Lineage for Protein: Glutamate dehydrogenase

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2826024Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2890282Fold c.58: Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain [53222] (1 superfamily)
    core: 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands; 2134
  4. 2890283Superfamily c.58.1: Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain [53223] (6 families) (S)
  5. 2890284Family c.58.1.1: Aminoacid dehydrogenases [53224] (4 proteins)
    dimerisation domain; contains additional structures including two extra N-terminal strands in the beta-sheet
  6. 2890285Protein Glutamate dehydrogenase [53225] (8 species)

Species:

  1. 2890286Clostridium symbiosum [TaxId:1512] [53226] (4 PDB entries)
    1. Domain for 1aup:
    2. Domain for 1bgv:
    3. Domains for 1hrd:
      1. 2890289Domain d1hrda2: 1hrd A:1-194 [33867]
        Other proteins in same PDB: d1hrda1, d1hrdb1, d1hrdc1
      2. 2890290Domain d1hrdb2: 1hrd B:1-194 [33868]
        Other proteins in same PDB: d1hrda1, d1hrdb1, d1hrdc1
      3. 2890291Domain d1hrdc2: 1hrd C:1-194 [33869]
        Other proteins in same PDB: d1hrda1, d1hrdb1, d1hrdc1
    4. Domain for 1k89:
  2. 2890293Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [53230] (6 PDB entries)
    1. Domains for 1ch6:
      1. 2890300Domain d1ch6a1: 1ch6 A:6-208 [302278]
        Other proteins in same PDB: d1ch6a2, d1ch6e2, d1ch6f2
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nad
      2. 2890301Domain d1ch6e1: 1ch6 E:6-208 [302280]
        Other proteins in same PDB: d1ch6a2, d1ch6e2, d1ch6f2
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nad
      3. 2890302Domain d1ch6f1: 1ch6 F:6-208 [302282]
        Other proteins in same PDB: d1ch6a2, d1ch6e2, d1ch6f2
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nad
    2. Domains for 1hwx:
      1. 2890294Domain d1hwxa3: 1hwx A:1-208 [302490]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa4, d1hwxb4, d1hwxc4, d1hwxd4, d1hwxe4, d1hwxf4
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nai
      2. 2890295Domain d1hwxb3: 1hwx B:1-208 [302492]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa4, d1hwxb4, d1hwxc4, d1hwxd4, d1hwxe4, d1hwxf4
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nai
      3. 2890296Domain d1hwxc3: 1hwx C:1-208 [302494]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa4, d1hwxb4, d1hwxc4, d1hwxd4, d1hwxe4, d1hwxf4
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nai
      4. 2890297Domain d1hwxd3: 1hwx D:1-208 [302496]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa4, d1hwxb4, d1hwxc4, d1hwxd4, d1hwxe4, d1hwxf4
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nai
      5. 2890298Domain d1hwxe3: 1hwx E:1-208 [302498]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa4, d1hwxb4, d1hwxc4, d1hwxd4, d1hwxe4, d1hwxf4
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nai
      6. 2890299Domain d1hwxf3: 1hwx F:1-208 [302500]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa4, d1hwxb4, d1hwxc4, d1hwxd4, d1hwxe4, d1hwxf4
        automated match to d1hwza2
        complexed with glu, gtp, nai
    3. Domains for 1hwy:
      1. 2890303Domain d1hwya2: 1hwy A:1-208 [33910]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
        complexed with akg, nad, po4
      2. 2890304Domain d1hwyb2: 1hwy B:1-208 [33911]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
        complexed with akg, nad, po4
      3. 2890305Domain d1hwyc2: 1hwy C:1-208 [33912]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
        complexed with akg, nad, po4
      4. 2890306Domain d1hwyd2: 1hwy D:1-208 [33913]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
        complexed with akg, nad, po4
      5. 2890307Domain d1hwye2: 1hwy E:1-208 [33914]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
        complexed with akg, nad, po4
      6. 2890308Domain d1hwyf2: 1hwy F:1-208 [33915]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
        complexed with akg, nad, po4
    4. Domains for 1nqt:
      1. 2890327Domain d1nqta2: 1nqt A:6-208 [86053]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      2. 2890328Domain d1nqtb2: 1nqt B:6-208 [86055]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      3. 2890329Domain d1nqtc2: 1nqt C:6-208 [86057]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      4. 2890330Domain d1nqtd2: 1nqt D:6-208 [86059]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      5. 2890331Domain d1nqte2: 1nqt E:6-208 [86061]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      6. 2890332Domain d1nqtf2: 1nqt F:6-208 [86063]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      7. 2890333Domain d1nqtg2: 1nqt G:6-208 [86065]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      8. 2890334Domain d1nqth2: 1nqt H:6-208 [86067]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      9. 2890335Domain d1nqti2: 1nqt I:6-208 [86069]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      10. 2890336Domain d1nqtj2: 1nqt J:6-208 [86071]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      11. 2890337Domain d1nqtk2: 1nqt K:6-208 [86073]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
      12. 2890338Domain d1nqtl2: 1nqt L:6-208 [86075]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
    5. Domains for 1nr7:
      1. 2890315Domain d1nr7a2: 1nr7 A:6-208 [86096]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      2. 2890316Domain d1nr7b2: 1nr7 B:6-208 [86098]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      3. 2890317Domain d1nr7c2: 1nr7 C:6-208 [86100]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      4. 2890318Domain d1nr7d2: 1nr7 D:6-208 [86102]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      5. 2890319Domain d1nr7e2: 1nr7 E:6-208 [86104]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      6. 2890320Domain d1nr7f2: 1nr7 F:6-208 [86106]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      7. 2890321Domain d1nr7g2: 1nr7 G:6-208 [86108]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      8. 2890322Domain d1nr7h2: 1nr7 H:6-208 [86110]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      9. 2890323Domain d1nr7i2: 1nr7 I:6-208 [86112]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      10. 2890324Domain d1nr7j2: 1nr7 J:6-208 [86114]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      11. 2890325Domain d1nr7k2: 1nr7 K:6-208 [86116]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      12. 2890326Domain d1nr7l2: 1nr7 L:6-208 [86118]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
    6. Domains for 3mvq:
      1. 2890309Domain d3mvqa1: 3mvq A:1-208 [213595]
        Other proteins in same PDB: d3mvqa2, d3mvqb2, d3mvqc2, d3mvqd2, d3mvqe2, d3mvqf2
        automated match to d3mw9a2
        complexed with glu, gtp, ndp, zn
      2. 2890310Domain d3mvqb1: 3mvq B:1-208 [213597]
        Other proteins in same PDB: d3mvqa2, d3mvqb2, d3mvqc2, d3mvqd2, d3mvqe2, d3mvqf2
        automated match to d3mw9a2
        complexed with glu, gtp, ndp, zn
      3. 2890311Domain d3mvqc1: 3mvq C:1-208 [213599]
        Other proteins in same PDB: d3mvqa2, d3mvqb2, d3mvqc2, d3mvqd2, d3mvqe2, d3mvqf2
        automated match to d3mw9a2
        complexed with glu, gtp, ndp, zn
      4. 2890312Domain d3mvqd1: 3mvq D:1-208 [213601]
        Other proteins in same PDB: d3mvqa2, d3mvqb2, d3mvqc2, d3mvqd2, d3mvqe2, d3mvqf2
        automated match to d3mw9a2
        complexed with glu, gtp, ndp, zn
      5. 2890313Domain d3mvqe1: 3mvq E:1-208 [213603]
        Other proteins in same PDB: d3mvqa2, d3mvqb2, d3mvqc2, d3mvqd2, d3mvqe2, d3mvqf2
        automated match to d3mw9a2
        complexed with glu, gtp, ndp, zn
      6. 2890314Domain d3mvqf1: 3mvq F:1-208 [213605]
        Other proteins in same PDB: d3mvqa2, d3mvqb2, d3mvqc2, d3mvqd2, d3mvqe2, d3mvqf2
        automated match to d3mw9a2
        complexed with glu, gtp, ndp, zn
  3. 2890339Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [75252] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1l1f:
      1. 2890340Domain d1l1fa2: 1l1f A:10-212 [73457]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      2. 2890341Domain d1l1fb2: 1l1f B:10-212 [73459]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      3. 2890342Domain d1l1fc2: 1l1f C:10-212 [73461]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      4. 2890343Domain d1l1fd2: 1l1f D:10-212 [73463]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      5. 2890344Domain d1l1fe2: 1l1f E:10-212 [73465]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      6. 2890345Domain d1l1ff2: 1l1f F:10-212 [73467]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
    2. Domains for 1nr1:
      1. 2890346Domain d1nr1a2: 1nr1 A:10-212 [86081]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
        mutant
      2. 2890347Domain d1nr1b2: 1nr1 B:10-212 [86083]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
        mutant
      3. 2890348Domain d1nr1c2: 1nr1 C:10-212 [86085]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
        mutant
      4. 2890349Domain d1nr1d2: 1nr1 D:10-212 [86087]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
        mutant
      5. 2890350Domain d1nr1e2: 1nr1 E:10-212 [86089]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
        mutant
      6. 2890351Domain d1nr1f2: 1nr1 F:10-212 [86091]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
        mutant
  4. 2890352Pyrobaculum islandicum [TaxId:2277] [117471] (1 PDB entry)
    Uniprot Q9Y8I4
  5. 2890359Pyrococcus furiosus [TaxId:2261] [53227] (1 PDB entry)
  6. 2890363Thermococcus litoralis [TaxId:2265] [53228] (1 PDB entry)
  7. 2890370Thermococcus profundus [TaxId:49899] [64106] (1 PDB entry)
  8. 2890377Thermotoga maritima [TaxId:2336] [53229] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1b26:
      1. 2890378Domain d1b26a2: 1b26 A:4-178 [33880]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      2. 2890379Domain d1b26b2: 1b26 B:4-178 [33881]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      3. 2890380Domain d1b26c2: 1b26 C:4-178 [33882]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      4. 2890381Domain d1b26d2: 1b26 D:4-178 [33883]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      5. 2890382Domain d1b26e2: 1b26 E:4-178 [33884]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      6. 2890383Domain d1b26f2: 1b26 F:4-178 [33885]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
    2. Domains for 1b3b:
      1. 2890390Domain d1b3ba2: 1b3b A:4-178 [33892]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
        mutant
      2. 2890391Domain d1b3bb2: 1b3b B:4-178 [33893]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
        mutant
      3. 2890392Domain d1b3bc2: 1b3b C:4-178 [33894]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
        mutant
      4. 2890393Domain d1b3bd2: 1b3b D:4-178 [33895]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
        mutant
      5. 2890394Domain d1b3be2: 1b3b E:4-178 [33896]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
        mutant
      6. 2890395Domain d1b3bf2: 1b3b F:4-178 [33897]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
        mutant
    3. Domains for 2tmg:
      1. 2890384Domain d2tmga2: 2tmg A:4-178 [33886]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
        mutant
      2. 2890385Domain d2tmgb2: 2tmg B:4-178 [33887]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
        mutant
      3. 2890386Domain d2tmgc2: 2tmg C:4-178 [33888]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
        mutant
      4. 2890387Domain d2tmgd2: 2tmg D:4-178 [33889]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
        mutant
      5. 2890388Domain d2tmge2: 2tmg E:4-178 [33890]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
        mutant
      6. 2890389Domain d2tmgf2: 2tmg F:4-178 [33891]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
        mutant

More info for Protein Glutamate dehydrogenase from c.58.1.1: Aminoacid dehydrogenases

Timeline for Protein Glutamate dehydrogenase from c.58.1.1: Aminoacid dehydrogenases: