SCOPe 2.08: Protein: DNA helicase RuvA subunit, N-terminal domain

Lineage for Protein: DNA helicase RuvA subunit, N-terminal domain

Root: SCOPe 2.08
Class b: All beta proteins [48724] (180 folds)
Fold b.40: OB-fold [50198] (17 superfamilies)
barrel, closed or partly opened n=5, S=10 or S=8; greek-key
Superfamily b.40.4: Nucleic acid-binding proteins [50249] (18 families)
Family b.40.4.2: DNA helicase RuvA subunit, N-terminal domain [50259] (1 protein)
barrel, closed; n=5, S=10
automatically mapped to Pfam PF01330
Protein DNA helicase RuvA subunit, N-terminal domain [50260] (3 species)
tetramer; binds Holliday junction

Species:

Escherichia coli [TaxId:562] [50261] (5 PDB entries)
1. Domains for 1bdx:
  1. Domain d1bdxa3: 1bdx A:1-64 [25270]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa1, d1bdxa2, d1bdxb1, d1bdxb2, d1bdxc1, d1bdxc2, d1bdxd1, d1bdxd2
    protein/DNA complex
  2. Domain d1bdxb3: 1bdx B:1-64 [25271]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa1, d1bdxa2, d1bdxb1, d1bdxb2, d1bdxc1, d1bdxc2, d1bdxd1, d1bdxd2
    protein/DNA complex
  3. Domain d1bdxc3: 1bdx C:1-64 [25272]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa1, d1bdxa2, d1bdxb1, d1bdxb2, d1bdxc1, d1bdxc2, d1bdxd1, d1bdxd2
    protein/DNA complex
  4. Domain d1bdxd3: 1bdx D:1-64 [25273]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa1, d1bdxa2, d1bdxb1, d1bdxb2, d1bdxc1, d1bdxc2, d1bdxd1, d1bdxd2
    protein/DNA complex
2. Domain for 1c7y:
  - Domain d1c7ya3: 1c7y A:1-64 [25269]
    Other proteins in same PDB: d1c7ya1, d1c7ya2
    protein/DNA complex
3. Domain for 1cuk:
  - Domain d1cuka3: 1cuk A:1-64 [25265]
    Other proteins in same PDB: d1cuka1, d1cuka2
4. Domains for 1d8l:
  1. Domain d1d8la2: 1d8l A:1-64 [25267]
    Other proteins in same PDB: d1d8la1, d1d8lb1
  2. Domain d1d8lb2: 1d8l B:1-64 [25268]
    Other proteins in same PDB: d1d8la1, d1d8lb1
5. Domain for 1hjp:
  - Domain d1hjpa3: 1hjp A:1-64 [25266]
    Other proteins in same PDB: d1hjpa1, d1hjpa2

Mycobacterium leprae [TaxId:1769] [50262] (1 PDB entry)

Domains for 1bvs:

Domain d1bvsa3: 1bvs A:1-63 [25274]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa2, d1bvsb1, d1bvsb2, d1bvsc1, d1bvsc2, d1bvsd1, d1bvsd2, d1bvse1, d1bvse2, d1bvsf1, d1bvsf2, d1bvsg1, d1bvsg2, d1bvsh1, d1bvsh2
protein/DNA complex

Domain d1bvsb3: 1bvs B:1-63 [25275]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa2, d1bvsb1, d1bvsb2, d1bvsc1, d1bvsc2, d1bvsd1, d1bvsd2, d1bvse1, d1bvse2, d1bvsf1, d1bvsf2, d1bvsg1, d1bvsg2, d1bvsh1, d1bvsh2
protein/DNA complex

Domain d1bvsc3: 1bvs C:1-63 [25276]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa2, d1bvsb1, d1bvsb2, d1bvsc1, d1bvsc2, d1bvsd1, d1bvsd2, d1bvse1, d1bvse2, d1bvsf1, d1bvsf2, d1bvsg1, d1bvsg2, d1bvsh1, d1bvsh2
protein/DNA complex

Domain d1bvsd3: 1bvs D:1-63 [25277]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa2, d1bvsb1, d1bvsb2, d1bvsc1, d1bvsc2, d1bvsd1, d1bvsd2, d1bvse1, d1bvse2, d1bvsf1, d1bvsf2, d1bvsg1, d1bvsg2, d1bvsh1, d1bvsh2
protein/DNA complex

Domain d1bvse3: 1bvs E:1-63 [25278]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa2, d1bvsb1, d1bvsb2, d1bvsc1, d1bvsc2, d1bvsd1, d1bvsd2, d1bvse1, d1bvse2, d1bvsf1, d1bvsf2, d1bvsg1, d1bvsg2, d1bvsh1, d1bvsh2
protein/DNA complex

Domain d1bvsf3: 1bvs F:1-63 [25279]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa2, d1bvsb1, d1bvsb2, d1bvsc1, d1bvsc2, d1bvsd1, d1bvsd2, d1bvse1, d1bvse2, d1bvsf1, d1bvsf2, d1bvsg1, d1bvsg2, d1bvsh1, d1bvsh2
protein/DNA complex

Domain d1bvsg3: 1bvs G:1-63 [25280]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa2, d1bvsb1, d1bvsb2, d1bvsc1, d1bvsc2, d1bvsd1, d1bvsd2, d1bvse1, d1bvse2, d1bvsf1, d1bvsf2, d1bvsg1, d1bvsg2, d1bvsh1, d1bvsh2
protein/DNA complex

Domain d1bvsh3: 1bvs H:1-63 [25281]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa2, d1bvsb1, d1bvsb2, d1bvsc1, d1bvsc2, d1bvsd1, d1bvsd2, d1bvse1, d1bvse2, d1bvsf1, d1bvsf2, d1bvsg1, d1bvsg2, d1bvsh1, d1bvsh2
protein/DNA complex

Thermus thermophilus [TaxId:274] [82098] (1 PDB entry)
- Domains for 1ixr:
  1. Domain d1ixra2: 1ixr A:1-62 [76926]
    Other proteins in same PDB: d1ixra1, d1ixrb1, d1ixrb2, d1ixrc1, d1ixrc2
    complexed with anp
  2. Domain d1ixrb3: 1ixr B:1-62 [76929]
    Other proteins in same PDB: d1ixra1, d1ixrb1, d1ixrb2, d1ixrc1, d1ixrc2
    complexed with anp

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Protein DNA helicase RuvA subunit, N-terminal domain from b.40.4.2: DNA helicase RuvA subunit, N-terminal domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein DNA helicase RuvA subunit, N-terminal domain from b.40.4.2: DNA helicase RuvA subunit, N-terminal domain appears in SCOPe 2.07