Lineage for Species: Rabbit (Oryctolagus cuniculus) [TaxId: 9986]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2078560Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2088020Superfamily c.1.12: Phosphoenolpyruvate/pyruvate domain [51621] (8 families) (S)
  5. 2088021Family c.1.12.1: Pyruvate kinase [51622] (1 protein)
  6. 2088022Protein Pyruvate kinase, N-terminal domain [51623] (6 species)
    this domain is interrupted by an all-beta domain
    C-terminal domain is alpha/beta
  7. 2088072Species Rabbit (Oryctolagus cuniculus) [TaxId:9986] [51625] (7 PDB entries)

PDB entries in Species: Rabbit (Oryctolagus cuniculus) [TaxId: 9986]:

  1. Domain(s) for 1a49:
    1. 2088081Domain d1a49a2: 1a49 A:12-115,A:218-395 [29255]
      Other proteins in same PDB: d1a49a1, d1a49a3, d1a49b1, d1a49b3, d1a49c1, d1a49c3, d1a49d1, d1a49d3, d1a49e1, d1a49e3, d1a49f1, d1a49f3, d1a49g1, d1a49g3, d1a49h1, d1a49h3
      complexed with atp, k, mg, oxl
    2. 2088082Domain d1a49b2: 1a49 B:612-715,B:818-995 [29256]
      Other proteins in same PDB: d1a49a1, d1a49a3, d1a49b1, d1a49b3, d1a49c1, d1a49c3, d1a49d1, d1a49d3, d1a49e1, d1a49e3, d1a49f1, d1a49f3, d1a49g1, d1a49g3, d1a49h1, d1a49h3
      complexed with atp, k, mg, oxl
    3. 2088083Domain d1a49c2: 1a49 C:1212-1315,C:1418-1595 [29257]
      Other proteins in same PDB: d1a49a1, d1a49a3, d1a49b1, d1a49b3, d1a49c1, d1a49c3, d1a49d1, d1a49d3, d1a49e1, d1a49e3, d1a49f1, d1a49f3, d1a49g1, d1a49g3, d1a49h1, d1a49h3
      complexed with atp, k, mg, oxl
    4. 2088084Domain d1a49d2: 1a49 D:1812-1915,D:2018-2195 [29258]
      Other proteins in same PDB: d1a49a1, d1a49a3, d1a49b1, d1a49b3, d1a49c1, d1a49c3, d1a49d1, d1a49d3, d1a49e1, d1a49e3, d1a49f1, d1a49f3, d1a49g1, d1a49g3, d1a49h1, d1a49h3
      complexed with atp, k, mg, oxl
    5. 2088085Domain d1a49e2: 1a49 E:3012-3115,E:3218-3395 [29259]
      Other proteins in same PDB: d1a49a1, d1a49a3, d1a49b1, d1a49b3, d1a49c1, d1a49c3, d1a49d1, d1a49d3, d1a49e1, d1a49e3, d1a49f1, d1a49f3, d1a49g1, d1a49g3, d1a49h1, d1a49h3
      complexed with atp, k, mg, oxl
    6. 2088086Domain d1a49f2: 1a49 F:3612-3715,F:3818-3995 [29260]
      Other proteins in same PDB: d1a49a1, d1a49a3, d1a49b1, d1a49b3, d1a49c1, d1a49c3, d1a49d1, d1a49d3, d1a49e1, d1a49e3, d1a49f1, d1a49f3, d1a49g1, d1a49g3, d1a49h1, d1a49h3
      complexed with atp, k, mg, oxl
    7. 2088087Domain d1a49g2: 1a49 G:4212-4315,G:4418-4595 [29261]
      Other proteins in same PDB: d1a49a1, d1a49a3, d1a49b1, d1a49b3, d1a49c1, d1a49c3, d1a49d1, d1a49d3, d1a49e1, d1a49e3, d1a49f1, d1a49f3, d1a49g1, d1a49g3, d1a49h1, d1a49h3
      complexed with atp, k, mg, oxl
    8. 2088088Domain d1a49h2: 1a49 H:4812-4915,H:5018-5195 [29262]
      Other proteins in same PDB: d1a49a1, d1a49a3, d1a49b1, d1a49b3, d1a49c1, d1a49c3, d1a49d1, d1a49d3, d1a49e1, d1a49e3, d1a49f1, d1a49f3, d1a49g1, d1a49g3, d1a49h1, d1a49h3
      complexed with atp, k, mg, oxl
  2. Domain(s) for 1a5u:
    1. 2088089Domain d1a5ua2: 1a5u A:12-115,A:218-395 [29263]
      Other proteins in same PDB: d1a5ua1, d1a5ua3, d1a5ub1, d1a5ub3, d1a5uc1, d1a5uc3, d1a5ud1, d1a5ud3, d1a5ue1, d1a5ue3, d1a5uf1, d1a5uf3, d1a5ug1, d1a5ug3, d1a5uh1, d1a5uh3
      complexed with atp, mg, na, oxl
    2. 2088090Domain d1a5ub2: 1a5u B:612-715,B:818-995 [29264]
      Other proteins in same PDB: d1a5ua1, d1a5ua3, d1a5ub1, d1a5ub3, d1a5uc1, d1a5uc3, d1a5ud1, d1a5ud3, d1a5ue1, d1a5ue3, d1a5uf1, d1a5uf3, d1a5ug1, d1a5ug3, d1a5uh1, d1a5uh3
      complexed with atp, mg, na, oxl
    3. 2088091Domain d1a5uc2: 1a5u C:1212-1315,C:1418-1595 [29265]
      Other proteins in same PDB: d1a5ua1, d1a5ua3, d1a5ub1, d1a5ub3, d1a5uc1, d1a5uc3, d1a5ud1, d1a5ud3, d1a5ue1, d1a5ue3, d1a5uf1, d1a5uf3, d1a5ug1, d1a5ug3, d1a5uh1, d1a5uh3
      complexed with atp, mg, na, oxl
    4. 2088092Domain d1a5ud2: 1a5u D:1812-1915,D:2018-2195 [29266]
      Other proteins in same PDB: d1a5ua1, d1a5ua3, d1a5ub1, d1a5ub3, d1a5uc1, d1a5uc3, d1a5ud1, d1a5ud3, d1a5ue1, d1a5ue3, d1a5uf1, d1a5uf3, d1a5ug1, d1a5ug3, d1a5uh1, d1a5uh3
      complexed with atp, mg, na, oxl
    5. 2088093Domain d1a5ue2: 1a5u E:3012-3115,E:3218-3395 [29267]
      Other proteins in same PDB: d1a5ua1, d1a5ua3, d1a5ub1, d1a5ub3, d1a5uc1, d1a5uc3, d1a5ud1, d1a5ud3, d1a5ue1, d1a5ue3, d1a5uf1, d1a5uf3, d1a5ug1, d1a5ug3, d1a5uh1, d1a5uh3
      complexed with atp, mg, na, oxl
    6. 2088094Domain d1a5uf2: 1a5u F:3612-3715,F:3818-3995 [29268]
      Other proteins in same PDB: d1a5ua1, d1a5ua3, d1a5ub1, d1a5ub3, d1a5uc1, d1a5uc3, d1a5ud1, d1a5ud3, d1a5ue1, d1a5ue3, d1a5uf1, d1a5uf3, d1a5ug1, d1a5ug3, d1a5uh1, d1a5uh3
      complexed with atp, mg, na, oxl
    7. 2088095Domain d1a5ug2: 1a5u G:4212-4315,G:4418-4595 [29269]
      Other proteins in same PDB: d1a5ua1, d1a5ua3, d1a5ub1, d1a5ub3, d1a5uc1, d1a5uc3, d1a5ud1, d1a5ud3, d1a5ue1, d1a5ue3, d1a5uf1, d1a5uf3, d1a5ug1, d1a5ug3, d1a5uh1, d1a5uh3
      complexed with atp, mg, na, oxl
