Lineage for Protein: F1 ATP synthase gamma subunit

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2120383Fold c.49: Pyruvate kinase C-terminal domain-like [52934] (2 superfamilies)
    3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 32145, strand 5 is antiparallel to the rest
  4. 2120543Superfamily c.49.2: ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit [52943] (2 families) (S)
    contains an antiparallel coiled coil formed by N- and C-terminal extensions to the common fold
  5. 2120544Family c.49.2.1: ATP synthase (F1-ATPase), gamma subunit [52944] (1 protein)
    automatically mapped to Pfam PF00231
  6. 2120545Protein F1 ATP synthase gamma subunit [52945] (4 species)

Species:

  1. 2120546Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [310899] (6 PDB entries)
    1. Domains for 2hld:
      1. 2120549Domain d2hldg_: 2hld G: [165136]
        Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldz1
        automated match to d1bmfg_
        complexed with anp, mg, po4
      2. 2120550Domain d2hldp_: 2hld P: [165137]
        Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldz1
        automated match to d1bmfg_
        complexed with anp, mg, po4
      3. 2120551Domain d2hldy_: 2hld Y: [165138]
        Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldz1
        automated match to d1bmfg_
        complexed with anp, mg, po4
    2. Domain for 2xok:
    3. Domains for 3oe7:
      1. 2120555Domain d3oe7g_: 3oe7 G: [248187]
        Other proteins in same PDB: d3oe7d1, d3oe7d2, d3oe7d3, d3oe7e1, d3oe7e2, d3oe7e3, d3oe7f1, d3oe7f2, d3oe7f3, d3oe7h1, d3oe7h2, d3oe7i_, d3oe7m1, d3oe7m2, d3oe7m3, d3oe7n1, d3oe7n2, d3oe7n3, d3oe7o1, d3oe7o2, d3oe7o3, d3oe7r_, d3oe7v1, d3oe7v2, d3oe7v3, d3oe7w1, d3oe7w2, d3oe7w3, d3oe7x1, d3oe7x2, d3oe7x3
        automated match to d2v7qg_
        complexed with anp, mg, po4; mutant
      2. 2120556Domain d3oe7p_: 3oe7 P: [248197]
        Other proteins in same PDB: d3oe7d1, d3oe7d2, d3oe7d3, d3oe7e1, d3oe7e2, d3oe7e3, d3oe7f1, d3oe7f2, d3oe7f3, d3oe7h1, d3oe7h2, d3oe7i_, d3oe7m1, d3oe7m2, d3oe7m3, d3oe7n1, d3oe7n2, d3oe7n3, d3oe7o1, d3oe7o2, d3oe7o3, d3oe7r_, d3oe7v1, d3oe7v2, d3oe7v3, d3oe7w1, d3oe7w2, d3oe7w3, d3oe7x1, d3oe7x2, d3oe7x3
        automated match to d2v7qg_
        complexed with anp, mg, po4; mutant
    4. Domains for 3oee:
      1. 2120552Domain d3oeeg_: 3oee G: [182956]
        Other proteins in same PDB: d3oeed1, d3oeed2, d3oeed3, d3oeee1, d3oeee2, d3oeee3, d3oeef1, d3oeef2, d3oeef3, d3oeeh1, d3oeeh2, d3oeei_, d3oeem1, d3oeem2, d3oeem3, d3oeen1, d3oeen2, d3oeen3, d3oeeo1, d3oeeo2, d3oeeo3, d3oeer_, d3oeev1, d3oeev2, d3oeev3, d3oeew1, d3oeew2, d3oeew3, d3oeex1, d3oeex2, d3oeex3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with anp, mg, po4; mutant
      2. 2120553Domain d3oeep_: 3oee P: [182957]
        Other proteins in same PDB: d3oeed1, d3oeed2, d3oeed3, d3oeee1, d3oeee2, d3oeee3, d3oeef1, d3oeef2, d3oeef3, d3oeeh1, d3oeeh2, d3oeei_, d3oeem1, d3oeem2, d3oeem3, d3oeen1, d3oeen2, d3oeen3, d3oeeo1, d3oeeo2, d3oeeo3, d3oeer_, d3oeev1, d3oeev2, d3oeev3, d3oeew1, d3oeew2, d3oeew3, d3oeex1, d3oeex2, d3oeex3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with anp, mg, po4; mutant
