Lineage for Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 968085Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (147 folds)
  3. 985972Fold c.31: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52466] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456; Rossmann-like
  4. 985973Superfamily c.31.1: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52467] (7 families) (S)
    binds cofactor molecules in the opposite direction than classical Rossmann fold
  5. 986002Family c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain [52475] (8 proteins)
    N-terminal domain is Pyr module, and C-terminal domain is PP module of thiamin diphosphate-binding fold
  6. 986026Protein Benzoylformate decarboxylase [52482] (1 species)
  7. 986027Species Pseudomonas putida [TaxId:303] [52483] (9 PDB entries)
    Uniprot P20906

PDB entries in Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]:

  1. Domain(s) for 1bfd:
  2. Domain(s) for 1mcz:
    1. 986039Domain d1mcza1: 1mcz A:182-341 [78952]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    2. 986040Domain d1mczb1: 1mcz B:182-341 [78955]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    3. 986041Domain d1mczc1: 1mcz C:182-341 [78958]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    4. 986042Domain d1mczd1: 1mcz D:182-341 [78961]
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      complexed with mg, rmn, tdp
    5. 986043Domain d1mcze1: 1mcz E:182-341 [78964]
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    6. 986044Domain d1mczf1: 1mcz F:182-341 [78967]
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    7. 986045Domain d1mczg1: 1mcz G:182-341 [78970]
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    8. 986046Domain d1mczh1: 1mcz H:182-341 [78973]
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    9. 986047Domain d1mczi1: 1mcz I:182-341 [78976]
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    10. 986048Domain d1mczj1: 1mcz J:182-341 [78979]
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    11. 986049Domain d1mczk1: 1mcz K:182-341 [78982]
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    12. 986050Domain d1mczl1: 1mcz L:182-341 [78985]
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    13. 986051Domain d1mczm1: 1mcz M:182-341 [78988]
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    14. 986052Domain d1mczn1: 1mcz N:182-341 [78991]
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    15. 986053Domain d1mczo1: 1mcz O:182-341 [78994]
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    16. 986054Domain d1mczp1: 1mcz P:182-341 [78997]
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      complexed with mg, rmn, tdp
  3. Domain(s) for 1pi3:
  4. Domain(s) for 1po7:
  5. Domain(s) for 1q6z:
  6. Domain(s) for 1yno:
  7. Domain(s) for 2fn3:
  8. Domain(s) for 2fwn:
  9. Domain(s) for 2v3w:
    1. 986035Domain d2v3wa1: 2v3w A:182-341 [152465]
      Other proteins in same PDB: d2v3wa2, d2v3wa3, d2v3wb2, d2v3wb3, d2v3wc2, d2v3wc3, d2v3wd2, d2v3wd3
      automatically matched to d1bfda1
      complexed with mg, so4, tpp
    2. 986036Domain d2v3wb1: 2v3w B:182-341 [152468]
      Other proteins in same PDB: d2v3wa2, d2v3wa3, d2v3wb2, d2v3wb3, d2v3wc2, d2v3wc3, d2v3wd2, d2v3wd3
      automatically matched to d1bfda1
      complexed with mg, so4, tpp
    3. 986037Domain d2v3wc1: 2v3w C:182-341 [152471]
      Other proteins in same PDB: d2v3wa2, d2v3wa3, d2v3wb2, d2v3wb3, d2v3wc2, d2v3wc3, d2v3wd2, d2v3wd3
      automatically matched to d1bfda1
      complexed with mg, so4, tpp
    4. 986038Domain d2v3wd1: 2v3w D:182-341 [152474]
      Other proteins in same PDB: d2v3wa2, d2v3wa3, d2v3wb2, d2v3wb3, d2v3wc2, d2v3wc3, d2v3wd2, d2v3wd3
      automatically matched to d1bfda1
      complexed with mg, so4, tpp

More info for Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase

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