Lineage for Protein: Glutamate dehydrogenase

  1. Root: SCOP 1.69
  2. 473232Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (136 folds)
  3. 476939Fold c.2: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51734] (1 superfamily)
    core: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
    The nucleotide-binding modes of this and the next two folds/superfamilies are similar
  4. 476940Superfamily c.2.1: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51735] (12 families) (S)
  5. 478576Family c.2.1.7: Aminoacid dehydrogenase-like, C-terminal domain [51883] (11 proteins)
    extra N-terminal helix displaces the C-terminal helix (following strand 6) from its usual position creating a family nicotineamide-binding site
  6. 478577Protein Glutamate dehydrogenase [51884] (7 species)

Species:

  1. 478578Archaeon Pyrococcus furiosus [TaxId:2261] [51886] (1 PDB entry)
  2. 478582Archaeon Thermococcus litoralis [TaxId:2265] [51887] (1 PDB entry)
  3. 478589Archaeon Thermococcus profundus [TaxId:49899] [63943] (1 PDB entry)
  4. 478596Clostridium symbiosum [TaxId:1512] [51885] (4 PDB entries)
    1. Domain for 1aup:
    2. Domain for 1bgv:
    3. Domains for 1hrd:
      1. 478597Domain d1hrda1: 1hrd A:195-449 [30219]
        Other proteins in same PDB: d1hrda2, d1hrdb2, d1hrdc2
      2. 478598Domain d1hrdb1: 1hrd B:195-449 [30220]
        Other proteins in same PDB: d1hrda2, d1hrdb2, d1hrdc2
      3. 478599Domain d1hrdc1: 1hrd C:195-449 [30221]
        Other proteins in same PDB: d1hrda2, d1hrdb2, d1hrdc2
    4. Domain for 1k89:
  5. 478603Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [51889] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1hwx:
      1. 478604Domain d1hwxa1: 1hwx A:209-501 [30250]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
      2. 478605Domain d1hwxb1: 1hwx B:209-501 [30251]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
      3. 478606Domain d1hwxc1: 1hwx C:209-501 [30252]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
      4. 478607Domain d1hwxd1: 1hwx D:209-501 [30253]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
      5. 478608Domain d1hwxe1: 1hwx E:209-501 [30254]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
      6. 478609Domain d1hwxf1: 1hwx F:209-501 [30255]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
    2. Domains for 1hwy:
      1. 478628Domain d1hwya1: 1hwy A:209-501 [30262]
        Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
      2. 478629Domain d1hwyb1: 1hwy B:209-501 [30263]
        Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
      3. 478630Domain d1hwyc1: 1hwy C:209-501 [30264]
        Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
      4. 478631Domain d1hwyd1: 1hwy D:209-501 [30265]
        Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
      5. 478632Domain d1hwye1: 1hwy E:209-501 [30266]
        Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
      6. 478633Domain d1hwyf1: 1hwy F:209-501 [30267]
        Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
    3. Domains for 1hwz:
      1. 478622Domain d1hwza1: 1hwz A:209-501 [30256]
        Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
      2. 478623Domain d1hwzb1: 1hwz B:209-501 [30257]
        Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
      3. 478624Domain d1hwzc1: 1hwz C:209-501 [30258]
        Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
      4. 478625Domain d1hwzd1: 1hwz D:209-501 [30259]
        Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
      5. 478626Domain d1hwze1: 1hwz E:209-501 [30260]
        Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
      6. 478627Domain d1hwzf1: 1hwz F:209-501 [30261]
        Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
    4. Domains for 1nqt:
      1. 478634Domain d1nqta1: 1nqt A:209-501 [86052]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      2. 478635Domain d1nqtb1: 1nqt B:209-501 [86054]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      3. 478636Domain d1nqtc1: 1nqt C:209-501 [86056]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      4. 478637Domain d1nqtd1: 1nqt D:209-501 [86058]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      5. 478638Domain d1nqte1: 1nqt E:209-501 [86060]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      6. 478639Domain d1nqtf1: 1nqt F:209-501 [86062]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      7. 478640Domain d1nqtg1: 1nqt G:209-501 [86064]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      8. 478641Domain d1nqth1: 1nqt H:209-501 [86066]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      9. 478642Domain d1nqti1: 1nqt I:209-501 [86068]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      10. 478643Domain d1nqtj1: 1nqt J:209-501 [86070]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      11. 478644Domain d1nqtk1: 1nqt K:209-501 [86072]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
      12. 478645Domain d1nqtl1: 1nqt L:209-501 [86074]
        Other proteins in same PDB: d1nqta2, d1nqtb2, d1nqtc2, d1nqtd2, d1nqte2, d1nqtf2, d1nqtg2, d1nqth2, d1nqti2, d1nqtj2, d1nqtk2, d1nqtl2
    5. Domains for 1nr7:
