l9nb3
        complexed with bgl, ca, cl; mutant
    3. Domains for 1nud:
      1. 715517Domain d1nuda4: 1nud A:141-460 [86177]
        Other proteins in same PDB: d1nuda1, d1nuda2, d1nuda3, d1nudb1, d1nudb2, d1nudb3
      2. 715518Domain d1nudb4: 1nud B:141-460 [86181]
        Other proteins in same PDB: d1nuda1, d1nuda2, d1nuda3, d1nudb1, d1nudb2, d1nudb3
        complexed with br, ca, cl; mutant
    4. Domain for 1nuf:
    5. Domains for 1nug:
      1. 715514Domain d1nuga4: 1nug A:141-461 [86189]
        Other proteins in same PDB: d1nuga1, d1nuga2, d1nuga3, d1nugb1, d1nugb2, d1nugb3
      2. 715515Domain d1nugb4: 1nug B:141-459 [86193]
        Other proteins in same PDB: d1nuga1, d1nuga2, d1nuga3, d1nugb1, d1nugb2, d1nugb3
        complexed with ca, cl, mg; mutant
    6. Domains for 1rle:
      1. 715512Domain d1rlea4: 1rle A:141-461 [97641]
        Other proteins in same PDB: d1rlea1, d1rlea2, d1rlea3, d1rleb1, d1rleb2, d1rleb3
      2. 715513Domain d1rleb4: 1rle B:141-459 [97645]
        Other proteins in same PDB: d1rlea1, d1rlea2, d1rlea3, d1rleb1, d1rleb2, d1rleb3
        complexed with ca, gsp, mg; mutant
    7. Domains for 1sgx:
      1. 715506Domain d1sgxa4: 1sgx A:141-461 [98865]
        Other proteins in same PDB: d1sgxa1, d1sgxa2, d1sgxa3, d1sgxb1, d1sgxb2, d1sgxb3
      2. 715507Domain d1sgxb4: 1sgx B:141-459 [98869]
        Other proteins in same PDB: d1sgxa1, d1sgxa2, d1sgxa3, d1sgxb1, d1sgxb2, d1sgxb3
        complexed with 5gp, ca, mg; mutant
    8. Domains for 1vjj:
      1. 715504Domain d1vjja4: 1vjj A:141-461 [100817]
        Other proteins in same PDB: d1vjja1, d1vjja2, d1vjja3, d1vjjb1, d1vjjb2, d1vjjb3
      2. 715505Domain d1vjjb4: 1vjj B:141-459 [100821]
        Other proteins in same PDB: d1vjja1, d1vjja2, d1vjja3, d1vjjb1, d1vjjb2, d1vjjb3
        complexed with ca, cl, gdp, mg; mutant
  3. 715519Human (Homo sapiens), tissue isozyme [TaxId:9606] [75333] (1 PDB entry)
    GDP-binding protein
  4. 715526Red sea bream (Chrysophrys major) [TaxId:143350] [64204] (1 PDB entry)

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