Lineage for Species: Desulfovibrio africanus [TaxId: 873]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2120181Fold c.48: TK C-terminal domain-like [52921] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 13245, strand 1 is antiparallel to the rest
  4. 2120182Superfamily c.48.1: TK C-terminal domain-like [52922] (4 families) (S)
  5. 2120325Family c.48.1.3: Pyruvate-ferredoxin oxidoreductase, PFOR, domain II [52931] (1 protein)
  6. 2120326Protein Pyruvate-ferredoxin oxidoreductase, PFOR, domain II [52932] (1 species)
  7. 2120327Species Desulfovibrio africanus [TaxId:873] [52933] (10 PDB entries)

PDB entries in Species: Desulfovibrio africanus [TaxId: 873]:

  1. Domain(s) for 1b0p:
    1. 2120340Domain d1b0pa3: 1b0p A:259-415 [33104]
      Other proteins in same PDB: d1b0pa1, d1b0pa2, d1b0pa4, d1b0pa5, d1b0pb1, d1b0pb2, d1b0pb4, d1b0pb5
      complexed with ca, mg, sf4, tpp
    2. 2120341Domain d1b0pb3: 1b0p B:259-415 [33105]
      Other proteins in same PDB: d1b0pa1, d1b0pa2, d1b0pa4, d1b0pa5, d1b0pb1, d1b0pb2, d1b0pb4, d1b0pb5
      complexed with ca, mg, sf4, tpp
  2. Domain(s) for 1kek:
    1. 2120332Domain d1keka3: 1kek A:259-415 [68526]
      Other proteins in same PDB: d1keka1, d1keka2, d1keka4, d1keka5, d1kekb1, d1kekb2, d1kekb4, d1kekb5
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
    2. 2120333Domain d1kekb3: 1kek B:259-415 [68531]
      Other proteins in same PDB: d1keka1, d1keka2, d1keka4, d1keka5, d1kekb1, d1kekb2, d1kekb4, d1kekb5
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
  3. Domain(s) for 2c3m:
    1. 2120330Domain d2c3ma3: 2c3m A:259-415 [129742]
      Other proteins in same PDB: d2c3ma1, d2c3ma2, d2c3ma4, d2c3ma5, d2c3mb1, d2c3mb2, d2c3mb4, d2c3mb5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, cl, mg, sf4, tpp
    2. 2120331Domain d2c3mb3: 2c3m B:259-415 [129747]
      Other proteins in same PDB: d2c3ma1, d2c3ma2, d2c3ma4, d2c3ma5, d2c3mb1, d2c3mb2, d2c3mb4, d2c3mb5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, cl, mg, sf4, tpp
  4. Domain(s) for 2c3o:
    1. 2120344Domain d2c3oa3: 2c3o A:259-415 [129752]
      Other proteins in same PDB: d2c3oa1, d2c3oa2, d2c3oa4, d2c3oa5, d2c3ob1, d2c3ob2, d2c3ob4, d2c3ob5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
    2. 2120345Domain d2c3ob3: 2c3o B:259-415 [129757]
      Other proteins in same PDB: d2c3oa1, d2c3oa2, d2c3oa4, d2c3oa5, d2c3ob1, d2c3ob2, d2c3ob4, d2c3ob5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
  5. Domain(s) for 2c3p:
    1. 2120336Domain d2c3pa3: 2c3p A:259-415 [129762]
      Other proteins in same PDB: d2c3pa1, d2c3pa2, d2c3pa4, d2c3pa5, d2c3pb1, d2c3pb2, d2c3pb4, d2c3pb5
      automated match to d1keka3
      complexed with 1tp, ca, mg, sf4
    2. 2120337Domain d2c3pb3: 2c3p B:259-415 [129767]
      Other proteins in same PDB: d2c3pa1, d2c3pa2, d2c3pa4, d2c3pa5, d2c3pb1, d2c3pb2, d2c3pb4, d2c3pb5
      automated match to d1keka3
      complexed with 1tp, ca, mg, sf4
  6. Domain(s) for 2c3u:
    1. 2120338Domain d2c3ua3: 2c3u A:259-415 [129772]
      Other proteins in same PDB: d2c3ua1, d2c3ua2, d2c3ua4, d2c3ua5, d2c3ub1, d2c3ub2, d2c3ub4, d2c3ub5
      automated match to d1keka3
      complexed with 2tp, ca, mg, pyr, sf4
    2. 2120339Domain d2c3ub3: 2c3u B:259-415 [129777]
      Other proteins in same PDB: d2c3ua1, d2c3ua2, d2c3ua4, d2c3ua5, d2c3ub1, d2c3ub2, d2c3ub4, d2c3ub5
      automated match to d1keka3
      complexed with 2tp, ca, mg, pyr, sf4
  7. Domain(s) for 2c3y:
    1. 2120334Domain d2c3ya3: 2c3y A:259-415 [129782]
      Other proteins in same PDB: d2c3ya1, d2c3ya2, d2c3ya4, d2c3ya5, d2c3yb1, d2c3yb2, d2c3yb4, d2c3yb5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
    2. 2120335Domain d2c3yb3: 2c3y B:259-415 [129787]
      Other proteins in same PDB: d2c3ya1, d2c3ya2, d2c3ya4, d2c3ya5, d2c3yb1, d2c3yb2, d2c3yb4, d2c3yb5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
  8. Domain(s) for 2c42:
    1. 2120328Domain d2c42a3: 2c42 A:259-415 [129792]
      Other proteins in same PDB: d2c42a1, d2c42a2, d2c42a4, d2c42a5, d2c42b1, d2c42b2, d2c42b4, d2c42b5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
    2. 2120329Domain d2c42b3: 2c42 B:259-415 [129797]
      Other proteins in same PDB: d2c42a1, d2c42a2, d2c42a4, d2c42a5, d2c42b1, d2c42b2, d2c42b4, d2c42b5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
  9. Domain(s) for 2pda:
    1. 2120346Domain d2pdaa3: 2pda A:259-415 [33106]
      Other proteins in same PDB: d2pdaa1, d2pdaa2, d2pdaa4, d2pdaa5, d2pdab1, d2pdab2, d2pdab4, d2pdab5
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
    2. 2120347Domain d2pdab3: 2pda B:259-415 [33107]
      Other proteins in same PDB: d2pdaa1, d2pdaa2, d2pdaa4, d2pdaa5, d2pdab1, d2pdab2, d2pdab4, d2pdab5
      complexed with ca, mg, pyr, sf4, tpp
  10. Domain(s) for 2uza:
    1. 2120342Domain d2uzaa3: 2uza A:259-415 [152327]
      Other proteins in same PDB: d2uzaa1, d2uzaa2, d2uzaa4, d2uzaa5, d2uzab1, d2uzab2, d2uzab4, d2uzab5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4
    2. 2120343Domain d2uzab3: 2uza B:259-415 [152332]
      Other proteins in same PDB: d2uzaa1, d2uzaa2, d2uzaa4, d2uzaa5, d2uzab1, d2uzab2, d2uzab4, d2uzab5
      automated match to d1keka3
      complexed with ca, co2, htl, mg, sf4

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