Lineage for Protein: D1 core SNRNP protein

  1. Root: SCOPe 2.04
  2. 1510239Class b: All beta proteins [48724] (176 folds)
  3. 1539176Fold b.38: Sm-like fold [50181] (5 superfamilies)
    core: barrel, open; n*=4, S*=8; meander; SH3-like topology
  4. 1539177Superfamily b.38.1: Sm-like ribonucleoproteins [50182] (7 families) (S)
  5. 1539178Family b.38.1.1: Sm motif of small nuclear ribonucleoproteins, SNRNP [50183] (8 proteins)
    forms homo and heteroheptameric ring structures
  6. 1539356Protein D1 core SNRNP protein [50184] (2 species)

Species:

  1. 1539357Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [50185] (5 PDB entries)
    1. Domain for 1b34:
    2. Domains for 1vu2:
      1. 1539360Domain d1vu2a_: 1vu2 A: [240850]
        Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      2. 1539361Domain d1vu2g_: 1vu2 g: [240854]
        Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      3. 1539362Domain d1vu2i_: 1vu2 I: [240856]
        Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      4. 1539363Domain d1vu2o_: 1vu2 o: [240860]
        Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      5. 1539364Domain d1vu2q_: 1vu2 Q: [240862]
        Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      6. 1539365Domain d1vu2w_: 1vu2 w: [240866]
        Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      7. 1539366Domain d1vu2y_: 1vu2 Y: [240868]
        Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
    3. Domains for 1vu3:
      1. 1539374Domain d1vu3a_: 1vu3 A: [240870]
        Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      2. 1539375Domain d1vu3g_: 1vu3 g: [240874]
        Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      3. 1539376Domain d1vu3i_: 1vu3 I: [240876]
        Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      4. 1539377Domain d1vu3o_: 1vu3 o: [240880]
        Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      5. 1539378Domain d1vu3q_: 1vu3 Q: [240882]
        Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      6. 1539379Domain d1vu3y_: 1vu3 Y: [240887]
        Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
    4. Domain for 3s6n:
    5. Domains for 4f77:
      1. 1539367Domain d4f77a_: 4f77 A: [251904]
        Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      2. 1539368Domain d4f77g_: 4f77 g: [251908]
        Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      3. 1539369Domain d4f77i_: 4f77 I: [251910]
        Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      4. 1539370Domain d4f77o_: 4f77 o: [251914]
        Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      5. 1539371Domain d4f77q_: 4f77 Q: [251916]
        Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      6. 1539372Domain d4f77w_: 4f77 w: [251920]
        Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
      7. 1539373Domain d4f77y_: 4f77 Y: [251922]
        Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
        automated match to d4f7ua_
        complexed with so4
  2. 1539380Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] [224861] (1 PDB entry)

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