      1. 478610Domain d1nr7a1: 1nr7 A:209-501 [86095]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      2. 478611Domain d1nr7b1: 1nr7 B:209-501 [86097]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      3. 478612Domain d1nr7c1: 1nr7 C:209-501 [86099]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      4. 478613Domain d1nr7d1: 1nr7 D:209-501 [86101]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      5. 478614Domain d1nr7e1: 1nr7 E:209-501 [86103]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      6. 478615Domain d1nr7f1: 1nr7 F:209-501 [86105]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      7. 478616Domain d1nr7g1: 1nr7 G:209-501 [86107]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      8. 478617Domain d1nr7h1: 1nr7 H:209-501 [86109]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      9. 478618Domain d1nr7i1: 1nr7 I:209-501 [86111]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      10. 478619Domain d1nr7j1: 1nr7 J:209-501 [86113]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      11. 478620Domain d1nr7k1: 1nr7 K:209-501 [86115]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
      12. 478621Domain d1nr7l1: 1nr7 L:209-501 [86117]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a2, d1nr7b2, d1nr7c2, d1nr7d2, d1nr7e2, d1nr7f2, d1nr7g2, d1nr7h2, d1nr7i2, d1nr7j2, d1nr7k2, d1nr7l2
  6. 478646Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [75115] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1l1f:
      1. 478653Domain d1l1fa1: 1l1f A:213-505 [73456]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
      2. 478654Domain d1l1fb1: 1l1f B:213-505 [73458]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
      3. 478655Domain d1l1fc1: 1l1f C:213-505 [73460]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
      4. 478656Domain d1l1fd1: 1l1f D:213-505 [73462]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
      5. 478657Domain d1l1fe1: 1l1f E:213-505 [73464]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
      6. 478658Domain d1l1ff1: 1l1f F:213-505 [73466]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
    2. Domains for 1nr1:
      1. 478647Domain d1nr1a1: 1nr1 A:213-505 [86080]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a2, d1nr1b2, d1nr1c2, d1nr1d2, d1nr1e2, d1nr1f2
      2. 478648Domain d1nr1b1: 1nr1 B:213-505 [86082]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a2, d1nr1b2, d1nr1c2, d1nr1d2, d1nr1e2, d1nr1f2
      3. 478649Domain d1nr1c1: 1nr1 C:213-505 [86084]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a2, d1nr1b2, d1nr1c2, d1nr1d2, d1nr1e2, d1nr1f2
      4. 478650Domain d1nr1d1: 1nr1 D:213-505 [86086]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a2, d1nr1b2, d1nr1c2, d1nr1d2, d1nr1e2, d1nr1f2
      5. 478651Domain d1nr1e1: 1nr1 E:213-505 [86088]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a2, d1nr1b2, d1nr1c2, d1nr1d2, d1nr1e2, d1nr1f2
      6. 478652Domain d1nr1f1: 1nr1 F:213-505 [86090]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a2, d1nr1b2, d1nr1c2, d1nr1d2, d1nr1e2, d1nr1f2
  7. 478659Thermotoga maritima [TaxId:243274] [51888] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1b26:
      1. 478660Domain d1b26a1: 1b26 A:179-412 [30232]
        Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
      2. 478661Domain d1b26b1: 1b26 B:179-412 [30233]
        Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
      3. 478662Domain d1b26c1: 1b26 C:179-412 [30234]
        Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
      4. 478663Domain d1b26d1: 1b26 D:179-412 [30235]
        Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
      5. 478664Domain d1b26e1: 1b26 E:179-412 [30236]
        Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
      6. 478665Domain d1b26f1: 1b26 F:179-412 [30237]
        Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
    2. Domains for 1b3b:
      1. 478666Domain d1b3ba1: 1b3b A:179-412 [30244]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
      2. 478667Domain d1b3bb1: 1b3b B:179-412 [30245]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
      3. 478668Domain d1b3bc1: 1b3b C:179-412 [30246]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
      4. 478669Domain d1b3bd1: 1b3b D:179-412 [30247]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
      5. 478670Domain d1b3be1: 1b3b E:179-412 [30248]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
      6. 478671Domain d1b3bf1: 1b3b F:179-412 [30249]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
    3. Domains for 2tmg:
      1. 478672Domain d2tmga1: 2tmg A:179-411 [30238]
        Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
      2. 478673Domain d2tmgb1: 2tmg B:179-411 [30239]
        Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
      3. 478674Domain d2tmgc1: 2tmg C:179-411 [30240]
        Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
      4. 478675Domain d2tmgd1: 2tmg D:179-411 [30241]
        Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
      5. 478676Domain d2tmge1: 2tmg E:179-411 [30242]
        Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
      6. 478677Domain d2tmgf1: 2tmg F:179-411 [30243]
        Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2

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