    8. 2088096Domain d1a5uh2: 1a5u H:4812-4915,H:5018-5195 [29270]
      Other proteins in same PDB: d1a5ua1, d1a5ua3, d1a5ub1, d1a5ub3, d1a5uc1, d1a5uc3, d1a5ud1, d1a5ud3, d1a5ue1, d1a5ue3, d1a5uf1, d1a5uf3, d1a5ug1, d1a5ug3, d1a5uh1, d1a5uh3
      complexed with atp, mg, na, oxl
  3. Domain(s) for 1aqf:
    1. 2088097Domain d1aqfa2: 1aqf A:12-115,A:218-395 [29272]
      Other proteins in same PDB: d1aqfa1, d1aqfa3, d1aqfb1, d1aqfb3, d1aqfc1, d1aqfc3, d1aqfd1, d1aqfd3, d1aqfe1, d1aqfe3, d1aqff1, d1aqff3, d1aqfg1, d1aqfg3, d1aqfh1, d1aqfh3
      complexed with k, mg, peq
    2. 2088098Domain d1aqfb2: 1aqf B:12-115,B:218-395 [29273]
      Other proteins in same PDB: d1aqfa1, d1aqfa3, d1aqfb1, d1aqfb3, d1aqfc1, d1aqfc3, d1aqfd1, d1aqfd3, d1aqfe1, d1aqfe3, d1aqff1, d1aqff3, d1aqfg1, d1aqfg3, d1aqfh1, d1aqfh3
      complexed with k, mg, peq
    3. 2088099Domain d1aqfc2: 1aqf C:12-115,C:218-395 [29274]
      Other proteins in same PDB: d1aqfa1, d1aqfa3, d1aqfb1, d1aqfb3, d1aqfc1, d1aqfc3, d1aqfd1, d1aqfd3, d1aqfe1, d1aqfe3, d1aqff1, d1aqff3, d1aqfg1, d1aqfg3, d1aqfh1, d1aqfh3
      complexed with k, mg, peq
    4. 2088100Domain d1aqfd2: 1aqf D:12-115,D:218-395 [29275]
      Other proteins in same PDB: d1aqfa1, d1aqfa3, d1aqfb1, d1aqfb3, d1aqfc1, d1aqfc3, d1aqfd1, d1aqfd3, d1aqfe1, d1aqfe3, d1aqff1, d1aqff3, d1aqfg1, d1aqfg3, d1aqfh1, d1aqfh3
      complexed with k, mg, peq
    5. 2088101Domain d1aqfe2: 1aqf E:12-115,E:218-395 [29276]
      Other proteins in same PDB: d1aqfa1, d1aqfa3, d1aqfb1, d1aqfb3, d1aqfc1, d1aqfc3, d1aqfd1, d1aqfd3, d1aqfe1, d1aqfe3, d1aqff1, d1aqff3, d1aqfg1, d1aqfg3, d1aqfh1, d1aqfh3
      complexed with k, mg, peq
    6. 2088102Domain d1aqff2: 1aqf F:12-115,F:218-395 [29277]
      Other proteins in same PDB: d1aqfa1, d1aqfa3, d1aqfb1, d1aqfb3, d1aqfc1, d1aqfc3, d1aqfd1, d1aqfd3, d1aqfe1, d1aqfe3, d1aqff1, d1aqff3, d1aqfg1, d1aqfg3, d1aqfh1, d1aqfh3
      complexed with k, mg, peq
    7. 2088103Domain d1aqfg2: 1aqf G:12-115,G:218-395 [29278]
      Other proteins in same PDB: d1aqfa1, d1aqfa3, d1aqfb1, d1aqfb3, d1aqfc1, d1aqfc3, d1aqfd1, d1aqfd3, d1aqfe1, d1aqfe3, d1aqff1, d1aqff3, d1aqfg1, d1aqfg3, d1aqfh1, d1aqfh3
      complexed with k, mg, peq
    8. 2088104Domain d1aqfh2: 1aqf H:12-115,H:218-395 [29279]
      Other proteins in same PDB: d1aqfa1, d1aqfa3, d1aqfb1, d1aqfb3, d1aqfc1, d1aqfc3, d1aqfd1, d1aqfd3, d1aqfe1, d1aqfe3, d1aqff1, d1aqff3, d1aqfg1, d1aqfg3, d1aqfh1, d1aqfh3
      complexed with k, mg, peq
  4. Domain(s) for 1f3w:
    1. 2088114Domain d1f3wa2: 1f3w A:12-115,A:218-395 [64935]
      Other proteins in same PDB: d1f3wa1, d1f3wa3, d1f3wb1, d1f3wb3, d1f3wc1, d1f3wc3, d1f3wd1, d1f3wd3, d1f3we1, d1f3we3, d1f3wf1, d1f3wf3, d1f3wg1, d1f3wg3, d1f3wh1, d1f3wh3
      complexed with k, mn, pyr
    2. 2088115Domain d1f3wb2: 1f3w B:12-115,B:218-395 [64938]
      Other proteins in same PDB: d1f3wa1, d1f3wa3, d1f3wb1, d1f3wb3, d1f3wc1, d1f3wc3, d1f3wd1, d1f3wd3, d1f3we1, d1f3we3, d1f3wf1, d1f3wf3, d1f3wg1, d1f3wg3, d1f3wh1, d1f3wh3
      complexed with k, mn, pyr
    3. 2088116Domain d1f3wc2: 1f3w C:12-115,C:218-395 [64941]
      Other proteins in same PDB: d1f3wa1, d1f3wa3, d1f3wb1, d1f3wb3, d1f3wc1, d1f3wc3, d1f3wd1, d1f3wd3, d1f3we1, d1f3we3, d1f3wf1, d1f3wf3, d1f3wg1, d1f3wg3, d1f3wh1, d1f3wh3
      complexed with k, mn, pyr
    4. 2088117Domain d1f3wd2: 1f3w D:12-115,D:218-395 [64944]
      Other proteins in same PDB: d1f3wa1, d1f3wa3, d1f3wb1, d1f3wb3, d1f3wc1, d1f3wc3, d1f3wd1, d1f3wd3, d1f3we1, d1f3we3, d1f3wf1, d1f3wf3, d1f3wg1, d1f3wg3, d1f3wh1, d1f3wh3
      complexed with k, mn, pyr
    5. 2088118Domain d1f3we2: 1f3w E:12-115,E:218-395 [64947]
      Other proteins in same PDB: d1f3wa1, d1f3wa3, d1f3wb1, d1f3wb3, d1f3wc1, d1f3wc3, d1f3wd1, d1f3wd3, d1f3we1, d1f3we3, d1f3wf1, d1f3wf3, d1f3wg1, d1f3wg3, d1f3wh1, d1f3wh3
      complexed with k, mn, pyr
    6. 2088119Domain d1f3wf2: 1f3w F:12-115,F:218-395 [64950]
      Other proteins in same PDB: d1f3wa1, d1f3wa3, d1f3wb1, d1f3wb3, d1f3wc1, d1f3wc3, d1f3wd1, d1f3wd3, d1f3we1, d1f3we3, d1f3wf1, d1f3wf3, d1f3wg1, d1f3wg3, d1f3wh1, d1f3wh3
      complexed with k, mn, pyr
    7. 2088120Domain d1f3wg2: 1f3w G:12-115,G:218-395 [64953]
      Other proteins in same PDB: d1f3wa1, d1f3wa3, d1f3wb1, d1f3wb3, d1f3wc1, d1f3wc3, d1f3wd1, d1f3wd3, d1f3we1, d1f3we3, d1f3wf1, d1f3wf3, d1f3wg1, d1f3wg3, d1f3wh1, d1f3wh3
      complexed with k, mn, pyr
    8. 2088121Domain d1f3wh2: 1f3w H:12-115,H:218-395 [64956]
      Other proteins in same PDB: d1f3wa1, d1f3wa3, d1f3wb1, d1f3wb3, d1f3wc1, d1f3wc3, d1f3wd1, d1f3wd3, d1f3we1, d1f3we3, d1f3wf1, d1f3wf3, d1f3wg1, d1f3wg3, d1f3wh1, d1f3wh3
      complexed with k, mn, pyr
  5. Domain(s) for 1f3x:
    1. 2088105Domain d1f3xa2: 1f3x A:12-115,A:218-395 [64959]
      Other proteins in same PDB: d1f3xa1, d1f3xa3, d1f3xb1, d1f3xb3, d1f3xc1, d1f3xc3, d1f3xd1, d1f3xd3, d1f3xe1, d1f3xe3, d1f3xf1, d1f3xf3, d1f3xg1, d1f3xg3, d1f3xh1, d1f3xh3
      complexed with k, mn, pyr; mutant
