Lineage for Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2107255Fold c.31: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52466] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456; Rossmann-like
  4. 2107256Superfamily c.31.1: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52467] (7 families) (S)
    binds cofactor molecules in the opposite direction than classical Rossmann fold
  5. 2107283Family c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain [52475] (8 protein domains)
    N-terminal domain is Pyr module, and C-terminal domain is PP module of thiamin diphosphate-binding fold
  6. 2107307Protein Benzoylformate decarboxylase [52482] (1 species)
  7. 2107308Species Pseudomonas putida [TaxId:303] [52483] (41 PDB entries)
    Uniprot P20906

PDB entries in Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]:

  1. Domain(s) for 1bfd:
  2. Domain(s) for 1mcz:
    1. 2107373Domain d1mcza1: 1mcz A:182-341 [78952]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    2. 2107374Domain d1mczb1: 1mcz B:182-341 [78955]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    3. 2107375Domain d1mczc1: 1mcz C:182-341 [78958]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    4. 2107376Domain d1mczd1: 1mcz D:182-341 [78961]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    5. 2107377Domain d1mcze1: 1mcz E:182-341 [78964]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    6. 2107378Domain d1mczf1: 1mcz F:182-341 [78967]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    7. 2107379Domain d1mczg1: 1mcz G:182-341 [78970]
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      complexed with mg, rmn, tdp
    8. 2107380Domain d1mczh1: 1mcz H:182-341 [78973]
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      complexed with mg, rmn, tdp
    9. 2107381Domain d1mczi1: 1mcz I:182-341 [78976]
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      complexed with mg, rmn, tdp
    10. 2107382Domain d1mczj1: 1mcz J:182-341 [78979]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    11. 2107383Domain d1mczk1: 1mcz K:182-341 [78982]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    12. 2107384Domain d1mczl1: 1mcz L:182-341 [78985]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    13. 2107385Domain d1mczm1: 1mcz M:182-341 [78988]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    14. 2107386Domain d1mczn1: 1mcz N:182-341 [78991]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    15. 2107387Domain d1mczo1: 1mcz O:182-341 [78994]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
    16. 2107388Domain d1mczp1: 1mcz P:182-341 [78997]
      Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
      complexed with mg, rmn, tdp
  3. Domain(s) for 1pi3:
  4. Domain(s) for 1po7:
  5. Domain(s) for 1q6z:
  6. Domain(s) for 1yno:
  7. Domain(s) for 2fn3:
  8. Domain(s) for 2fwn:
  9. Domain(s) for 3f6b:
  10. Domain(s) for 3f6e:
  11. Domain(s) for 3fsj:
  12. Domain(s) for 3fzn:
    1. 2107337Domain d3fzna2: 3fzn A:182-341 [246212]
      Other proteins in same PDB: d3fzna1, d3fzna3, d3fznb1, d3fznb3, d3fznc1, d3fznc3, d3fznd1, d3fznd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with cl, d7k, mg, peg, po4
    2. 2107338Domain d3fznb2: 3fzn B:182-341 [246215]
      Other proteins in same PDB: d3fzna1, d3fzna3, d3fznb1, d3fznb3, d3fznc1, d3fznc3, d3fznd1, d3fznd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with cl, d7k, mg, peg, po4
    3. 2107339Domain d3fznc2: 3fzn C:182-341 [246218]
      Other proteins in same PDB: d3fzna1, d3fzna3, d3fznb1, d3fznb3, d3fznc1, d3fznc3, d3fznd1, d3fznd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with cl, d7k, mg, peg, po4
