SCOPe 2.07: Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]

Lineage for Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]

Root: SCOPe 2.07
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)

Fold c.2: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51734] (1 superfamily)
core: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
The nucleotide-binding modes of this and the next two folds/superfamilies are similar

Superfamily c.2.1: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51735] (13 families)

Family c.2.1.7: Aminoacid dehydrogenase-like, C-terminal domain [51883] (12 proteins)
extra N-terminal helix displaces the C-terminal helix (following strand 6) from its usual position creating a family nicotineamide-binding site

Protein Glutamate dehydrogenase [51884] (8 species)
Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [51889] (8 PDB entries)

PDB entries in Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]:

Domain(s) for 1ch6:
1. Domain d1ch6a2: 1ch6 A:209-501 [302279]
  Other proteins in same PDB: d1ch6a1, d1ch6e1, d1ch6f1
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nad
2. Domain d1ch6e2: 1ch6 E:209-501 [302281]
  Other proteins in same PDB: d1ch6a1, d1ch6e1, d1ch6f1
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nad
3. Domain d1ch6f2: 1ch6 F:209-501 [302283]
  Other proteins in same PDB: d1ch6a1, d1ch6e1, d1ch6f1
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nad
Domain(s) for 1hwx:
1. Domain d1hwxa4: 1hwx A:209-501 [302491]
  Other proteins in same PDB: d1hwxa3, d1hwxb3, d1hwxc3, d1hwxd3, d1hwxe3, d1hwxf3
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nai
2. Domain d1hwxb4: 1hwx B:209-501 [302493]
  Other proteins in same PDB: d1hwxa3, d1hwxb3, d1hwxc3, d1hwxd3, d1hwxe3, d1hwxf3
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nai
3. Domain d1hwxc4: 1hwx C:209-501 [302495]
  Other proteins in same PDB: d1hwxa3, d1hwxb3, d1hwxc3, d1hwxd3, d1hwxe3, d1hwxf3
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nai
4. Domain d1hwxd4: 1hwx D:209-501 [302497]
  Other proteins in same PDB: d1hwxa3, d1hwxb3, d1hwxc3, d1hwxd3, d1hwxe3, d1hwxf3
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nai
5. Domain d1hwxe4: 1hwx E:209-501 [302499]
  Other proteins in same PDB: d1hwxa3, d1hwxb3, d1hwxc3, d1hwxd3, d1hwxe3, d1hwxf3
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nai
6. Domain d1hwxf4: 1hwx F:209-501 [302501]
  Other proteins in same PDB: d1hwxa3, d1hwxb3, d1hwxc3, d1hwxd3, d1hwxe3, d1hwxf3
  automated match to d1hwza1
  complexed with glu, gtp, nai
Domain(s) for 1hwy:
1. Domain d1hwya1: 1hwy A:209-501 [30262]
  Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  complexed with akg, nad, po4
2. Domain d1hwyb1: 1hwy B:209-501 [30263]
  Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  complexed with akg, nad, po4
3. Domain d1hwyc1: 1hwy C:209-501 [30264]
  Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  complexed with akg, nad, po4
4. Domain d1hwyd1: 1hwy D:209-501 [30265]
  Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  complexed with akg, nad, po4
5. Domain d1hwye1: 1hwy E:209-501 [30266]
  Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  complexed with akg, nad, po4
6. Domain d1hwyf1: 1hwy F:209-501 [30267]
  Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  complexed with akg, nad, po4
Domain(s) for 1hwz:
1. Domain d1hwza1: 1hwz A:209-501 [30256]
  Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  complexed with glu, gtp, ndp
2. Domain d1hwzb1: 1hwz B:209-501 [30257]
  Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  complexed with glu, gtp, ndp
3. Domain d1hwzc1: 1hwz C:209-501 [30258]
  Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  complexed with glu, gtp, ndp
4. Domain d1hwzd1: 1hwz D:209-501 [30259]
  Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  complexed with glu, gtp, ndp
5. Domain d1hwze1: 1hwz E:209-501 [30260]
  Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  complexed with glu, gtp, ndp
6. Domain d1hwzf1: 1hwz F:209-501 [30261]
  Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  complexed with glu, gtp, ndp
Domain(s) for 1nqt:
1. Domain d1nqta1: 1nqt A:209-501 [86052]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
2. Domain d1nqtb1: 1nqt B:209-501 [86054]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
3. Domain d1nqtc1: 1nqt C:209-501 [86056]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
4. Domain d1nqtd1: 1nqt D:209-501 [86058]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
