Lineage for Species: Paracoccus denitrificans [TaxId: 266]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 651986Class b: All beta proteins [48724] (165 folds)
  3. 660498Fold b.6: Cupredoxin-like [49502] (2 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets, greek-key
    variations: some members have additional 1-2 strands
  4. 660499Superfamily b.6.1: Cupredoxins [49503] (7 families) (S)
    contains copper-binding site
  5. 660500Family b.6.1.1: Plastocyanin/azurin-like [49504] (9 proteins)
    mono-domain proteins
  6. 660501Protein Amicyanin [49505] (2 species)
  7. 660502Species Paracoccus denitrificans [TaxId:266] [49506] (19 PDB entries)

PDB entries in Species: Paracoccus denitrificans [TaxId: 266]:

  1. Domain(s) for 1aac:
  2. Domain(s) for 1aaj:
  3. Domain(s) for 1aan:
  4. Domain(s) for 1bxa:
  5. Domain(s) for 1mda:
    1. 660543Domain d1mdaa_: 1mda A: [22844]
      Other proteins in same PDB: d1mdah_, d1mdaj_, d1mdal_, d1mdam_
    2. 660544Domain d1mdab_: 1mda B: [22845]
      Other proteins in same PDB: d1mdah_, d1mdaj_, d1mdal_, d1mdam_
      complexed with cu, owq
  6. Domain(s) for 1mg2:
    1. 660535Domain d1mg2c_: 1mg2 C: [79061]
      Other proteins in same PDB: d1mg2a_, d1mg2b_, d1mg2d_, d1mg2e_, d1mg2f_, d1mg2h_, d1mg2i_, d1mg2j_, d1mg2l_, d1mg2m_, d1mg2n_, d1mg2p_
    2. 660536Domain d1mg2g_: 1mg2 G: [79065]
      Other proteins in same PDB: d1mg2a_, d1mg2b_, d1mg2d_, d1mg2e_, d1mg2f_, d1mg2h_, d1mg2i_, d1mg2j_, d1mg2l_, d1mg2m_, d1mg2n_, d1mg2p_
    3. 660537Domain d1mg2k_: 1mg2 K: [79069]
      Other proteins in same PDB: d1mg2a_, d1mg2b_, d1mg2d_, d1mg2e_, d1mg2f_, d1mg2h_, d1mg2i_, d1mg2j_, d1mg2l_, d1mg2m_, d1mg2n_, d1mg2p_
    4. 660538Domain d1mg2o_: 1mg2 O: [79073]
      Other proteins in same PDB: d1mg2a_, d1mg2b_, d1mg2d_, d1mg2e_, d1mg2f_, d1mg2h_, d1mg2i_, d1mg2j_, d1mg2l_, d1mg2m_, d1mg2n_, d1mg2p_
      complexed with cu, hem, na, po4, trq; mutant
  7. Domain(s) for 1mg3:
    1. 660539Domain d1mg3c_: 1mg3 C: [79077]
      Other proteins in same PDB: d1mg3a_, d1mg3b_, d1mg3d_, d1mg3e_, d1mg3f_, d1mg3h_, d1mg3i_, d1mg3j_, d1mg3l_, d1mg3m_, d1mg3n_, d1mg3p_
    2. 660540Domain d1mg3g_: 1mg3 G: [79081]
      Other proteins in same PDB: d1mg3a_, d1mg3b_, d1mg3d_, d1mg3e_, d1mg3f_, d1mg3h_, d1mg3i_, d1mg3j_, d1mg3l_, d1mg3m_, d1mg3n_, d1mg3p_
    3. 660541Domain d1mg3k_: 1mg3 K: [79085]
      Other proteins in same PDB: d1mg3a_, d1mg3b_, d1mg3d_, d1mg3e_, d1mg3f_, d1mg3h_, d1mg3i_, d1mg3j_, d1mg3l_, d1mg3m_, d1mg3n_, d1mg3p_
    4. 660542Domain d1mg3o_: 1mg3 O: [79089]
      Other proteins in same PDB: d1mg3a_, d1mg3b_, d1mg3d_, d1mg3e_, d1mg3f_, d1mg3h_, d1mg3i_, d1mg3j_, d1mg3l_, d1mg3m_, d1mg3n_, d1mg3p_
      complexed with cu, hem, na, po4, trw; mutant
  8. Domain(s) for 1sf3:
  9. Domain(s) for 1sf5:
  10. Domain(s) for 1sfd:
    1. 660503Domain d1sfda_: 1sfd A: [105480]
    2. 660504Domain d1sfdb_: 1sfd B: [105481]
      complexed with cu, so4; mutant
  11. Domain(s) for 1sfh:
    1. 660506Domain d1sfha_: 1sfh A: [105486]
    2. 660507Domain d1sfhb_: 1sfh B: [105487]
      complexed with cu1, na; mutant
  12. Domain(s) for 1t5k:
    1. 660512Domain d1t5ka_: 1t5k A: [106451]
    2. 660513Domain d1t5kb_: 1t5k B: [106452]
    3. 660514Domain d1t5kc_: 1t5k C: [106453]
    4. 660515Domain d1t5kd_: 1t5k D: [106454]
      complexed with co, po4
  13. Domain(s) for 2gc4:
    1. 660530Domain d2gc4c1: 2gc4 C:1-105 [134936]
      Other proteins in same PDB: d2gc4a1, d2gc4b1, d2gc4d1, d2gc4e1, d2gc4f1, d2gc4h1, d2gc4i1, d2gc4j1, d2gc4l1, d2gc4m1, d2gc4n1, d2gc4p1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, hem, na, trq
    2. 660531Domain d2gc4g1: 2gc4 G:1-105 [134940]
      Other proteins in same PDB: d2gc4a1, d2gc4b1, d2gc4d1, d2gc4e1, d2gc4f1, d2gc4h1, d2gc4i1, d2gc4j1, d2gc4l1, d2gc4m1, d2gc4n1, d2gc4p1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, hem, na, trq
    3. 660532Domain d2gc4k1: 2gc4 K:1-105 [134944]
      Other proteins in same PDB: d2gc4a1, d2gc4b1, d2gc4d1, d2gc4e1, d2gc4f1, d2gc4h1, d2gc4i1, d2gc4j1, d2gc4l1, d2gc4m1, d2gc4n1, d2gc4p1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, hem, na, trq
    4. 660533Domain d2gc4o1: 2gc4 O:1-105 [134948]
      Other proteins in same PDB: d2gc4a1, d2gc4b1, d2gc4d1, d2gc4e1, d2gc4f1, d2gc4h1, d2gc4i1, d2gc4j1, d2gc4l1, d2gc4m1, d2gc4n1, d2gc4p1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, hem, na, trq
  14. Domain(s) for 2gc7:
    1. 660517Domain d2gc7c1: 2gc7 C:1-105 [134956]
      Other proteins in same PDB: d2gc7a1, d2gc7b1, d2gc7d1, d2gc7e1, d2gc7f1, d2gc7h1, d2gc7i1, d2gc7j1, d2gc7l1, d2gc7m1, d2gc7n1, d2gc7p1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with hem, na, trq
    2. 660518Domain d2gc7g1: 2gc7 G:1-105 [134960]
      Other proteins in same PDB: d2gc7a1, d2gc7b1, d2gc7d1, d2gc7e1, d2gc7f1, d2gc7h1, d2gc7i1, d2gc7j1, d2gc7l1, d2gc7m1, d2gc7n1, d2gc7p1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with hem, na, trq
    3. 660519Domain d2gc7k1: 2gc7 K:1-105 [134964]
      Other proteins in same PDB: d2gc7a1, d2gc7b1, d2gc7d1, d2gc7e1, d2gc7f1, d2gc7h1, d2gc7i1, d2gc7j1, d2gc7l1, d2gc7m1, d2gc7n1, d2gc7p1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with hem, na, trq
    4. 660520Domain d2gc7o1: 2gc7 O:1-105 [134968]
      Other proteins in same PDB: d2gc7a1, d2gc7b1, d2gc7d1, d2gc7e1, d2gc7f1, d2gc7h1, d2gc7i1, d2gc7j1, d2gc7l1, d2gc7m1, d2gc7n1, d2gc7p1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with hem, na, trq
  15. Domain(s) for 2j55:
    1. 660528Domain d2j55a1: 2j55 A:1-105 [138013]
      Other proteins in same PDB: d2j55h1, d2j55j1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, gol, trq
    2. 660529Domain d2j55b1: 2j55 B:1-105 [138014]
      Other proteins in same PDB: d2j55h1, d2j55j1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, gol, trq
  16. Domain(s) for 2j56:
    1. 660522Domain d2j56a1: 2j56 A:1-105 [138017]
      Other proteins in same PDB: d2j56h1, d2j56j1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, gol, na, tqq
    2. 660523Domain d2j56b1: 2j56 B:1-105 [138018]
      Other proteins in same PDB: d2j56h1, d2j56j1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, gol, na, tqq
  17. Domain(s) for 2j57:
    1. 660524Domain d2j57a1: 2j57 A:1-105 [138021]
      Other proteins in same PDB: d2j57g1, d2j57h1, d2j57i1, d2j57j1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, tqq
    2. 660525Domain d2j57b1: 2j57 B:1-105 [138022]
      Other proteins in same PDB: d2j57g1, d2j57h1, d2j57i1, d2j57j1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, tqq
    3. 660526Domain d2j57c1: 2j57 C:1-105 [138023]
      Other proteins in same PDB: d2j57g1, d2j57h1, d2j57i1, d2j57j1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, tqq
    4. 660527Domain d2j57d1: 2j57 D:1-105 [138024]
      Other proteins in same PDB: d2j57g1, d2j57h1, d2j57i1, d2j57j1
      automatically matched to d1aac__
      complexed with cu, tqq
  18. Domain(s) for 2mta:
  19. Domain(s) for 2rac:

More info for Species Paracoccus denitrificans [TaxId:266] from b.6.1.1 Amicyanin

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