    4. 2107340Domain d3fznd2: 3fzn D:182-341 [246221]
      Other proteins in same PDB: d3fzna1, d3fzna3, d3fznb1, d3fznb3, d3fznc1, d3fznc3, d3fznd1, d3fznd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with cl, d7k, mg, peg, po4
  13. Domain(s) for 4gg1:
  14. Domain(s) for 4gm0:
  15. Domain(s) for 4gm1:
  16. Domain(s) for 4gm4:
  17. Domain(s) for 4gp9:
  18. Domain(s) for 4gpe:
  19. Domain(s) for 4jd5:
  20. Domain(s) for 4ju8:
  21. Domain(s) for 4ju9:
  22. Domain(s) for 4jua:
  23. Domain(s) for 4jub:
    1. 2107350Domain d4juba2: 4jub A:182-341 [253070]
      Other proteins in same PDB: d4juba1, d4juba3, d4jubb1, d4jubb3, d4jubc1, d4jubc3, d4jubd1, d4jubd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    2. 2107351Domain d4jubb2: 4jub B:182-341 [253073]
      Other proteins in same PDB: d4juba1, d4juba3, d4jubb1, d4jubb3, d4jubc1, d4jubc3, d4jubd1, d4jubd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    3. 2107352Domain d4jubc2: 4jub C:182-341 [253076]
      Other proteins in same PDB: d4juba1, d4juba3, d4jubb1, d4jubb3, d4jubc1, d4jubc3, d4jubd1, d4jubd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    4. 2107353Domain d4jubd2: 4jub D:182-341 [253079]
      Other proteins in same PDB: d4juba1, d4juba3, d4jubb1, d4jubb3, d4jubc1, d4jubc3, d4jubd1, d4jubd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
  24. Domain(s) for 4juc:
    1. 2107369Domain d4juca2: 4juc A:182-341 [253082]
      Other proteins in same PDB: d4juca1, d4juca3, d4jucb1, d4jucb3, d4jucc1, d4jucc3, d4jucd1, d4jucd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, tpp; mutant
    2. 2107370Domain d4jucb2: 4juc B:182-341 [253085]
      Other proteins in same PDB: d4juca1, d4juca3, d4jucb1, d4jucb3, d4jucc1, d4jucc3, d4jucd1, d4jucd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, tpp; mutant
    3. 2107371Domain d4jucc2: 4juc C:182-341 [253088]
      Other proteins in same PDB: d4juca1, d4juca3, d4jucb1, d4jucb3, d4jucc1, d4jucc3, d4jucd1, d4jucd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, tpp; mutant
    4. 2107372Domain d4jucd2: 4juc D:182-341 [253091]
      Other proteins in same PDB: d4juca1, d4juca3, d4jucb1, d4jucb3, d4jucc1, d4jucc3, d4jucd1, d4jucd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, tpp; mutant
  25. Domain(s) for 4jud:
  26. Domain(s) for 4juf:
    1. 2107361Domain d4jufa2: 4juf A:182-341 [253097]
      Other proteins in same PDB: d4jufa1, d4jufa3, d4jufb1, d4jufb3, d4jufc1, d4jufc3, d4jufd1, d4jufd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    2. 2107362Domain d4jufb2: 4juf B:182-341 [253100]
      Other proteins in same PDB: d4jufa1, d4jufa3, d4jufb1, d4jufb3, d4jufc1, d4jufc3, d4jufd1, d4jufd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    3. 2107363Domain d4jufc2: 4juf C:182-341 [253103]
      Other proteins in same PDB: d4jufa1, d4jufa3, d4jufb1, d4jufb3, d4jufc1, d4jufc3, d4jufd1, d4jufd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    4. 2107364Domain d4jufd2: 4juf D:182-341 [253106]
      Other proteins in same PDB: d4jufa1, d4jufa3, d4jufb1, d4jufb3, d4jufc1, d4jufc3, d4jufd1, d4jufd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
  27. Domain(s) for 4k9k:
  28. Domain(s) for 4k9l:
  29. Domain(s) for 4k9m:
  30. Domain(s) for 4k9n:
    1. 2107345Domain d4k9na2: 4k9n A:182-341 [253185]
      Other proteins in same PDB: d4k9na1, d4k9na3, d4k9nb1, d4k9nb3, d4k9nc1, d4k9nc3, d4k9nd1, d4k9nd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with gol, mg, tzd; mutant
    2. 2107346Domain d4k9nb2: 4k9n B:182-341 [253188]
      Other proteins in same PDB: d4k9na1, d4k9na3, d4k9nb1, d4k9nb3, d4k9nc1, d4k9nc3, d4k9nd1, d4k9nd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with gol, mg, tzd; mutant
    3. 2107347Domain d4k9nc2: 4k9n C:182-341 [253191]
      Other proteins in same PDB: d4k9na1, d4k9na3, d4k9nb1, d4k9nb3, d4k9nc1, d4k9nc3, d4k9nd1, d4k9nd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with gol, mg, tzd; mutant
    4. 2107348Domain d4k9nd2: 4k9n D:182-341 [253194]
      Other proteins in same PDB: d4k9na1, d4k9na3, d4k9nb1, d4k9nb3, d4k9nc1, d4k9nc3, d4k9nd1, d4k9nd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with gol, mg, tzd; mutant
  31. Domain(s) for 4k9o:
    1. 2107354Domain d4k9oa2: 4k9o A:182-341 [253197]
      Other proteins in same PDB: d4k9oa1, d4k9oa3, d4k9ob1, d4k9ob3, d4k9oc1, d4k9oc3, d4k9od1, d4k9od3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    2. 2107355Domain d4k9ob2: 4k9o B:182-341 [253200]
      Other proteins in same PDB: d4k9oa1, d4k9oa3, d4k9ob1, d4k9ob3, d4k9oc1, d4k9oc3, d4k9od1, d4k9od3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    3. 2107356Domain d4k9oc2: 4k9o C:182-341 [253203]
      Other proteins in same PDB: d4k9oa1, d4k9oa3, d4k9ob1, d4k9ob3, d4k9oc1, d4k9oc3, d4k9od1, d4k9od3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    4. 2107357Domain d4k9od2: 4k9o D:182-341 [253206]
      Other proteins in same PDB: d4k9oa1, d4k9oa3, d4k9ob1, d4k9ob3, d4k9oc1, d4k9oc3, d4k9od1, d4k9od3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
  32. Domain(s) for 4k9p:
    1. 2107365Domain d4k9pa2: 4k9p A:182-341 [253209]
      Other proteins in same PDB: d4k9pa1, d4k9pa3, d4k9pb1, d4k9pb3, d4k9pc1, d4k9pc3, d4k9pd1, d4k9pd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    2. 2107366Domain d4k9pb2: 4k9p B:182-341 [253212]
      Other proteins in same PDB: d4k9pa1, d4k9pa3, d4k9pb1, d4k9pb3, d4k9pc1, d4k9pc3, d4k9pd1, d4k9pd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    3. 2107367Domain d4k9pc2: 4k9p C:182-341 [253215]
      Other proteins in same PDB: d4k9pa1, d4k9pa3, d4k9pb1, d4k9pb3, d4k9pc1, d4k9pc3, d4k9pd1, d4k9pd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
    4. 2107368Domain d4k9pd2: 4k9p D:182-341 [253218]
      Other proteins in same PDB: d4k9pa1, d4k9pa3, d4k9pb1, d4k9pb3, d4k9pc1, d4k9pc3, d4k9pd1, d4k9pd3
      automated match to d1q6za1
      complexed with ca, gol, mg, tpp; mutant
  33. Domain(s) for 4mpj:
  34. Domain(s) for 4mpp:
  35. Domain(s) for 4mpr:
  36. Domain(s) for 4mq5:
  37. Domain(s) for 4mzx:
  38. Domain(s) for 4qel:
  39. Domain(s) for 5dei:
    1. 2107341Domain d5deia2: 5dei A:183-342 [276918]
      Other proteins in same PDB: d5deia1, d5deia3, d5deib1, d5deib3, d5deic1, d5deic3, d5deid1, d5deid3
      automated match to d1q6za1
      complexed with bct, ca, mg, tdp
    2. 2107342Domain d5deib2: 5dei B:183-342 [276924]
      Other proteins in same PDB: d5deia1, d5deia3, d5deib1, d5deib3, d5deic1, d5deic3, d5deid1, d5deid3
      automated match to d1q6za1
      complexed with bct, ca, mg, tdp
    3. 2107343Domain d5deic2: 5dei C:183-342 [276933]
      Other proteins in same PDB: d5deia1, d5deia3, d5deib1, d5deib3, d5deic1, d5deic3, d5deid1, d5deid3
      automated match to d1q6za1
      complexed with bct, ca, mg, tdp
    4. 2107344Domain d5deid2: 5dei D:183-342 [276921]
      Other proteins in same PDB: d5deia1, d5deia3, d5deib1, d5deib3, d5deic1, d5deic3, d5deid1, d5deid3
      automated match to d1q6za1
      complexed with bct, ca, mg, tdp
  40. Domain(s) for 5dgd:
  41. Domain(s) for 5dgt:

More info for Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase

Timeline for Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase: