SCOP 1.73: Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

Root: SCOP 1.73
Class a: All alpha proteins [46456] (258 folds)
Fold a.140: LEM/SAP HeH motif [63450] (5 superfamilies)
helix-extended loop-helix; parallel helices
Superfamily a.140.3: Rho termination factor, N-terminal domain [68912] (1 family)
Family a.140.3.1: Rho termination factor, N-terminal domain [68913] (1 protein)
Protein Rho termination factor, N-terminal domain [68914] (1 species)
Species Escherichia coli [TaxId:562] [50295] (9 PDB entries)

PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:

Domain(s) for 1a62:
- Domain d1a62a1: 1a62 A:1-47 [64708]
  Other proteins in same PDB: d1a62a2
Domain(s) for 1a63:
- Domain d1a63a1: 1a63 A:1-47 [64710]
  Other proteins in same PDB: d1a63a2
Domain(s) for 1a8v:
1. Domain d1a8va1: 1a8v A:-1-47 [64712]
  Other proteins in same PDB: d1a8va2, d1a8vb2
2. Domain d1a8vb1: 1a8v B:-1-47 [64714]
  Other proteins in same PDB: d1a8va2, d1a8vb2
  complexed with cu
Domain(s) for 1pv4:
1. Domain d1pv4a1: 1pv4 A:1-47 [88295]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
2. Domain d1pv4c1: 1pv4 C:1-47 [88300]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
3. Domain d1pv4d1: 1pv4 D:1-47 [88303]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
4. Domain d1pv4e1: 1pv4 E:1-47 [88306]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
5. Domain d1pv4f1: 1pv4 F:1-47 [88309]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
  complexed with mse
Domain(s) for 1pvo:
1. Domain d1pvoa1: 1pvo A:1-47 [88316]
  Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
2. Domain d1pvoc1: 1pvo C:1-47 [88321]
  Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
3. Domain d1pvod1: 1pvo D:1-47 [88324]
  Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
4. Domain d1pvoe1: 1pvo E:1-47 [88327]
  Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
5. Domain d1pvof1: 1pvo F:1-47 [88330]
  Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
  complexed with anp

Domain(s) for 1xpo:

Domain d1xpoa1: 1xpo A:1-47 [122212]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpob1: 1xpo B:1-47 [122215]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpoc1: 1xpo C:1-47 [122218]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpod1: 1xpo D:1-47 [122221]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpoe1: 1xpo E:1-47 [122224]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpof1: 1xpo F:1-47 [122227]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
complexed with ags, bcm, mg

Domain(s) for 1xpr:
1. Domain d1xpra1: 1xpr A:1-47 [115772]
  Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
2. Domain d1xprb1: 1xpr B:1-47 [115775]
  Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
3. Domain d1xprc1: 1xpr C:1-47 [115778]
  Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
4. Domain d1xprd1: 1xpr D:1-47 [115781]
  Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
5. Domain d1xpre1: 1xpr E:1-47 [115784]
  Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
6. Domain d1xprf1: 1xpr F:1-47 [115787]
  Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
  complexed with ags, fb, mg
Domain(s) for 1xpu:
1. Domain d1xpua1: 1xpu A:1-47 [115790]
  Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
2. Domain d1xpub1: 1xpu B:1-47 [115793]
  Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
3. Domain d1xpuc1: 1xpu C:1-47 [115796]
  Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
4. Domain d1xpud1: 1xpu D:1-47 [115799]
  Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
5. Domain d1xpue1: 1xpu E:1-47 [115802]
  Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
6. Domain d1xpuf1: 1xpu F:1-47 [115805]
  Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
  complexed with ags, fpd, mg
Domain(s) for 2a8v:
1. Domain d2a8va1: 2a8v A:1-47 [64752]
  Other proteins in same PDB: d2a8va2, d2a8vb2, d2a8vc2
2. Domain d2a8vb1: 2a8v B:1-47 [64754]
  Other proteins in same PDB: d2a8va2, d2a8vb2, d2a8vc2
3. Domain d2a8vc1: 2a8v C:1-47 [64756]
  Other proteins in same PDB: d2a8va2, d2a8vb2, d2a8vc2
  protein/RNA complex

More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.140.3.1 Rho termination factor, N-terminal domain

Timeline for Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.140.3.1 Rho termination factor, N-terminal domain:

Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.140.3.1 Rho termination factor, N-terminal domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55, called Species Escherichia coli [TaxId:562] from b.40.4.5 Rho termination factor, N-terminal, RNA-binding domain
Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.140.3.1 Rho termination factor, N-terminal domain appears in SCOP 1.71
Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.140.3.1 Rho termination factor, N-terminal domain appears in SCOP 1.75
Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.140.3.1 Rho termination factor, N-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08