SCOP 1.65: Protein: Transglutaminase catalytic domain

Lineage for Protein: Transglutaminase catalytic domain

Root: SCOP 1.65
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (234 folds)
Fold d.3: Cysteine proteinases [54000] (1 superfamily)
consists of one alpha-helix and 4 strands of antiparallel beta-sheet and contains the catalytic triad Cys-His-Asn

Superfamily d.3.1: Cysteine proteinases [54001] (9 families)

the constitute families differ by insertion into and circular permutation of the common catalytic core made of one alpha-helix and 3-strands of beta-sheet

Family d.3.1.4: Transglutaminase catalytic domain [54044] (1 protein)
Protein Transglutaminase catalytic domain [54045] (4 species)

Species:

Human (Homo sapiens), blood isozyme [TaxId:9606] [54046] (7 PDB entries)
Coagulation factor XIII
1. Domains for 1evu:
  1. Domain d1evua4: 1evu A:191-508 [37113]
    Other proteins in same PDB: d1evua1, d1evua2, d1evua3, d1evub1, d1evub2, d1evub3
  2. Domain d1evub4: 1evu B:191-508 [37114]
    Other proteins in same PDB: d1evua1, d1evua2, d1evua3, d1evub1, d1evub2, d1evub3
    complexed with ca, pgo
2. Domains for 1f13:
  1. Domain d1f13a4: 1f13 A:191-515 [37107]
    Other proteins in same PDB: d1f13a1, d1f13a2, d1f13a3, d1f13b1, d1f13b2, d1f13b3
  2. Domain d1f13b4: 1f13 B:191-515 [37108]
    Other proteins in same PDB: d1f13a1, d1f13a2, d1f13a3, d1f13b1, d1f13b2, d1f13b3
3. Domains for 1fie:
  1. Domain d1fiea4: 1fie A:191-515 [37109]
    Other proteins in same PDB: d1fiea1, d1fiea2, d1fiea3, d1fieb1, d1fieb2, d1fieb3
  2. Domain d1fieb4: 1fie B:191-515 [37110]
    Other proteins in same PDB: d1fiea1, d1fiea2, d1fiea3, d1fieb1, d1fieb2, d1fieb3
4. Domains for 1ggt:
  1. Domain d1ggta4: 1ggt A:191-515 [37111]
    Other proteins in same PDB: d1ggta1, d1ggta2, d1ggta3, d1ggtb1, d1ggtb2, d1ggtb3
  2. Domain d1ggtb4: 1ggt B:191-515 [37112]
    Other proteins in same PDB: d1ggta1, d1ggta2, d1ggta3, d1ggtb1, d1ggtb2, d1ggtb3
5. Domains for 1ggu:
  1. Domain d1ggua4: 1ggu A:191-508 [37115]
    Other proteins in same PDB: d1ggua1, d1ggua2, d1ggua3, d1ggub1, d1ggub2, d1ggub3
  2. Domain d1ggub4: 1ggu B:191-508 [37116]
    Other proteins in same PDB: d1ggua1, d1ggua2, d1ggua3, d1ggub1, d1ggub2, d1ggub3
    complexed with ca
6. Domains for 1ggy:
  1. Domain d1ggya4: 1ggy A:191-508 [37117]
    Other proteins in same PDB: d1ggya1, d1ggya2, d1ggya3, d1ggyb1, d1ggyb2, d1ggyb3
  2. Domain d1ggyb4: 1ggy B:191-508 [37118]
    Other proteins in same PDB: d1ggya1, d1ggya2, d1ggya3, d1ggyb1, d1ggyb2, d1ggyb3
    complexed with yb
7. Domains for 1qrk:
  1. Domain d1qrka4: 1qrk A:191-511 [37119]
    Other proteins in same PDB: d1qrka1, d1qrka2, d1qrka3, d1qrkb1, d1qrkb2, d1qrkb3
  2. Domain d1qrkb4: 1qrk B:191-507 [37120]
    Other proteins in same PDB: d1qrka1, d1qrka2, d1qrka3, d1qrkb1, d1qrkb2, d1qrkb3
    complexed with sr
Human (Homo sapiens), TGase E3 [TaxId:9606] [75334] (5 PDB entries)
1. Domains for 1l9m:
  1. Domain d1l9ma4: 1l9m A:141-461 [73735]
    Other proteins in same PDB: d1l9ma1, d1l9ma2, d1l9ma3, d1l9mb1, d1l9mb2, d1l9mb3
  2. Domain d1l9mb4: 1l9m B:141-460 [73739]
    Other proteins in same PDB: d1l9ma1, d1l9ma2, d1l9ma3, d1l9mb1, d1l9mb2, d1l9mb3
    complexed with br, ca, cl; mutant
2. Domains for 1l9n:
  1. Domain d1l9na4: 1l9n A:141-460 [73743]
    Other proteins in same PDB: d1l9na1, d1l9na2, d1l9na3, d1l9nb1, d1l9nb2, d1l9nb3
  2. Domain d1l9nb4: 1l9n B:141-460 [73747]
    Other proteins in same PDB: d1l9na1, d1l9na2, d1l9na3, d1l9nb1, d1l9nb2, d1l9nb3
    complexed with bgl, ca, cl; mutant
3. Domains for 1nud:
  1. Domain d1nuda4: 1nud A:141-460 [86177]
    Other proteins in same PDB: d1nuda1, d1nuda2, d1nuda3, d1nudb1, d1nudb2, d1nudb3
  2. Domain d1nudb4: 1nud B:141-460 [86181]
    Other proteins in same PDB: d1nuda1, d1nuda2, d1nuda3, d1nudb1, d1nudb2, d1nudb3
    complexed with br, ca, cl; mutant
4. Domain for 1nuf:
  - Domain d1nufa4: 1nuf A:141-461 [86185]
    Other proteins in same PDB: d1nufa1, d1nufa2, d1nufa3
    complexed with br, ca, cl; mutant
5. Domains for 1nug:
  1. Domain d1nuga4: 1nug A:141-461 [86189]
    Other proteins in same PDB: d1nuga1, d1nuga2, d1nuga3, d1nugb1, d1nugb2, d1nugb3
  2. Domain d1nugb4: 1nug B:141-459 [86193]
    Other proteins in same PDB: d1nuga1, d1nuga2, d1nuga3, d1nugb1, d1nugb2, d1nugb3
    complexed with ca, cl, mg; mutant