5. Domain d1nqte1: 1nqt E:209-501 [86060]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
6. Domain d1nqtf1: 1nqt F:209-501 [86062]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
7. Domain d1nqtg1: 1nqt G:209-501 [86064]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
8. Domain d1nqth1: 1nqt H:209-501 [86066]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
9. Domain d1nqti1: 1nqt I:209-501 [86068]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
10. Domain d1nqtj1: 1nqt J:209-501 [86070]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
11. Domain d1nqtk1: 1nqt K:209-501 [86072]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
12. Domain d1nqtl1: 1nqt L:209-501 [86074]
  Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
  complexed with adp
Domain(s) for 1nr7:
1. Domain d1nr7a1: 1nr7 A:209-501 [86095]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
2. Domain d1nr7b1: 1nr7 B:209-501 [86097]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
3. Domain d1nr7c1: 1nr7 C:209-501 [86099]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
4. Domain d1nr7d1: 1nr7 D:209-501 [86101]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
5. Domain d1nr7e1: 1nr7 E:209-501 [86103]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
6. Domain d1nr7f1: 1nr7 F:209-501 [86105]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
7. Domain d1nr7g1: 1nr7 G:209-501 [86107]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
8. Domain d1nr7h1: 1nr7 H:209-501 [86109]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
9. Domain d1nr7i1: 1nr7 I:209-501 [86111]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
10. Domain d1nr7j1: 1nr7 J:209-501 [86113]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
11. Domain d1nr7k1: 1nr7 K:209-501 [86115]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
12. Domain d1nr7l1: 1nr7 L:209-501 [86117]
  Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
Domain(s) for 3mvq:
1. Domain d3mvqa2: 3mvq A:209-495 [213596]
  Other proteins in same PDB: d3mvqa1, d3mvqb1, d3mvqc1, d3mvqd1, d3mvqe1, d3mvqf1
  automated match to d3mw9a1
  complexed with glu, gtp, ndp, zn
2. Domain d3mvqb2: 3mvq B:209-495 [213598]
  Other proteins in same PDB: d3mvqa1, d3mvqb1, d3mvqc1, d3mvqd1, d3mvqe1, d3mvqf1
  automated match to d3mw9a1
  complexed with glu, gtp, ndp, zn
3. Domain d3mvqc2: 3mvq C:209-495 [213600]
  Other proteins in same PDB: d3mvqa1, d3mvqb1, d3mvqc1, d3mvqd1, d3mvqe1, d3mvqf1
  automated match to d3mw9a1
  complexed with glu, gtp, ndp, zn
4. Domain d3mvqd2: 3mvq D:209-495 [213602]
  Other proteins in same PDB: d3mvqa1, d3mvqb1, d3mvqc1, d3mvqd1, d3mvqe1, d3mvqf1
  automated match to d3mw9a1
  complexed with glu, gtp, ndp, zn
5. Domain d3mvqe2: 3mvq E:209-495 [213604]
  Other proteins in same PDB: d3mvqa1, d3mvqb1, d3mvqc1, d3mvqd1, d3mvqe1, d3mvqf1
  automated match to d3mw9a1
  complexed with glu, gtp, ndp, zn
6. Domain d3mvqf2: 3mvq F:209-501 [213606]
  Other proteins in same PDB: d3mvqa1, d3mvqb1, d3mvqc1, d3mvqd1, d3mvqe1, d3mvqf1
  automated match to d3mw9a1
  complexed with glu, gtp, ndp, zn
Domain(s) for 3mw9:
1. Domain d3mw9a1: 3mw9 A:209-501 [181634]
  Other proteins in same PDB: d3mw9a2, d3mw9b2, d3mw9c2, d3mw9d2, d3mw9e2, d3mw9f2
  complexed with glu, gtp, nai
2. Domain d3mw9b1: 3mw9 B:209-501 [181636]
  Other proteins in same PDB: d3mw9a2, d3mw9b2, d3mw9c2, d3mw9d2, d3mw9e2, d3mw9f2
  complexed with glu, gtp, nai
3. Domain d3mw9c1: 3mw9 C:209-501 [181638]
  Other proteins in same PDB: d3mw9a2, d3mw9b2, d3mw9c2, d3mw9d2, d3mw9e2, d3mw9f2
  complexed with glu, gtp, nai
4. Domain d3mw9d1: 3mw9 D:209-501 [181640]
  Other proteins in same PDB: d3mw9a2, d3mw9b2, d3mw9c2, d3mw9d2, d3mw9e2, d3mw9f2
  complexed with glu, gtp, nai
5. Domain d3mw9e1: 3mw9 E:209-501 [181642]
  Other proteins in same PDB: d3mw9a2, d3mw9b2, d3mw9c2, d3mw9d2, d3mw9e2, d3mw9f2
  complexed with glu, gtp, nai
6. Domain d3mw9f1: 3mw9 F:209-501 [181644]
  Other proteins in same PDB: d3mw9a2, d3mw9b2, d3mw9c2, d3mw9d2, d3mw9e2, d3mw9f2
  complexed with glu, gtp, nai

More info for Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from c.2.1.7 Glutamate dehydrogenase

Timeline for Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from c.2.1.7 Glutamate dehydrogenase:

Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from c.2.1.7 Glutamate dehydrogenase first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from c.2.1.7 Glutamate dehydrogenase appears in SCOPe 2.06
Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from c.2.1.7 Glutamate dehydrogenase appears in the current release, SCOPe 2.08