      3. 2120554Domain d3oeey_: 3oee Y: [182958]
        Other proteins in same PDB: d3oeed1, d3oeed2, d3oeed3, d3oeee1, d3oeee2, d3oeee3, d3oeef1, d3oeef2, d3oeef3, d3oeeh1, d3oeeh2, d3oeei_, d3oeem1, d3oeem2, d3oeem3, d3oeen1, d3oeen2, d3oeen3, d3oeeo1, d3oeeo2, d3oeeo3, d3oeer_, d3oeev1, d3oeev2, d3oeev3, d3oeew1, d3oeew2, d3oeew3, d3oeex1, d3oeex2, d3oeex3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with anp, mg, po4; mutant
    5. Domains for 3oeh:
      1. 2120557Domain d3oehg_: 3oeh G: [248226]
        Other proteins in same PDB: d3oehd1, d3oehd2, d3oehd3, d3oehe1, d3oehe2, d3oehe3, d3oehf1, d3oehf2, d3oehf3, d3oehh1, d3oehh2, d3oehi_, d3oehm1, d3oehm2, d3oehm3, d3oehn1, d3oehn2, d3oehn3, d3oeho1, d3oeho2, d3oeho3, d3oehr_, d3oehv1, d3oehv2, d3oehv3, d3oehw1, d3oehw2, d3oehw3, d3oehx1, d3oehx2, d3oehx3
        automated match to d2v7qg_
        complexed with anp, mg; mutant
      2. 2120558Domain d3oehp_: 3oeh P: [248236]
        Other proteins in same PDB: d3oehd1, d3oehd2, d3oehd3, d3oehe1, d3oehe2, d3oehe3, d3oehf1, d3oehf2, d3oehf3, d3oehh1, d3oehh2, d3oehi_, d3oehm1, d3oehm2, d3oehm3, d3oehn1, d3oehn2, d3oehn3, d3oeho1, d3oeho2, d3oeho3, d3oehr_, d3oehv1, d3oehv2, d3oehv3, d3oehw1, d3oehw2, d3oehw3, d3oehx1, d3oehx2, d3oehx3
        automated match to d2v7qg_
        complexed with anp, mg; mutant
    6. Domains for 3zia:
      1. 2120547Domain d3ziag_: 3zia G: [201321]
        Other proteins in same PDB: d3ziaa1, d3ziaa2, d3ziaa3, d3ziab1, d3ziab2, d3ziab3, d3ziac1, d3ziac2, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak1, d3ziak2, d3ziak3, d3zial1, d3zial2, d3zial3, d3ziam1, d3ziam2, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
        automated match to d2hldg_
        complexed with adp, atp, edo, mg
      2. 2120548Domain d3ziaq_: 3zia Q: [193992]
        Other proteins in same PDB: d3ziaa1, d3ziaa2, d3ziaa3, d3ziab1, d3ziab2, d3ziab3, d3ziac1, d3ziac2, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak1, d3ziak2, d3ziak3, d3zial1, d3zial2, d3zial3, d3ziam1, d3ziam2, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
        automated match to d2hldg_
        complexed with adp, atp, edo, mg
  2. 2120560Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [52946] (19 PDB entries)
    Uniprot P05631
    1. Domain for 1bmf:
    2. Domain for 1cow:
    3. Domain for 1e1q:
    4. Domain for 1e1r:
    5. Domain for 1e79:
    6. Domain for 1efr:
    7. Domain for 1h8e:
    8. Domain for 1h8h:
    9. Domain for 1nbm:
    10. Domain for 1ohh:
    11. Domain for 1w0j:
    12. Domain for 1w0k:
    13. Domain for 2ck3:
    14. Domain for 2jdi:
    15. Domains for 2jiz:
      1. 2120563Domain d2jizg_: 2jiz G: [148120]
        Other proteins in same PDB: d2jiza1, d2jiza2, d2jiza3, d2jizb1, d2jizb2, d2jizb3, d2jizc1, d2jizc2, d2jizc3, d2jizd1, d2jizd2, d2jizd3, d2jize1, d2jize2, d2jize3, d2jizf1, d2jizf2, d2jizf3, d2jizh1, d2jizh2, d2jizh3, d2jizi1, d2jizi2, d2jizi3, d2jizj1, d2jizj2, d2jizj3, d2jizk1, d2jizk2, d2jizk3, d2jizl1, d2jizl2, d2jizl3, d2jizm1, d2jizm2, d2jizm3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with adp, anp, azi, gol, mg, po4, stl
      2. 2120564Domain d2jizn_: 2jiz N: [148121]
        Other proteins in same PDB: d2jiza1, d2jiza2, d2jiza3, d2jizb1, d2jizb2, d2jizb3, d2jizc1, d2jizc2, d2jizc3, d2jizd1, d2jizd2, d2jizd3, d2jize1, d2jize2, d2jize3, d2jizf1, d2jizf2, d2jizf3, d2jizh1, d2jizh2, d2jizh3, d2jizi1, d2jizi2, d2jizi3, d2jizj1, d2jizj2, d2jizj3, d2jizk1, d2jizk2, d2jizk3, d2jizl1, d2jizl2, d2jizl3, d2jizm1, d2jizm2, d2jizm3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with adp, anp, azi, gol, mg, po4, stl
    16. Domains for 2jj1:
      1. 2120569Domain d2jj1g_: 2jj1 G: [148123]
        Other proteins in same PDB: d2jj1a1, d2jj1a2, d2jj1a3, d2jj1b1, d2jj1b2, d2jj1b3, d2jj1c1, d2jj1c2, d2jj1c3, d2jj1d1, d2jj1d2, d2jj1d3, d2jj1e1, d2jj1e2, d2jj1e3, d2jj1f1, d2jj1f2, d2jj1f3, d2jj1h1, d2jj1h2, d2jj1h3, d2jj1i1, d2jj1i2, d2jj1i3, d2jj1j1, d2jj1j2, d2jj1j3, d2jj1k1, d2jj1k2, d2jj1k3, d2jj1l1, d2jj1l2, d2jj1l3, d2jj1m1, d2jj1m2, d2jj1m3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with adp, anp, azi, gol, mg, pit, po4
      2. 2120570Domain d2jj1n_: 2jj1 N: [148124]
        Other proteins in same PDB: d2jj1a1, d2jj1a2, d2jj1a3, d2jj1b1, d2jj1b2, d2jj1b3, d2jj1c1, d2jj1c2, d2jj1c3, d2jj1d1, d2jj1d2, d2jj1d3, d2jj1e1, d2jj1e2, d2jj1e3, d2jj1f1, d2jj1f2, d2jj1f3, d2jj1h1, d2jj1h2, d2jj1h3, d2jj1i1, d2jj1i2, d2jj1i3, d2jj1j1, d2jj1j2, d2jj1j3, d2jj1k1, d2jj1k2, d2jj1k3, d2jj1l1, d2jj1l2, d2jj1l3, d2jj1m1, d2jj1m2, d2jj1m3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with adp, anp, azi, gol, mg, pit, po4
    17. Domains for 2jj2:
      1. 2120566Domain d2jj2g_: 2jj2 G: [148125]
        Other proteins in same PDB: d2jj2a1, d2jj2a2, d2jj2a3, d2jj2b1, d2jj2b2, d2jj2b3, d2jj2c1, d2jj2c2, d2jj2c3, d2jj2d1, d2jj2d2, d2jj2d3, d2jj2e1, d2jj2e2, d2jj2e3, d2jj2f1, d2jj2f2, d2jj2f3, d2jj2h1, d2jj2h2, d2jj2h3, d2jj2i1, d2jj2i2, d2jj2i3, d2jj2j1, d2jj2j2, d2jj2j3, d2jj2k1, d2jj2k2, d2jj2k3, d2jj2l1, d2jj2l2, d2jj2l3, d2jj2m1, d2jj2m2, d2jj2m3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with adp, anp, azi, gol, mg, po4, que
      2. 2120567Domain d2jj2n_: 2jj2 N: [148126]
        Other proteins in same PDB: d2jj2a1, d2jj2a2, d2jj2a3, d2jj2b1, d2jj2b2, d2jj2b3, d2jj2c1, d2jj2c2, d2jj2c3, d2jj2d1, d2jj2d2, d2jj2d3, d2jj2e1, d2jj2e2, d2jj2e3, d2jj2f1, d2jj2f2, d2jj2f3, d2jj2h1, d2jj2h2, d2jj2h3, d2jj2i1, d2jj2i2, d2jj2i3, d2jj2j1, d2jj2j2, d2jj2j3, d2jj2k1, d2jj2k2, d2jj2k3, d2jj2l1, d2jj2l2, d2jj2l3, d2jj2m1, d2jj2m2, d2jj2m3
        automated match to d1bmfg_
        complexed with adp, anp, azi, gol, mg, po4, que
    18. Domain for 2v7q:
    19. Domain for 4asu:
  3. 2120583Escherichia coli [TaxId:562] [64070] (1 PDB entry)
  4. 2120585Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [52947] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1mab:
    2. Domain for 2f43:

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