Lineage for Protein: Cytochrome c oxidase

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 651986Class b: All beta proteins [48724] (165 folds)
  3. 660498Fold b.6: Cupredoxin-like [49502] (2 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets, greek-key
    variations: some members have additional 1-2 strands
  4. 660499Superfamily b.6.1: Cupredoxins [49503] (7 families) (S)
    contains copper-binding site
  5. 660834Family b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II [49541] (2 proteins)
  6. 660835Protein Cytochrome c oxidase [49544] (4 species)

Species:

  1. 660836Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [49545] (14 PDB entries)
    1. Domains for 1occ:
      1. 660857Domain d1occb1: 1occ B:91-227 [23031]
        Other proteins in same PDB: d1occa_, d1occb2, d1occc_, d1occd_, d1occe_, d1occf_, d1occg_, d1occh_, d1occi_, d1occj_, d1occk_, d1occl_, d1occm_, d1occn_, d1occo2, d1occp_, d1occq_, d1occr_, d1occs_, d1occt_, d1occu_, d1occv_, d1occw_, d1occx_, d1occy_, d1occz_
      2. 660858Domain d1occo1: 1occ O:91-227 [23032]
        Other proteins in same PDB: d1occa_, d1occb2, d1occc_, d1occd_, d1occe_, d1occf_, d1occg_, d1occh_, d1occi_, d1occj_, d1occk_, d1occl_, d1occm_, d1occn_, d1occo2, d1occp_, d1occq_, d1occr_, d1occs_, d1occt_, d1occu_, d1occv_, d1occw_, d1occx_, d1occy_, d1occz_
        complexed with cu, hea, mg, zn
    2. Domains for 1oco:
      1. 660863Domain d1ocob1: 1oco B:91-227 [23035]
        Other proteins in same PDB: d1ocoa_, d1ocob2, d1ococ_, d1ocod_, d1ocoe_, d1ocof_, d1ocog_, d1ocoh_, d1ocoi_, d1ocoj_, d1ocok_, d1ocol_, d1ocom_, d1ocon_, d1ocoo2, d1ocop_, d1ocoq_, d1ocor_, d1ocos_, d1ocot_, d1ocou_, d1ocov_, d1ocow_, d1ocox_, d1ocoy_, d1ocoz_
      2. 660864Domain d1ocoo1: 1oco O:91-227 [23036]
        Other proteins in same PDB: d1ocoa_, d1ocob2, d1ococ_, d1ocod_, d1ocoe_, d1ocof_, d1ocog_, d1ocoh_, d1ocoi_, d1ocoj_, d1ocok_, d1ocol_, d1ocom_, d1ocon_, d1ocoo2, d1ocop_, d1ocoq_, d1ocor_, d1ocos_, d1ocot_, d1ocou_, d1ocov_, d1ocow_, d1ocox_, d1ocoy_, d1ocoz_
        complexed with cmo, cu, hea, mg, na, zn
    3. Domains for 1ocr:
      1. 660851Domain d1ocrb1: 1ocr B:91-227 [23029]
        Other proteins in same PDB: d1ocra_, d1ocrb2, d1ocrc_, d1ocrd_, d1ocre_, d1ocrf_, d1ocrg_, d1ocrh_, d1ocri_, d1ocrj_, d1ocrk_, d1ocrl_, d1ocrm_, d1ocrn_, d1ocro2, d1ocrp_, d1ocrq_, d1ocrr_, d1ocrs_, d1ocrt_, d1ocru_, d1ocrv_, d1ocrw_, d1ocrx_, d1ocry_, d1ocrz_
      2. 660852Domain d1ocro1: 1ocr O:91-227 [23030]
        Other proteins in same PDB: d1ocra_, d1ocrb2, d1ocrc_, d1ocrd_, d1ocre_, d1ocrf_, d1ocrg_, d1ocrh_, d1ocri_, d1ocrj_, d1ocrk_, d1ocrl_, d1ocrm_, d1ocrn_, d1ocro2, d1ocrp_, d1ocrq_, d1ocrr_, d1ocrs_, d1ocrt_, d1ocru_, d1ocrv_, d1ocrw_, d1ocrx_, d1ocry_, d1ocrz_
        complexed with cu, hea, mg, na, zn
    4. Domains for 1ocz:
      1. 660861Domain d1oczb1: 1ocz B:91-227 [23033]
        Other proteins in same PDB: d1ocza_, d1oczb2, d1oczc_, d1oczd_, d1ocze_, d1oczf_, d1oczg_, d1oczh_, d1oczi_, d1oczj_, d1oczk_, d1oczl_, d1oczm_, d1oczn_, d1oczo2, d1oczp_, d1oczq_, d1oczr_, d1oczs_, d1oczt_, d1oczu_, d1oczv_, d1oczw_, d1oczx_, d1oczy_, d1oczz_
      2. 660862Domain d1oczo1: 1ocz O:91-227 [23034]
        Other proteins in same PDB: d1ocza_, d1oczb2, d1oczc_, d1oczd_, d1ocze_, d1oczf_, d1oczg_, d1oczh_, d1oczi_, d1oczj_, d1oczk_, d1oczl_, d1oczm_, d1oczn_, d1oczo2, d1oczp_, d1oczq_, d1oczr_, d1oczs_, d1oczt_, d1oczu_, d1oczv_, d1oczw_, d1oczx_, d1oczy_, d1oczz_
        complexed with azi, cu, hea, mg, na, zn
    5. Domains for 1v54:
      1. 660837Domain d1v54b1: 1v54 B:91-227 [100322]
        Other proteins in same PDB: d1v54a_, d1v54b2, d1v54c_, d1v54d_, d1v54e_, d1v54f_, d1v54g_, d1v54h_, d1v54i_, d1v54j_, d1v54k_, d1v54l_, d1v54m_, d1v54n_, d1v54o2, d1v54p_, d1v54q_, d1v54r_, d1v54s_, d1v54t_, d1v54u_, d1v54v_, d1v54w_, d1v54x_, d1v54y_, d1v54z_
      2. 660838Domain d1v54o1: 1v54 O:91-227 [100336]
        Other proteins in same PDB: d1v54a_, d1v54b2, d1v54c_, d1v54d_, d1v54e_, d1v54f_, d1v54g_, d1v54h_, d1v54i_, d1v54j_, d1v54k_, d1v54l_, d1v54m_, d1v54n_, d1v54o2, d1v54p_, d1v54q_, d1v54r_, d1v54s_, d1v54t_, d1v54u_, d1v54v_, d1v54w_, d1v54x_, d1v54y_, d1v54z_
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn
    6. Domains for 1v55:
      1. 660841Domain d1v55b1: 1v55 B:91-227 [100350]
        Other proteins in same PDB: d1v55a_, d1v55b2, d1v55c_, d1v55d_, d1v55e_, d1v55f_, d1v55g_, d1v55h_, d1v55i_, d1v55j_, d1v55k_, d1v55l_, d1v55m_, d1v55n_, d1v55o2, d1v55p_, d1v55q_, d1v55r_, d1v55s_, d1v55t_, d1v55u_, d1v55v_, d1v55w_, d1v55x_, d1v55y_, d1v55z_
      2. 660842Domain d1v55o1: 1v55 O:91-227 [100364]
        Other proteins in same PDB: d1v55a_, d1v55b2, d1v55c_, d1v55d_, d1v55e_, d1v55f_, d1v55g_, d1v55h_, d1v55i_, d1v55j_, d1v55k_, d1v55l_, d1v55m_, d1v55n_, d1v55o2, d1v55p_, d1v55q_, d1v55r_, d1v55s_, d1v55t_, d1v55u_, d1v55v_, d1v55w_, d1v55x_, d1v55y_, d1v55z_
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn
    7. Domains for 2dyr:
      1. 660839Domain d2dyrb1: 2dyr B:91-227 [131900]
        Other proteins in same PDB: d2dyra1, d2dyrb2, d2dyrc1, d2dyrd1, d2dyre1, d2dyrf1, d2dyrg1, d2dyrh1, d2dyri1, d2dyrj1, d2dyrk1, d2dyrl1, d2dyrm1, d2dyrn1, d2dyro2, d2dyrp1, d2dyrq1, d2dyrr1, d2dyrs1, d2dyrt1, d2dyru1, d2dyrv1, d2dyrw1, d2dyrx1, d2dyry1, d2dyrz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn
      2. 660840Domain d2dyro1: 2dyr O:91-227 [131914]
        Other proteins in same PDB: d2dyra1, d2dyrb2, d2dyrc1, d2dyrd1, d2dyre1, d2dyrf1, d2dyrg1, d2dyrh1, d2dyri1, d2dyrj1, d2dyrk1, d2dyrl1, d2dyrm1, d2dyrn1, d2dyro2, d2dyrp1, d2dyrq1, d2dyrr1, d2dyrs1, d2dyrt1, d2dyru1, d2dyrv1, d2dyrw1, d2dyrx1, d2dyry1, d2dyrz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn
    8. Domains for 2dys:
      1. 660849Domain d2dysb1: 2dys B:91-227 [131928]
        Other proteins in same PDB: d2dysa1, d2dysb2, d2dysc1, d2dysd1, d2dyse1, d2dysf1, d2dysg1, d2dysh1, d2dysi1, d2dysj1, d2dysk1, d2dysl1, d2dysm1, d2dysn1, d2dyso2, d2dysp1, d2dysq1, d2dysr1, d2dyss1, d2dyst1, d2dysu1, d2dysv1, d2dysw1, d2dysx1, d2dysy1, d2dysz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, glh, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn
      2. 660850Domain d2dyso1: 2dys O:91-227 [131942]
        Other proteins in same PDB: d2dysa1, d2dysb2, d2dysc1, d2dysd1, d2dyse1, d2dysf1, d2dysg1, d2dysh1, d2dysi1, d2dysj1, d2dysk1, d2dysl1, d2dysm1, d2dysn1, d2dyso2, d2dysp1, d2dysq1, d2dysr1, d2dyss1, d2dyst1, d2dysu1, d2dysv1, d2dysw1, d2dysx1, d2dysy1, d2dysz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, glh, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn
    9. Domains for 2eij:
      1. 660843Domain d2eijb1: 2eij B:91-227 [132140]
        Other proteins in same PDB: d2eija1, d2eijb2, d2eijc1, d2eijd1, d2eije1, d2eijf1, d2eijg1, d2eijh1, d2eiji1, d2eijj1, d2eijk1, d2eijl1, d2eijm1, d2eijn1, d2eijo2, d2eijp1, d2eijq1, d2eijr1, d2eijs1, d2eijt1, d2eiju1, d2eijv1, d2eijw1, d2eijx1, d2eijy1, d2eijz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
      2. 660844Domain d2eijo1: 2eij O:91-227 [132154]
        Other proteins in same PDB: d2eija1, d2eijb2, d2eijc1, d2eijd1, d2eije1, d2eijf1, d2eijg1, d2eijh1, d2eiji1, d2eijj1, d2eijk1, d2eijl1, d2eijm1, d2eijn1, d2eijo2, d2eijp1, d2eijq1, d2eijr1, d2eijs1, d2eijt1, d2eiju1, d2eijv1, d2eijw1, d2eijx1, d2eijy1, d2eijz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
    10. Domains for 2eik:
      1. 660847Domain d2eikb1: 2eik B:91-227 [132168]
        Other proteins in same PDB: d2eika1, d2eikb2, d2eikc1, d2eikd1, d2eike1, d2eikf1, d2eikg1, d2eikh1, d2eiki1, d2eikj1, d2eikk1, d2eikl1, d2eikm1, d2eikn1, d2eiko2, d2eikp1, d2eikq1, d2eikr1, d2eiks1, d2eikt1, d2eiku1, d2eikv1, d2eikw1, d2eikx1, d2eiky1, d2eikz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cd, cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
      2. 660848Domain d2eiko1: 2eik O:91-227 [132182]
        Other proteins in same PDB: d2eika1, d2eikb2, d2eikc1, d2eikd1, d2eike1, d2eikf1, d2eikg1, d2eikh1, d2eiki1, d2eikj1, d2eikk1, d2eikl1, d2eikm1, d2eikn1, d2eiko2, d2eikp1, d2eikq1, d2eikr1, d2eiks1, d2eikt1, d2eiku1, d2eikv1, d2eikw1, d2eikx1, d2eiky1, d2eikz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cd, cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
    11. Domains for 2eil:
      1. 660845Domain d2eilb1: 2eil B:91-227 [132196]
        Other proteins in same PDB: d2eila1, d2eilb2, d2eilc1, d2eild1, d2eile1, d2eilf1, d2eilg1, d2eilh1, d2eili1, d2eilj1, d2eilk1, d2eill1, d2eilm1, d2eiln1, d2eilo2, d2eilp1, d2eilq1, d2eilr1, d2eils1, d2eilt1, d2eilu1, d2eilv1, d2eilw1, d2eilx1, d2eily1, d2eilz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cd, cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
      2. 660846Domain d2eilo1: 2eil O:91-227 [132210]
        Other proteins in same PDB: d2eila1, d2eilb2, d2eilc1, d2eild1, d2eile1, d2eilf1, d2eilg1, d2eilh1, d2eili1, d2eilj1, d2eilk1, d2eill1, d2eilm1, d2eiln1, d2eilo2, d2eilp1, d2eilq1, d2eilr1, d2eils1, d2eilt1, d2eilu1, d2eilv1, d2eilw1, d2eilx1, d2eily1, d2eilz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cd, cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
    12. Domains for 2eim:
      1. 660855Domain d2eimb1: 2eim B:91-227 [132224]
        Other proteins in same PDB: d2eima1, d2eimb2, d2eimc1, d2eimd1, d2eime1, d2eimf1, d2eimg1, d2eimh1, d2eimi1, d2eimj1, d2eimk1, d2eiml1, d2eimm1, d2eimn1, d2eimo2, d2eimp1, d2eimq1, d2eimr1, d2eims1, d2eimt1, d2eimu1, d2eimv1, d2eimw1, d2eimx1, d2eimy1, d2eimz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
      2. 660856Domain d2eimo1: 2eim O:91-227 [132238]
        Other proteins in same PDB: d2eima1, d2eimb2, d2eimc1, d2eimd1, d2eime1, d2eimf1, d2eimg1, d2eimh1, d2eimi1, d2eimj1, d2eimk1, d2eiml1, d2eimm1, d2eimn1, d2eimo2, d2eimp1, d2eimq1, d2eimr1, d2eims1, d2eimt1, d2eimu1, d2eimv1, d2eimw1, d2eimx1, d2eimy1, d2eimz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
    13. Domains for 2ein:
      1. 660859Domain d2einb1: 2ein B:91-227 [132252]
        Other proteins in same PDB: d2eina1, d2einb2, d2einc1, d2eind1, d2eine1, d2einf1, d2eing1, d2einh1, d2eini1, d2einj1, d2eink1, d2einl1, d2einm1, d2einn1, d2eino2, d2einp1, d2einq1, d2einr1, d2eins1, d2eint1, d2einu1, d2einv1, d2einw1, d2einx1, d2einy1, d2einz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
      2. 660860Domain d2eino1: 2ein O:91-227 [132266]
        Other proteins in same PDB: d2eina1, d2einb2, d2einc1, d2eind1, d2eine1, d2einf1, d2eing1, d2einh1, d2eini1, d2einj1, d2eink1, d2einl1, d2einm1, d2einn1, d2eino2, d2einp1, d2einq1, d2einr1, d2eins1, d2eint1, d2einu1, d2einv1, d2einw1, d2einx1, d2einy1, d2einz1
        automatically matched to d1occb1
        complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn
    14. Domains for 2occ:
      1. 660853Domain d2occb1: 2occ B:91-227 [23027]
        Other proteins in same PDB: d2occa_, d2occb2, d2occc_, d2occd_, d2occe_, d2occf_, d2occg_, d2occh_, d2occi_, d2occj_, d2occk_, d2occl_, d2occm_, d2occn_, d2occo2, d2occp_, d2occq_, d2occr_, d2occs_, d2occt_, d2occu_, d2occv_, d2occw_, d2occx_, d2occy_, d2occz_
      2. 660854Domain d2occo1: 2occ O:91-227 [23028]
        Other proteins in same PDB: d2occa_, d2occb2, d2occc_, d2occd_, d2occe_, d2occf_, d2occg_, d2occh_, d2occi_, d2occj_, d2occk_, d2occl_, d2occm_, d2occn_, d2occo2, d2occp_, d2occq_, d2occr_, d2occs_, d2occt_, d2occu_, d2occv_, d2occw_, d2occx_, d2occy_, d2occz_
        complexed with cu, hea, mg, na, per, zn
  2. 660865Paracoccus denitrificans [TaxId:266] [49546] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1ar1:
    2. Domain for 1qle:
  3. 660868Rhodobacter sphaeroides [TaxId:1063] [74870] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1m56:
      1. 660871Domain d1m56b1: 1m56 B:130-289 [74472]
        Other proteins in same PDB: d1m56a_, d1m56b2, d1m56c_, d1m56d_, d1m56g_, d1m56h2, d1m56i_, d1m56j_
      2. 660872Domain d1m56h1: 1m56 H:130-289 [74477]
        Other proteins in same PDB: d1m56a_, d1m56b2, d1m56c_, d1m56d_, d1m56g_, d1m56h2, d1m56i_, d1m56j_
        complexed with ca, cu, hea, mg, peh
    2. Domains for 1m57:
      1. 660873Domain d1m57b1: 1m57 B:130-289 [74482]
        Other proteins in same PDB: d1m57a_, d1m57b2, d1m57c_, d1m57d_, d1m57g_, d1m57h2, d1m57i_, d1m57j_
      2. 660874Domain d1m57h1: 1m57 H:130-289 [74487]
        Other proteins in same PDB: d1m57a_, d1m57b2, d1m57c_, d1m57d_, d1m57g_, d1m57h2, d1m57i_, d1m57j_
        complexed with ca, cu, hea, mg, peh; mutant
    3. Domains for 2gsm:
      1. 660869Domain d2gsmb1: 2gsm B:130-281 [135590]
        Other proteins in same PDB: d2gsma1, d2gsmb2, d2gsmc1, d2gsmd2
        automatically matched to d1m56b1
        complexed with ca, cd, cu, dmu, hea, mg, oh, trd
      2. 660870Domain d2gsmd1: 2gsm D:130-281 [135593]
        Other proteins in same PDB: d2gsma1, d2gsmb2, d2gsmc1, d2gsmd2
        automatically matched to d1m56b1
        complexed with ca, cd, cu, dmu, hea, mg, oh, trd
  4. 660875Thermus thermophilus, ba3 type [TaxId:274] [49547] (4 PDB entries)
    1. Domain for 1ehk:
    2. Domain for 1xme:
    3. Domains for 2cua:
      1. 660876Domain d2cuaa_: 2cua A: [23039]
      2. 660877Domain d2cuab_: 2cua B: [23040]
        complexed with cua, zn
    4. Domain for 2fwl:

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