    2. 2088106Domain d1f3xb2: 1f3x B:12-115,B:218-395 [64962]
      Other proteins in same PDB: d1f3xa1, d1f3xa3, d1f3xb1, d1f3xb3, d1f3xc1, d1f3xc3, d1f3xd1, d1f3xd3, d1f3xe1, d1f3xe3, d1f3xf1, d1f3xf3, d1f3xg1, d1f3xg3, d1f3xh1, d1f3xh3
      complexed with k, mn, pyr; mutant
    3. 2088107Domain d1f3xc2: 1f3x C:12-115,C:218-395 [64965]
      Other proteins in same PDB: d1f3xa1, d1f3xa3, d1f3xb1, d1f3xb3, d1f3xc1, d1f3xc3, d1f3xd1, d1f3xd3, d1f3xe1, d1f3xe3, d1f3xf1, d1f3xf3, d1f3xg1, d1f3xg3, d1f3xh1, d1f3xh3
      complexed with k, mn, pyr; mutant
    4. 2088108Domain d1f3xd2: 1f3x D:12-115,D:218-395 [64968]
      Other proteins in same PDB: d1f3xa1, d1f3xa3, d1f3xb1, d1f3xb3, d1f3xc1, d1f3xc3, d1f3xd1, d1f3xd3, d1f3xe1, d1f3xe3, d1f3xf1, d1f3xf3, d1f3xg1, d1f3xg3, d1f3xh1, d1f3xh3
      complexed with k, mn, pyr; mutant
    5. 2088109Domain d1f3xe2: 1f3x E:12-115,E:218-395 [64971]
      Other proteins in same PDB: d1f3xa1, d1f3xa3, d1f3xb1, d1f3xb3, d1f3xc1, d1f3xc3, d1f3xd1, d1f3xd3, d1f3xe1, d1f3xe3, d1f3xf1, d1f3xf3, d1f3xg1, d1f3xg3, d1f3xh1, d1f3xh3
      complexed with k, mn, pyr; mutant
    6. 2088110Domain d1f3xf2: 1f3x F:12-115,F:218-395 [64974]
      Other proteins in same PDB: d1f3xa1, d1f3xa3, d1f3xb1, d1f3xb3, d1f3xc1, d1f3xc3, d1f3xd1, d1f3xd3, d1f3xe1, d1f3xe3, d1f3xf1, d1f3xf3, d1f3xg1, d1f3xg3, d1f3xh1, d1f3xh3
      complexed with k, mn, pyr; mutant
    7. 2088111Domain d1f3xg2: 1f3x G:12-115,G:218-395 [64977]
      Other proteins in same PDB: d1f3xa1, d1f3xa3, d1f3xb1, d1f3xb3, d1f3xc1, d1f3xc3, d1f3xd1, d1f3xd3, d1f3xe1, d1f3xe3, d1f3xf1, d1f3xf3, d1f3xg1, d1f3xg3, d1f3xh1, d1f3xh3
      complexed with k, mn, pyr; mutant
    8. 2088112Domain d1f3xh2: 1f3x H:12-115,H:218-395 [64980]
      Other proteins in same PDB: d1f3xa1, d1f3xa3, d1f3xb1, d1f3xb3, d1f3xc1, d1f3xc3, d1f3xd1, d1f3xd3, d1f3xe1, d1f3xe3, d1f3xf1, d1f3xf3, d1f3xg1, d1f3xg3, d1f3xh1, d1f3xh3
      complexed with k, mn, pyr; mutant
  6. Domain(s) for 1pkn:
  7. Domain(s) for 2g50:
    1. 2088073Domain d2g50a2: 2g50 A:12-115,A:218-395 [134619]
      Other proteins in same PDB: d2g50a1, d2g50a3, d2g50b1, d2g50b3, d2g50c1, d2g50c3, d2g50d1, d2g50d3, d2g50e1, d2g50e3, d2g50f1, d2g50f3, d2g50g1, d2g50g3, d2g50h1, d2g50h3
      automatically matched to d1a49a2
      complexed with ala, edo, ete, gol, k, mn, na, pyr
    2. 2088074Domain d2g50b2: 2g50 B:12-115,B:218-395 [134622]
      Other proteins in same PDB: d2g50a1, d2g50a3, d2g50b1, d2g50b3, d2g50c1, d2g50c3, d2g50d1, d2g50d3, d2g50e1, d2g50e3, d2g50f1, d2g50f3, d2g50g1, d2g50g3, d2g50h1, d2g50h3
      automatically matched to d1a49a2
      complexed with ala, edo, ete, gol, k, mn, na, pyr
    3. 2088075Domain d2g50c2: 2g50 C:12-115,C:218-395 [134625]
      Other proteins in same PDB: d2g50a1, d2g50a3, d2g50b1, d2g50b3, d2g50c1, d2g50c3, d2g50d1, d2g50d3, d2g50e1, d2g50e3, d2g50f1, d2g50f3, d2g50g1, d2g50g3, d2g50h1, d2g50h3
      automatically matched to d1a49a2
      complexed with ala, edo, ete, gol, k, mn, na, pyr
    4. 2088076Domain d2g50d2: 2g50 D:12-115,D:218-395 [134628]
      Other proteins in same PDB: d2g50a1, d2g50a3, d2g50b1, d2g50b3, d2g50c1, d2g50c3, d2g50d1, d2g50d3, d2g50e1, d2g50e3, d2g50f1, d2g50f3, d2g50g1, d2g50g3, d2g50h1, d2g50h3
      automatically matched to d1a49a2
      complexed with ala, edo, ete, gol, k, mn, na, pyr
    5. 2088077Domain d2g50e2: 2g50 E:12-115,E:218-395 [134631]
      Other proteins in same PDB: d2g50a1, d2g50a3, d2g50b1, d2g50b3, d2g50c1, d2g50c3, d2g50d1, d2g50d3, d2g50e1, d2g50e3, d2g50f1, d2g50f3, d2g50g1, d2g50g3, d2g50h1, d2g50h3
      automatically matched to d1a49a2
      complexed with ala, edo, ete, gol, k, mn, na, pyr
    6. 2088078Domain d2g50f2: 2g50 F:12-115,F:218-395 [134634]
      Other proteins in same PDB: d2g50a1, d2g50a3, d2g50b1, d2g50b3, d2g50c1, d2g50c3, d2g50d1, d2g50d3, d2g50e1, d2g50e3, d2g50f1, d2g50f3, d2g50g1, d2g50g3, d2g50h1, d2g50h3
      automatically matched to d1a49a2
      complexed with ala, edo, ete, gol, k, mn, na, pyr
    7. 2088079Domain d2g50g2: 2g50 G:12-115,G:218-395 [134637]
      Other proteins in same PDB: d2g50a1, d2g50a3, d2g50b1, d2g50b3, d2g50c1, d2g50c3, d2g50d1, d2g50d3, d2g50e1, d2g50e3, d2g50f1, d2g50f3, d2g50g1, d2g50g3, d2g50h1, d2g50h3
      automatically matched to d1a49a2
      complexed with ala, edo, ete, gol, k, mn, na, pyr
    8. 2088080Domain d2g50h2: 2g50 H:12-115,H:218-395 [134640]
      Other proteins in same PDB: d2g50a1, d2g50a3, d2g50b1, d2g50b3, d2g50c1, d2g50c3, d2g50d1, d2g50d3, d2g50e1, d2g50e3, d2g50f1, d2g50f3, d2g50g1, d2g50g3, d2g50h1, d2g50h3
      automatically matched to d1a49a2
      complexed with ala, edo, ete, gol, k, mn, na, pyr

More info for Species Rabbit (Oryctolagus cuniculus) [TaxId:9986] from c.1.12.1 Pyruvate kinase, N-terminal domain

Timeline for Species Rabbit (Oryctolagus cuniculus) [TaxId:9986] from c.1.12.1 Pyruvate kinase, N-terminal domain: