Lineage for Protein: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 218896Class b: All beta proteins [48724] (119 folds)
  3. 231263Fold b.49: Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like [50614] (2 superfamilies)
    barrel, closed; n=6, S=8; greek-key
  4. 231264Superfamily b.49.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase [50615] (1 family) (S)
  5. 231265Family b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase [50616] (1 protein)
  6. 231266Protein N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase [50617] (4 species)
    6 domains form a ring structure which contains a barrel, closed; n=24, S=24(?)

Species:

  1. 231267Bacillus sp., strain ps3 [TaxId:1409] [50620] (1 PDB entry)
  2. 231270Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [50618] (9 PDB entries)
    1. Domains for 1bmf:
      1. 231289Domain d1bmfa2: 1bmf A:24-94 [26446]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff3, d1bmfg_
      2. 231290Domain d1bmfb2: 1bmf B:24-94 [26447]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff3, d1bmfg_
      3. 231291Domain d1bmfc2: 1bmf C:19-94 [26448]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff3, d1bmfg_
      4. 231292Domain d1bmfd2: 1bmf D:9-81 [26449]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff3, d1bmfg_
      5. 231293Domain d1bmfe2: 1bmf E:9-81 [26450]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff3, d1bmfg_
      6. 231294Domain d1bmff2: 1bmf F:9-81 [26451]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff3, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
    2. Domains for 1cow:
      1. 231319Domain d1cowa2: 1cow A:24-94 [26470]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf3, d1cowg_
      2. 231320Domain d1cowb2: 1cow B:24-94 [26471]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf3, d1cowg_
      3. 231321Domain d1cowc2: 1cow C:19-94 [26472]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf3, d1cowg_
      4. 231322Domain d1cowd2: 1cow D:9-81 [26473]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf3, d1cowg_
      5. 231323Domain d1cowe2: 1cow E:9-81 [26474]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf3, d1cowg_
      6. 231324Domain d1cowf2: 1cow F:9-81 [26475]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf3, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
    3. Domains for 1e1q:
      1. 231295Domain d1e1qa2: 1e1q A:24-94 [26458]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf3, d1e1qg_
      2. 231296Domain d1e1qb2: 1e1q B:24-94 [26459]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf3, d1e1qg_
      3. 231297Domain d1e1qc2: 1e1q C:19-94 [26460]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf3, d1e1qg_
      4. 231298Domain d1e1qd2: 1e1q D:9-81 [26461]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf3, d1e1qg_
      5. 231299Domain d1e1qe2: 1e1q E:9-81 [26462]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf3, d1e1qg_
      6. 231300Domain d1e1qf2: 1e1q F:9-81 [26463]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf3, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
    4. Domains for 1e1r:
      1. 231283Domain d1e1ra2: 1e1r A:24-94 [26440]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf3, d1e1rg_
      2. 231284Domain d1e1rb2: 1e1r B:24-94 [26441]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf3, d1e1rg_
      3. 231285Domain d1e1rc2: 1e1r C:19-94 [26442]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf3, d1e1rg_
      4. 231286Domain d1e1rd2: 1e1r D:9-81 [26443]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf3, d1e1rg_
      5. 231287Domain d1e1re2: 1e1r E:9-81 [26444]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf3, d1e1rg_
      6. 231288Domain d1e1rf2: 1e1r F:9-81 [26445]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf3, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
    5. Domains for 1e79:
      1. 231271Domain d1e79a2: 1e79 A:19-94 [26434]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      2. 231272Domain d1e79b2: 1e79 B:19-94 [26435]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      3. 231273Domain d1e79c2: 1e79 C:19-94 [26436]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      4. 231274Domain d1e79d2: 1e79 D:9-81 [26437]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      5. 231275Domain d1e79e2: 1e79 E:9-81 [26438]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      6. 231276Domain d1e79f2: 1e79 F:9-81 [26439]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, cry, glh, mg, so4
    6. Domains for 1efr:
      1. 231307Domain d1efra2: 1efr A:24-94 [26464]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd3, d1efre1, d1efre3, d1efrf1, d1efrf3, d1efrg_
      2. 231308Domain d1efrb2: 1efr B:24-94 [26465]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd3, d1efre1, d1efre3, d1efrf1, d1efrf3, d1efrg_
      3. 231309Domain d1efrc2: 1efr C:19-94 [26466]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd3, d1efre1, d1efre3, d1efrf1, d1efrf3, d1efrg_
      4. 231310Domain d1efrd2: 1efr D:9-81 [26467]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd3, d1efre1, d1efre3, d1efrf1, d1efrf3, d1efrg_
      5. 231311Domain d1efre2: 1efr E:9-81 [26468]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd3, d1efre1, d1efre3, d1efrf1, d1efrf3, d1efrg_
      6. 231312Domain d1efrf2: 1efr F:9-81 [26469]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd3, d1efre1, d1efre3, d1efrf1, d1efrf3, d1efrg_
        complexed with adp, anp, app, bal, cpi, mg, tlx
    7. Domains for 1h8e:
      1. 231277Domain d1h8ea2: 1h8e A:19-94 [60739]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      2. 231278Domain d1h8eb2: 1h8e B:24-94 [60742]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      3. 231279Domain d1h8ec2: 1h8e C:19-94 [60745]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      4. 231280Domain d1h8ed2: 1h8e D:9-81 [60748]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      5. 231281Domain d1h8ee2: 1h8e E:9-81 [60751]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      6. 231282Domain d1h8ef2: 1h8e F:9-81 [60754]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
    8. Domains for 1h8h:
      1. 231313Domain d1h8ha2: 1h8h A:24-94 [60760]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf3, d1h8hg_
      2. 231314Domain d1h8hb2: 1h8h B:24-94 [60763]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf3, d1h8hg_
      3. 231315Domain d1h8hc2: 1h8h C:19-94 [60766]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf3, d1h8hg_
      4. 231316Domain d1h8hd2: 1h8h D:9-81 [60769]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf3, d1h8hg_
      5. 231317Domain d1h8he2: 1h8h E:9-81 [60772]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf3, d1h8hg_
      6. 231318Domain d1h8hf2: 1h8h F:9-81 [60775]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf3, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
    9. Domains for 1nbm:
      1. 231301Domain d1nbma2: 1nbm A:24-94 [26452]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf3, d1nbmg_
      2. 231302Domain d1nbmb2: 1nbm B:24-94 [26453]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf3, d1nbmg_
      3. 231303Domain d1nbmc2: 1nbm C:19-94 [26454]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf3, d1nbmg_
      4. 231304Domain d1nbmd2: 1nbm D:9-81 [26455]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf3, d1nbmg_
      5. 231305Domain d1nbme2: 1nbm E:9-81 [26456]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf3, d1nbmg_
      6. 231306Domain d1nbmf2: 1nbm F:9-81 [26457]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf3, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4, tyn
  3. 231325Rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [50619] (1 PDB entry)
  4. 231328Spinach (Spinacia oleracea), chloroplast [TaxId:3562] [63793] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1fx0:
      1. 231329Domain d1fx0a2: 1fx0 A:25-96 [60081]
        Other proteins in same PDB: d1fx0a1, d1fx0a3, d1fx0b1, d1fx0b3
      2. 231330Domain d1fx0b2: 1fx0 B:19-97 [60084]
        Other proteins in same PDB: d1fx0a1, d1fx0a3, d1fx0b1, d1fx0b3
    2. Domains for 1kmh:
      1. 231331Domain d1kmha2: 1kmh A:25-96 [72746]
        Other proteins in same PDB: d1kmha1, d1kmha3, d1kmhb1, d1kmhb3
      2. 231332Domain d1kmhb2: 1kmh B:19-97 [72749]
        Other proteins in same PDB: d1kmha1, d1kmha3, d1kmhb1, d1kmhb3
        complexed with ttx

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  • Protein N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase from b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
  • Protein N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase from b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase appears in SCOP 1.61
  • Protein N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase from b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase does not appear in SCOP 1.65