Human (Homo sapiens), tissue isozyme [TaxId:9606] [75333] (1 PDB entry)
GDP-binding protein

Domains for 1kv3:

Domain d1kv3a4: 1kv3 A:146-468 [73030]
Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3

Domain d1kv3b4: 1kv3 B:146-468 [73034]
Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3

Domain d1kv3c4: 1kv3 C:146-468 [73038]
Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3

Domain d1kv3d4: 1kv3 D:146-468 [73042]
Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3

Domain d1kv3e4: 1kv3 E:146-468 [73046]
Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3

Domain d1kv3f4: 1kv3 F:146-468 [73050]
Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3
complexed with gdp

Red sea bream (Chrysophrys major) [TaxId:143350] [64204] (1 PDB entry)
- Domain for 1g0d:
  - Domain d1g0da4: 1g0d A:141-461 [60169]
    Other proteins in same PDB: d1g0da1, d1g0da2, d1g0da3
    complexed with so4

More info for Protein Transglutaminase catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase catalytic domain

Timeline for Protein Transglutaminase catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase catalytic domain:

Protein Transglutaminase catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase catalytic domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55, called Protein Coagulation factor XIII, catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase
Protein Transglutaminase catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase catalytic domain appears in SCOP 1.63
Protein Transglutaminase catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase catalytic domain appears in SCOP 1.67
Protein Transglutaminase catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase catalytic domain appears in the current release, SCOPe 2.08, called Protein Transglutaminase catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase core